New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2071806 | 47 (0.960) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.5% | coding (1602/2133 nt) | PP_1847 | TonB‑dependent ferric siderophore receptor |
? | NC_002947 | = 2071852 | 58 (1.250) | coding (1556/2133 nt) | PP_1847 | TonB‑dependent ferric siderophore receptor |
CTGCAGATTCGGGGTTACCCGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCTTGGCGTAGCTGGCGT > NC_002947/2071674‑2071954 | cTGCAGATTCGGGGTTACCCGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCActcaggc > 6:62341/1‑149 (MQ=255) cTGCAGATTCGGGGTTACCCGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCActcaggc > 4:170512/1‑149 (MQ=255) tGCAGATTCGGGGTTACCCGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCa > 1:60936/1‑141 (MQ=255) tGCAGATTCGGGGTTACCCGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCa < 2:60936/141‑1 (MQ=255) aTTCGGGGTTACCCGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACtcaggctcaggc > 6:163415/1‑149 (MQ=255) cccGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTc < 4:285419/148‑1 (MQ=255) ccGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAGGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGt > 4:258114/1‑149 (MQ=255) ccGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGt > 3:96868/1‑149 (MQ=255) cccAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAg < 7:211633‑M2/149‑2 (MQ=255) ccAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAgt < 8:76471‑M2/149‑3 (MQ=255) aGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACtgggcgtcaagcacgactggcaaggcctgagcctgagtgccgccctgttc > 4:269826‑M1/1‑99 (MQ=255) aGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACtgggcgtcaagcacgactggcaaggcctgagcctgagtgccgccctgttc < 3:269826‑M1/149‑51 (MQ=255) ttCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACtcaggctcaggc > 6:31314/1‑119 (MQ=255) ttCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACtcaggctcaggc < 5:31314/119‑1 (MQ=255) cAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACtgggcgtcaagcacgactggcaaggcctgagcctgagtgccgccctgttccaga < 4:66108‑M1/148‑55 (MQ=255) aGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCtt > 7:78067/1‑118 (MQ=255) aGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCtt < 8:78067/118‑1 (MQ=255) ccGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAGGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCg < 3:258114/149‑1 (MQ=255) cGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCgg > 4:2359/1‑149 (MQ=255) ttctGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAggtggt > 1:123060/1‑149 (MQ=255) tgGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGgcg > 4:81135/1‑148 (MQ=255) gCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGgcgc > 2:52455/1‑147 (MQ=255) gCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCaa < 3:2359/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCaa < 3:170512/149‑1 (MQ=255) ttGCTGTACGTAGGTGGAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGATCAGGGCGGCACTCCGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGCCGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGGGGTGGTGGGCGCAAg > 6:305276/1‑147 (MQ=255) cTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGAtct > 3:63306/1‑149 (MQ=255) gTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTg < 4:63306/149‑1 (MQ=255) gTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCt > 7:223390/1‑144 (MQ=255) gTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCt < 8:223390/144‑1 (MQ=255) gTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTgg > 6:152096/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTgg < 1:289568/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGc > 2:165116/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAAcc < 3:81135/149‑1 (MQ=255) gTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAAcc > 4:200306/1‑148 (MQ=255) ccGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGTACCAAgg > 7:72272/1‑149 (MQ=255) gTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAgggg > 6:76909/1‑149 (MQ=255) gTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAgggg > 7:226796/1‑149 (MQ=255) gcgcgcGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGc > 6:40329/1‑149 (MQ=255) gcgcgTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCt > 3:45844/1‑149 (MQ=255) gTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAg > 1:205187/1‑105 (MQ=255) gTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAg < 2:205187/105‑1 (MQ=255) cTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCa < 3:200306/148‑1 (MQ=255) gTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGAtctc > 8:241017/1‑105 (MQ=255) gTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGAtctc < 7:241017/105‑1 (MQ=255) gTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGa > 3:18044/1‑147 (MQ=255) cTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCTTTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCt > 3:243931/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCt < 4:45844/149‑1 (MQ=255) tGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCtt > 7:189243/1‑149 (MQ=255) gCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCTTgg > 4:125391/1‑149 (MQ=255) ggATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTc < 8:516/129‑1 (MQ=255) ggATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTc > 7:516/1‑129 (MQ=255) ggATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCTTGGCg > 8:250251/1‑149 (MQ=255) tCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAgttccagatccgccaggcgtaccagtacgcgcgcccggacggcaccggcaacttcacctacgtacagcaaggccagcagaagaataccggcctg < 4:66108‑M2/148‑95 (MQ=255) ggAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCTTGGCGTAGCTg > 2:292050/1‑149 (MQ=255) ggAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCTTGGCGTAGCTg > 5:302717/1‑149 (MQ=255) gAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAgttccagatccgccaggcgtaccagtacgcgcgcccggacggcaccggcaacttcacctacgtacagcaaggccagcagaagaataccggcctggaact < 3:269826‑M2/149‑100 (MQ=255) gAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAgttccagatccgccaggcgtaccagtacgcgcgcccggacggcaccggcaacttcacctacgtacagcaaggccagcagaagaataccggcctggaact > 4:269826‑M2/1‑50 (MQ=255) aaCAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGTGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCTTGGCGTAGCTGGc < 1:52455/149‑1 (MQ=255) aCtgggcgtcaagcacgactggcaaggcctgagcctgagtgccgccctgttccagatccgccaggcgtaccagtacgcgcgcccggacggcaccggcaacttcacctacgtacagcaaggccagcagaagaataccggcctggaactgg < 8:76471‑M1/149‑148 (MQ=255) ctgggcgtcaagcacgactggcaaggcctgagcctgagtgccgccctgttccagatccgccaggcgtaccagtacgcgcgcccggacggcaccggcaacttcacctacgtacagcaaggccagcagaagaataccggcctggaactggg < 7:211633‑M1/149‑149 (MQ=255) | CTGCAGATTCGGGGTTACCCGGCCGCTGGCGCCCAGTTCCAGGCCGGTATTCTTCTGCTGGCCTTGCTGTACGTAGGTGAAGTTGCCGGTGCCGTCCGGGCGCGCGTACTGGTACGCCTGGCGGATCTGGAACAGGGCGGCACTCAGGCTCAGGCCTTGCCAGTCGTGCTTGACGCCCAGTTCCAGTTGGCGGGAGGTGGTGGGCGCAAGGATCTCAGCTGCATTGCTGGCGAACCAAGGGGCCGTGCCTCCGGCAGACAGGCCCTTGGCGTAGCTGGCGT > NC_002947/2071674‑2071954 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |