New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2881029 | 44 (0.900) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 7.4% | coding (871/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
? | NC_002947 | = 2881061 | 34 (0.740) | coding (903/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
GTGCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGA > NC_002947/2880888‑2881176 | gTGCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGAc > 7:227727/1‑149 (MQ=255) tGCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGAcc < 2:82549/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGAcc < 5:196811/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGc < 7:257077/149‑1 (MQ=255) cGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTg < 8:227727/148‑1 (MQ=255) cGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTg < 3:120198/148‑1 (MQ=255) tgtCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGa < 4:220058/149‑1 (MQ=255) ggCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCt > 3:174249/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTg > 4:165465/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTgggg > 2:4497/1‑149 (MQ=255) ggCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTg > 7:176391‑M2/1‑147 (MQ=255) gCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGTCCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTgcg > 8:15196‑M2/1‑146 (MQ=255) cGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCaccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggcca < 1:47824‑M1/149‑40 (MQ=255) cGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTggg < 8:148914/140‑1 (MQ=255) cGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTggg > 7:148914/1‑140 (MQ=255) gtgtGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTgcggccag < 4:60523‑M2/149‑9 (MQ=255) gggTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTgcggccag > 5:221380‑M2/1‑136 (MQ=255) gggTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTgcggccag < 6:221380‑M2/144‑9 (MQ=255) gggTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCAACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTg > 6:52993/1‑132 (MQ=255) gggTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCAACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTg < 5:52993/132‑1 (MQ=255) gCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCAGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTg < 7:1345/149‑1 (MQ=255) aaGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCaccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagt < 7:66806‑M1/138‑42 (MQ=255) aaGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCaccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagt > 8:66806‑M1/1‑97 (MQ=255) gACCGGTCGTTCGATCGCACTGTTCTGCTGTCACTGGCTGGGGTGATTGCCGTGGTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTTGACTGGCCGGTGCCGACCGCCTTGGCGTTCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCt < 3:208150/149‑1 (MQ=255) cGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGc > 2:281561/1‑148 (MQ=255) tcgCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCa > 1:152618/1‑149 (MQ=255) gCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATg < 3:165465/149‑1 (MQ=255) cACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTgg > 6:226997/1‑86 (MQ=255) cACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTgg < 5:226997/86‑1 (MQ=255) cACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATgg < 3:60523/149‑1 (MQ=255) aTCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGc > 4:293764/1‑149 (MQ=255) tCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGc < 3:293764/148‑1 (MQ=255) cTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGcc > 2:206704/1‑147 (MQ=255) tCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAgg < 1:281561/148‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGGCTGATTCCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCAGGGAAGCGGCCAAGGATg > 8:288612/1‑149 (MQ=255) gctgggctgATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTGGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGccc < 2:216811/148‑1 (MQ=255) gggctgATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATcc > 6:23455/1‑70 (MQ=255) gggctgATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATcc < 5:23455/70‑1 (MQ=255) ggctgATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGACCCCAAc > 5:79690/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCTCCCAACCTgg < 4:174249/148‑1 (MQ=255) aTTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGc > 7:262758/1‑149 (MQ=255) ccGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCctct > 6:168134/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTg > 2:281666/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTg > 3:53162/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGc < 1:281666/149‑1 (MQ=255) tgctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCgg < 5:248762/104‑1 (MQ=255) tgctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCgg > 6:248762/1‑104 (MQ=255) tgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGaa > 1:113496/1‑148 (MQ=255) tCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGgc < 6:79690/148‑1 (MQ=255) gCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGt < 5:168134/149‑1 (MQ=255) gactggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATgg > 6:6718/1‑88 (MQ=255) gactggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATgg < 5:6718/88‑1 (MQ=255) actggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTgcggccagtccagtaccagcggaaacaccagcagcacggcaatcagcccagccagtgacaggatcagagtgcgatcgatcgagcggtccgccgcctt < 7:66806‑M2/138‑98 (MQ=255) actggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTgcggccagtccagtaccagcggaaacaccagcagcacggcaatcagcccagccagtgacaggatcagagtgcgatcgatcgagcggtccgccgcctt > 8:66806‑M2/1‑41 (MQ=255) ctggCCGCaccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagtccagtaccagcggaaacaccagcagcacggcaatcagcccagccagtgacaggatcagagtgcgatcgatcgagcggtccgccgccttgccaccccacac < 4:60523‑M1/149‑142 (MQ=255) ctggCCGCaccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagtccagtaccagcggaaacaccagcagcacggcaatcagcccagccagtgacaggatcagagtgcgatcgatcgagcggtccgccgccttgccaccc < 6:221380‑M1/144‑137 (MQ=255) ctggCCGCaccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagtccagtaccagcggaaacaccagcagcacggcaatcagcccagccagtgacaggatcagagtgcgatcgatcgagcggtccgccgccttgccaccc > 5:221380‑M1/1‑8 (MQ=255) tggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTgcggccagtccagtaccagcggaaacaccagcagcacggcaatcagcccagccagtgacaggatcagagtgcgatcgatcgagcggtccgccgccttgccaccccacacg < 1:47824‑M2/149‑111 (MQ=255) cagCTGCCGACCGCGTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCATGGAGCCGCCGCAGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCAAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCACCCTGGGCAATGc > 2:190534/3‑149 (MQ=255) cGCaccccagaccaggatcgccaaggcggacggcagcggccagtccagtaccagcggaaacaccagcagcacggcaatcagcccagccagtgacaggatcagagtgcgatcgatcgagcggtccgccgccttgccaccccacacgttgc > 8:15196‑M1/1‑3 (MQ=255) caccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagtccagtaccagcggaaacaccagcagcacggcaatcagcccagccagtgacaggatcagagtgcgatcgatcgagcggtccgccgccttgccaccccacacgttgcc > 7:176391‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTGCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGA > NC_002947/2880888‑2881176 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |