New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2131092 = | 60 (1.230) | 4 (0.090) | 4/250 | NT | 6.1% | coding (1107/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
? | NC_002947 | 2131132 = | 65 (1.390) | coding (1067/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
CCCAGGTCCTTGCTAAACCCCAGGTTGCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTC > NC_002947/2130946‑2131238 | gatctactcgacgtacgtcagcgccggcccctacgctatcgacgacctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctgc < 8:270875‑M1/2‑1 (MQ=255) cccAGGTCCTTGCTAAACCCCAGGTTGCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAgcg > 5:244008/1‑149 (MQ=255) actcgacgtacgtcagcgccggcccctacgccatcgacgacctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctGCGcc < 3:231813‑M1/5‑1 (MQ=255) aaCCCCAGGTTGCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACt < 3:167780/149‑1 (MQ=255) aCCCCAGGTTGCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTg > 3:245923/1‑149 (MQ=255) tcagcgccggcccctacgccatcgacgacctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctGCGCCCGACCGTGGCACTg < 4:22975‑M1/19‑1 (MQ=255) ccccAGGTTGCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGGAAGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTg > 1:238178/1‑149 (MQ=255) cccAGGTTGCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCCTCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTCCGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGGCGCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGt > 3:267007/1‑148 (MQ=255) ttGCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCa < 2:60464/149‑1 (MQ=255) tcccGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCTGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCTAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCGCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑t < 8:156342/147‑1 (MQ=255) gCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑t < 3:188197/148‑1 (MQ=255) cccGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑Ta < 6:244008/148‑1 (MQ=255) ccctacgccatcgacgacctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctgcgc > 5:299643‑M1/120‑123 (MQ=255) ccctacgccatcgacgacctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctgcgc < 6:299643‑M1/4‑1 (MQ=255) cgcgcgGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGc < 1:289037/149‑1 (MQ=255) gTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGc > 5:63554/1‑143 (MQ=255) gTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGc < 6:63554/143‑1 (MQ=255) atcgacgacctgagaaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGgcg > 7:71192‑M1/111‑149 (MQ=255) gacgacctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCgca > 3:22975‑M1/108‑148 (MQ=255) gCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGAt > 2:262007/1‑149 (MQ=255) cctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGAt > 4:272914‑M1/103‑149 (MQ=255) gCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCt > 4:65355/1‑149 (MQ=255) gCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCt > 2:84895/1‑149 (MQ=255) gCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCACTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTg < 6:141559/147‑1 (MQ=255) ccgccgTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTc > 1:168450/1‑147 (MQ=255) ccgccgTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGa < 4:245923/149‑1 (MQ=255) gTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACg < 3:65355/149‑1 (MQ=255) ccGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTgg < 2:168450/149‑1 (MQ=255) cGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGa > 3:109046/1‑149 (MQ=255) gtgg‑tgTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGAt < 1:262007/149‑1 (MQ=255) g‑tgtCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCATTACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGa < 1:213718/146‑1 (MQ=255) g‑tgtCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGa > 2:213718/1‑145 (MQ=255) gtCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgc > 7:189651/1‑149 (MQ=255) tCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTgg < 4:32102/141‑1 (MQ=255) tCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTgg > 3:32102/1‑141 (MQ=255) tCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcg > 4:200666/1‑149 (MQ=255) cccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcgg > 2:284486/1‑149 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGt < 7:27361/131‑1 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGt > 8:27361/1‑131 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcggc < 1:84895/149‑1 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcggc > 3:226733/1‑149 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcggc > 7:270875/1‑149 (MQ=255) tAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGCCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGAc > 1:18525/1‑149 (MQ=255) gAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTg > 5:305293/1‑149 (MQ=255) gAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTg < 6:305293/149‑1 (MQ=255) gAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTg < 1:284486/149‑1 (MQ=255) ccTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGc > 6:43166/1‑148 (MQ=255) cTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCa > 8:205541/1‑149 (MQ=255) cTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCa > 5:79628/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTTGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGc < 8:189651/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCa > 4:84614/1‑149 (MQ=255) gCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCacgac > 1:209224/1‑148 (MQ=255) ccAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCAcgacga < 2:209224/149‑1 (MQ=255) ccAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCAcgacga > 4:170768/1‑149 (MQ=255) cAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACgacgac > 6:189457/1‑149 (MQ=255) gcGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGc > 2:8694/1‑149 (MQ=255) gggTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCac < 7:135166/133‑1 (MQ=255) gggTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCac > 8:135166/1‑133 (MQ=255) gTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTcgcc < 6:79628/149‑1 (MQ=255) tctcGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTcgccg > 8:289827/1‑149 (MQ=255) gAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGctgc < 5:189457/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGctgcc < 3:84614/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCacgac > 4:296449/1‑126 (MQ=255) gTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCacgac < 3:296449/126‑1 (MQ=255) gCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCgg > 8:124918/1‑149 (MQ=255) gggAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCCCGGTAACGCCA‑TCCGCCTGGGCGCAGCCGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTa < 4:267007/148‑1 (MQ=255) gAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACt > 4:231813/1‑149 (MQ=255) gAGGGGATGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACt > 7:210071/1‑149 (MQ=255) gTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgt > 2:51626/1‑149 (MQ=255) gTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgtcgt > 2:41767/1‑149 (MQ=255) tAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgtcgt < 1:41767/148‑1 (MQ=255) aGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgtcgtc > 2:180635/1‑148 (MQ=255) | CCCAGGTCCTTGCTAAACCCCAGGTTGCCCGCGCGGTAGAATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGG‑TGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTC > NC_002947/2130946‑2131238 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |