| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2131092 = | 60 (1.230) | 4 (0.090) | 4/250 | NT | 6.1% | coding (1107/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
| ? | NC_002947 | 2131132 = | 65 (1.390) | coding (1067/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD | |||||
AATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGACGTACGTCGAGTAGATC > NC_002947/2130985‑2131278 | gacgacctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCgca > 3:22975‑M1/108‑148 (MQ=255) gCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGAt > 2:262007/1‑149 (MQ=255) cctgagtaccgcaggcagcggcgagctggaagtcgtcgtgaccgaggccgatggccaggtccgccgcttcatccagccgtactcgaccatgagcaatctgctGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGAt > 4:272914‑M1/103‑149 (MQ=255) gCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCt > 2:84895/1‑149 (MQ=255) gCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCt > 4:65355/1‑149 (MQ=255) gCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCACTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTg < 6:141559/147‑1 (MQ=255) ccgccgTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTc > 1:168450/1‑147 (MQ=255) ccgccgTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGa < 4:245923/149‑1 (MQ=255) gTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACg < 3:65355/149‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTgg < 2:168450/149‑1 (MQ=255) cGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGa > 3:109046/1‑149 (MQ=255) gtggtgTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGAt < 1:262007/149‑1 (MQ=255) gtgtCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCATTACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGa < 1:213718/146‑1 (MQ=255) gtgtCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGa > 2:213718/1‑145 (MQ=255) gtCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgc > 7:189651/1‑149 (MQ=255) tCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTgg > 3:32102/1‑141 (MQ=255) tCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTgg < 4:32102/141‑1 (MQ=255) tCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcg > 4:200666/1‑149 (MQ=255) cccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcgg > 2:284486/1‑149 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGt > 8:27361/1‑131 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGt < 7:27361/131‑1 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcggc < 1:84895/149‑1 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcggc > 3:226733/1‑149 (MQ=255) ccAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAgcggc > 7:270875/1‑149 (MQ=255) tAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGCCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGAc > 1:18525/1‑149 (MQ=255) gAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTg < 6:305293/149‑1 (MQ=255) gAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTg > 5:305293/1‑149 (MQ=255) gAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTg < 1:284486/149‑1 (MQ=255) ccTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGc > 6:43166/1‑148 (MQ=255) cTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCa > 5:79628/1‑149 (MQ=255) cTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCa > 8:205541/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTTGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGc < 8:189651/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCa > 4:84614/1‑149 (MQ=255) gCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCacgac > 1:209224/1‑148 (MQ=255) ccAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCAcgacga < 2:209224/149‑1 (MQ=255) ccAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCAcgacga > 4:170768/1‑149 (MQ=255) cAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACgacgac > 6:189457/1‑149 (MQ=255) gcGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGc > 2:8694/1‑149 (MQ=255) gggTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCac < 7:135166/133‑1 (MQ=255) gggTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCac > 8:135166/1‑133 (MQ=255) gTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTcgcc < 6:79628/149‑1 (MQ=255) tctcGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTcgccg > 8:289827/1‑149 (MQ=255) gAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGctgc < 5:189457/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGctgcc < 3:84614/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCacgac > 4:296449/1‑126 (MQ=255) gTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCacgac < 3:296449/126‑1 (MQ=255) gCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCgg > 8:124918/1‑149 (MQ=255) gggAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCCCGGTAACGCCA‑TCCGCCTGGGCGCAGC‑CGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTa < 4:267007/148‑1 (MQ=255) gAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACt > 4:231813/1‑149 (MQ=255) gAGGGGATGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACt > 7:210071/1‑149 (MQ=255) gTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgt > 2:51626/1‑149 (MQ=255) atctgctgcgcccaggcgtatggcgttacagtgccacggtcgggcgcAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAgg > 4:272914‑M2/48‑149 (MQ=255) gTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgtcgt > 2:41767/1‑149 (MQ=255) tAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgtcgt < 1:41767/148‑1 (MQ=255) aGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgtcgtc > 2:180635/1‑148 (MQ=255) tgcgcccaggcgtatggcgttacagtgccacggtcgggcgcAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGgtcgtc > 3:22975‑M2/42‑148 (MQ=255) CGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGCTAGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGa < 1:214747‑M1/149‑1 (MQ=255) cgcccaggcgtatggcgttacagtgccacggtcgggcgcAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTTCTCAGGTCGTCGAt > 7:71192‑M2/40‑149 (MQ=255) aCCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTa < 1:8694/149‑1 (MQ=255) cGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAgg > 2:36057/1‑149 (MQ=255) gTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAggg > 1:141503/1‑149 (MQ=255) tGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAgggg < 1:51626/149‑1 (MQ=255) aCTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCgg > 4:109366/1‑149 (MQ=255) tAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCt > 5:154791/1‑149 (MQ=255) accccA‑TACGCCTGGGCTCAGC‑AGATTGCTCATGGGCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTGCAGCTCGCGGGTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCTGCGGTg < 2:18525/145‑1 (MQ=255) aCGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGTACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTg < 4:109046/148‑1 (MQ=255) aCGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGa < 3:200666/149‑1 (MQ=255) cagtgccacggtcgggcgcAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGa < 4:22975‑M2/130‑1 (MQ=255) gCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCCGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGacg > 1:130905/1‑149 (MQ=255) ccA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGacgt < 4:226733/149‑1 (MQ=255) ccA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGacg > 6:202836/1‑148 (MQ=255) a‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGacgtac > 8:195383/1‑149 (MQ=255) cGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGACGTACGTc < 3:109366/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGACGTACGTCGAg > 2:142761/1‑149 (MQ=255) tGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGGCGATTACGGCTGGAGTAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGGCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGACGTACGTCGAGt < 8:210071/149‑1 (MQ=255) ggcgcAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGACGTACGTCGAGt < 3:231813‑M2/142‑1 (MQ=255) gcgcAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAggg < 6:299643‑M2/119‑1 (MQ=255) gcgcAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAggg > 5:299643‑M2/5‑123 (MQ=255) gcAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATAGCGTAGGGGCCGGCGCTGACGTACGTCGAGTAGATc < 8:270875‑M2/147‑1 (MQ=255) | AATTCGCTGGCCATCAAGCCGCCGTAAACCGTGGTGTCCCAGTAGGAGCCTACGGCCAGCGTGCCTTGCCAGAGCAGCGGGGTCTCGAGGTCGCTGGAGGGGTTGTAGCGCCCGACCGTGGCACTGTAACGCCA‑TACGCCTGGGCGCAGC‑AGATTGCTCATGGTCGAGTACGGCTGGATGAAGCGGCGGACCTGGCCATCGGCCTCGGTCACGACGACTTCCAGCTCGCCGCTGCCTGCGGTACTCAGGTCGTCGATGGCGTAGGGGCCGGCGCTGACGTACGTCGAGTAGATC > NC_002947/2130985‑2131278 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |