New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1643956 = | 47 (0.960) | 5 (0.100) | 5/256 | NT | 9.8% | coding (786/2418 nt) | lon‑I | DNA‑binding ATP‑dependent protease |
? | NC_002947 | 1644028 = | 46 (0.960) | coding (714/2418 nt) | lon‑I | DNA‑binding ATP‑dependent protease |
GCCCATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCACTTCCTGCAA > NC_002947/1643809‑1644102 | cgcttcagccccaacgacccttcgccgctcaccgacttcgccgccgcgctcacctcggccaccggcaatcagttgcaggaagtgctcgactgcgtgcccatgctcaaacgcatggaaaaggtactgccaatgctgcgcaaagaggtgg < 4:48393‑M1/1‑1 (MQ=255) cccATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGgaaga < 8:264732/148‑1 (MQ=255) cATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCt < 5:38475/147‑1 (MQ=255) cATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTg < 1:100052/148‑1 (MQ=255) gATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGgtgt > 1:302671/1‑148 (MQ=255) gCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCt > 5:213727/1‑149 (MQ=255) gctcaccgacttcgccgccgcgctcacctcggccaccggcaatcagttgcaggaagtgctcgactgcgtgcccatgctcaaacgcatggaaaaggtactgccaatgctgcgcaaagaggtgGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGc < 5:134410‑M1/28‑1 (MQ=255) gCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCg > 7:257517/1‑149 (MQ=255) cTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGt > 5:112248/1‑149 (MQ=255) gCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGtt > 1:215124/1‑148 (MQ=255) cAGGGTCTTGCGTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGATGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCgg < 5:21449/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCgg < 2:215124/149‑1 (MQ=255) cgccgcgctcacctcggccaccggcaatcagttgcaggaagtgctcgactgcgtgcccatgctcaaacgcatggaaaaggtactgccaatgctgcgcaaagaggtgGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGcc < 8:52514‑M1/43‑1 (MQ=255) tCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCga < 1:161279/149‑1 (MQ=255) tCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGcc > 4:273136/1‑146 (MQ=255) tGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGAtc > 7:126021/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGAtct > 5:159731/1‑149 (MQ=255) ccTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGAtctc < 2:306079/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCCGCCGAGATCTCg > 2:298095/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGtt < 7:27892/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGtt < 8:257517/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGTGCGAACTGGTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGGCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCt < 6:213727/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGc < 6:159731/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGc > 2:44468/1‑148 (MQ=255) gcTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAg > 1:20121/1‑149 (MQ=255) tGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTc > 2:50799/1‑149 (MQ=255) agttgcaggaagtgctcgactgcgtgcccatgctcaaacgcatggaaaaggtactgccaatgctgcgcaaagaggtgGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTc > 6:64545‑M1/78‑149 (MQ=255) gttgcaggaagtgctcgactgcgtgcccatgctcaaacgcatggaaaaggtactgccaatgctgcgcaaagaggtgGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTcc > 6:134410‑M1/77‑149 (MQ=255) ttCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTcc < 5:71491/148‑1 (MQ=255) tgcaggaagtgctcgactgcgtgcccatgctcaaacgcatggaaaaggtactgccaatgctgcgcaaagaggtgGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCa > 7:52514‑M1/75‑148 (MQ=255) tCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCTGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCAc > 5:158264/1‑149 (MQ=255) ctaGGTCGGCGCTGCGGTCGTCGTTGGTCAGCCCCTGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCAc < 2:302671/146‑1 (MQ=255) cTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCgcag < 3:273136/149‑1 (MQ=255) cTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCgcag < 6:150188/149‑1 (MQ=255) cTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGt < 6:112248/148‑1 (MQ=255) ggTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTAc < 1:44468/147‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACtt > 2:62265/1‑117 (MQ=255) tCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACtt < 1:62265/117‑1 (MQ=255) ccccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCa < 1:50799/149‑1 (MQ=255) ccccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCa > 2:162110/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATg > 5:121327/1‑149 (MQ=255) gCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGt < 1:33333/149‑1 (MQ=255) tGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAg > 8:37238/1‑149 (MQ=255) tGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTg > 8:124562/1‑111 (MQ=255) tGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTg < 7:124562/111‑1 (MQ=255) tGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCAt < 6:158264/149‑1 (MQ=255) ggATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATg < 8:126021/149‑1 (MQ=255) gATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCAt < 1:162110/147‑1 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACg > 4:276354/1‑147 (MQ=255) tGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAg > 1:110120/1‑149 (MQ=255) aGTTGTTCCTGGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGGTCG‑CCGATCTGCCGGTGGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTc < 8:178325/149‑1 (MQ=255) ttgttCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGTATGGGCACGCAGTc > 2:61909/1‑147 (MQ=255) gttCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAg > 7:34509/1‑148 (MQ=255) cTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCACt < 6:121327/148‑1 (MQ=255) ggAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCACTTCCTGc < 2:110120/149‑1 (MQ=255) gaagaaCTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCAGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCACTTCCTGc > 7:189632/1‑148 (MQ=255) aagaaCTCGCGCGTGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTGCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCACTTCCTGCaa < 8:267965/149‑1 (MQ=255) | GCCCATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCG‑CCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCACTTCCTGCAA > NC_002947/1643809‑1644102 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |