New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2404543 = | 66 (1.350) | 4 (0.080) | 3/254 | NT | 6.2% | coding (1170/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter |
? | NC_002947 | 2404578 = | 58 (1.220) | coding (1205/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter |
GCATGGGCGGTGTCAGCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGG > NC_002947/2404395‑2404690 | gCATGGGCGGTGTCAGCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGAc > 7:212478/1‑149 (MQ=255) aTGGGCGGTGTCAGCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCt > 5:227239/1‑149 (MQ=255) aTGGGCGGTGTCAGCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCt > 2:37138/1‑149 (MQ=255) acacagcctcggccacttcgcagaggtggcagccgagggtgccgaacagttgacattcaggcagcatgtggcaggtcccgggttggcatacacagaagcctattctaggcgcgccacgcccaccctgcacctgacctggctcaatCCTg < 7:227772‑M1/4‑1 (MQ=255) gCGGTGTCAGCCTGGTCAGACAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCAGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTAGTGAGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGACATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTc > 7:92437/1‑148 (MQ=255) tgtCAGCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTg < 5:58301/142‑1 (MQ=255) tgtCAGCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTg > 6:58301/1‑142 (MQ=255) gCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGTGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCg > 2:63511/1‑148 (MQ=255) gCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCg > 5:239176/1‑148 (MQ=255) cTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGAt > 5:151142/1‑149 (MQ=255) cTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGAt < 4:294214/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCgg > 7:5506/1‑149 (MQ=255) tCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGt > 4:158523/1‑149 (MQ=255) tCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGt < 6:227239/149‑1 (MQ=255) tCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGt < 2:220894/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTa > 2:87754/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCATGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCAAGTGCGCGGCCATGTCGCTGCACCGGATCTTTGCt > 7:107968/1‑148 (MQ=255) agaggtggcagccgagggtgccgaacagttgacattcaggcagcatgtggcaggtcccgggttggcatacacagaagcctattctaggcgcgccacgcccaccctgcacctgacctggctcaatCCTg < 6:186966‑M1/4‑1 (MQ=255) agaggtggcagccgagggtgccgaacagttgacattcaggcagcatgtggcaggtcccgggttggcatacacagaagcctattctaggcgcgccacgcccaccctgcacctgacctggctcaatCCTg > 5:186966‑M1/125‑128 (MQ=255) cAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTAc < 6:239176/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCTGGGCAGCCTGAGGGGCGTGCTGGTTGCCTGGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCTTTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGTAGTTCCAGGGCGCGGTCCTGTCGCTGCACCGATCCGGTGcagc < 4:53059/149‑4 (MQ=255) tGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTAccag < 6:310180/148‑1 (MQ=255) tGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTAccagccag > 3:121740/1‑149 (MQ=255) ggCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCgg < 3:38736/134‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCgg > 4:38736/1‑134 (MQ=255) gCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGAt < 6:151142/149‑1 (MQ=255) gCCTGATGGGCTTGCTTGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACTGAGCCATTCGTGAGCTGCATGGCGTGCGCTTGAGCCAAGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGa < 8:282066/149‑1 (MQ=255) gggtgccgaacagttgacattcaggcagcatgtggcaggtcccgggttggcatacacagaagcctattctaggcgcgccacgcccaccctgcacctgacctggctcaatCCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGa > 8:266570‑M1/110‑149 (MQ=255) ccTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAg < 1:37138/149‑1 (MQ=255) ccTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTAGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAg > 8:51539/1‑149 (MQ=255) ccTGATGGGCGTGCTGGGGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGACCCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGa < 1:87754/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCcaggtcagg > 7:133671/1‑149 (MQ=255) tggtggGCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGAGCTGCATGGCCTGGGGTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCa < 8:92437/149‑1 (MQ=255) ggtggCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAg > 6:118020/1‑149 (MQ=255) cattcaggcagcatgtggcaggtcccgggttggcatacacagaagcctattctaggcgcgccacgcccaccctgcacctgacctggctcaatCCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGa < 3:212731‑M1/40‑1 (MQ=255) cattcaggcagcatgtggcaggtcccgggttggcatacacagaagcctattctaggcgcgccacgcccaccctgcacctgacctggctcaatCCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGa > 4:212731‑M1/93‑132 (MQ=255) attcaggcagcatgtggcaggtcccgggttggcatacacagaagcctattctaggcgcgccacgcccaccctgcacctgacctggctcaatCCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGAtt < 8:20251‑M1/38‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTg > 8:181909/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCTAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTggg > 3:115137/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTggg > 7:190289/1‑149 (MQ=255) ccGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTgg < 8:133671/149‑1 (MQ=255) cGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGgc > 7:174680/1‑149 (MQ=255) gTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGgcgc < 8:174680/149‑1 (MQ=255) tgATTTGCCGTGTACGGAGCCATACGGGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGgcgcgc < 4:173903/148‑1 (MQ=255) gATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGcc > 6:14451/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCTCTGCACCGGATCGGTGCTAACAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCt < 1:294848/149‑1 (MQ=255) cGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGaa > 4:173133/1‑147 (MQ=255) cGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATa < 8:212478/149‑1 (MQ=255) gtgtACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAg > 5:301137/1‑149 (MQ=255) gtgtACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAg > 3:262650/1‑149 (MQ=255) tACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGc < 5:118020/148‑1 (MQ=255) tACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGc < 8:5506/148‑1 (MQ=255) tACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGc < 5:14451/148‑1 (MQ=255) cGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTc > 2:269766/1‑149 (MQ=255) ggAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCt > 4:39567/1‑149 (MQ=255) aTTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCACGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCAACGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCACGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTACAATAGGCTTCTgtgt > 4:149402/1‑147 (MQ=255) cGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGc < 3:158523/148‑1 (MQ=255) tGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCaa > 8:232277/1‑149 (MQ=255) tGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCgg > 6:73735/1‑149 (MQ=255) cATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCgg < 4:262650/147‑1 (MQ=255) cATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGa < 7:232277/149‑1 (MQ=255) cATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGa < 7:51539/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGAc > 2:258934/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTAAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCgggcc > 7:193858/1‑147 (MQ=255) gCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCCGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTg > 8:39956/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGc < 5:73735/149‑1 (MQ=255) cTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCcaggtcaggt > 6:187102/1‑90 (MQ=255) cTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCcaggtcaggt < 5:187102/90‑1 (MQ=255) cgcTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCcac < 6:301137/148‑1 (MQ=255) cTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAAc < 6:113468/132‑1 (MQ=255) cTTGAGCCATCA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAAc > 5:113468/1‑132 (MQ=255) ggCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACAtgctgc < 6:184689/148‑1 (MQ=255) aTGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTg > 5:138102/1‑148 (MQ=255) a‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGATGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAAt < 8:190289/148‑1 (MQ=255) ttCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGt > 6:199896/1‑149 (MQ=255) cccggCGCGGCCCTTTCTCTGCACCGGATCTGTGCTACCATCCATGTTTGAGCCATGTCATGTGCATGGTGGGCGTTGCTCGCCTAGTATAGGCTTCTGTTTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCg < 8:193858/146‑1 (MQ=255) aGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCgg < 4:121740/149‑1 (MQ=255) aGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCgg > 8:64396/1‑149 (MQ=255) ggACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTTTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTc > 8:63158/1‑149 (MQ=255) aCCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACt < 8:3878/134‑1 (MQ=255) aCCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACt > 7:3878/1‑134 (MQ=255) aCCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCgg > 7:279358/1‑149 (MQ=255) | GCATGGGCGGTGTCAGCCTGGTCAGCCAGTTGCTGGGCAGCCTGATGGGCGTGCTGGTGGCCTTGGCCGGTGGATTTGCCGTGTACGGAGCCATTCGTGCGCTGCATGGCCTGCGCTTGAGCCATGA‑GCAGGAGTTCCAGGGCGCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGG > NC_002947/2404395‑2404690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |