New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3214112 = | 49 (1.000) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 8.4% | coding (27/3129 nt) | mexD | multidrug RND transporter MexD |
? | NC_002947 | 3214140 = | 40 (0.840) | coding (55/3129 nt) | mexD | multidrug RND transporter MexD |
CGAGGGGCTGGAGCCGGGCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGGCGCTTCGGCCAAGGTCATGG > NC_002947/3213965‑3214257 | cGAGGGGCTGGAGGCGGGCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGa < 4:76623/149‑1 (MQ=255) gAGGGGCTGGAGCCGGGCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGaa > 1:286097/1‑149 (MQ=255) gAGGGGCTGGAGCCGGGCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGT‑CAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAAc > 1:301591/1‑149 (MQ=255) ttcgatgatgctggtcaccgactccaccatgaccttggccgaagcgccggggtaggaggcggtgatggagatctgcggtggcgccacgttggggtactgggccacgggcaaggatggaatcaccagcaaaccggccagtgaaatGAAc < 7:4708‑M1/4‑1 (MQ=255) gAGCCGGGCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGcc < 4:268826/147‑1 (MQ=255) aGCCGGGCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGT‑CAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTggg < 2:301591/149‑1 (MQ=255) ccGGGCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGt > 5:283414/1‑149 (MQ=255) gggCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGATGATGGGGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTgg > 1:102777/1‑149 (MQ=255) cgacGATCACCTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCg > 5:46587/4‑149 (MQ=255) aTCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCg < 6:283414/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCg < 8:86167/149‑1 (MQ=255) aGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GGGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCgttg < 6:270967/149‑1 (MQ=255) aGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCCGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCgatg > 8:134678/1‑149 (MQ=255) ggTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTgg < 7:170373/136‑1 (MQ=255) ggTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTgg > 8:170373/1‑136 (MQ=255) gtcgGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCAttt < 2:95575/148‑1 (MQ=255) tcgGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCa < 5:110367/149‑1 (MQ=255) cAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTgg > 5:58625/1‑149 (MQ=255) ccGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGACCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAAATTCGCCTGGGTCGTGGCGTTTTTAATTTCACTGGACGGt > 7:211718/1‑149 (MQ=255) ggTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCAAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTg > 1:88492/1‑149 (MQ=255) ggCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGc > 2:1380/1‑143 (MQ=255) ggCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGc < 1:1380/143‑1 (MQ=255) gccggggtaggaggcggtgatggagatctgcggtggcgccacgttggggtactgggccacgggcaaggatggaatcaccagcaaaccggccagtgaaatGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTg > 1:107804‑M1/100‑136 (MQ=255) gccggggtaggaggcggtgatggagatctgcggtggcgccacgttggggtactgggccacgggcaaggatggaatcaccagcaaaccggccagtgaaatGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTg < 2:107804‑M1/37‑1 (MQ=255) ccGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAAc > 3:276675/1‑95 (MQ=255) ccGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAAc < 4:276675/95‑1 (MQ=255) cGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCAt < 3:206025/149‑1 (MQ=255) ggTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAATCAATCGTCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGGCGGTTTGCTGGTGATTCCATc < 2:286097/149‑1 (MQ=255) cccGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATcc < 4:32488/144‑1 (MQ=255) cccGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCtagat > 3:32488/1‑145 (MQ=255) ccGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGccc < 2:88492/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGt > 3:280965/1‑120 (MQ=255) gcgcCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGt < 4:280965/120‑1 (MQ=255) gcgcCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTgg < 2:102777/148‑1 (MQ=255) cgcCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGcc < 6:58625/149‑1 (MQ=255) gcCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGcc > 5:113347/1‑148 (MQ=255) cTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTg > 8:185238/1‑125 (MQ=255) cTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTg < 7:185238/125‑1 (MQ=255) gcAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTgg > 2:77470/1‑119 (MQ=255) gcAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTgg < 1:77470/119‑1 (MQ=255) aGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCCAGATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCAGTGGCCGGTTTGATGGTGATTCCATCCTTGCCCTTGGCCCAGTccc > 1:242372/1‑149 (MQ=255) aGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTAccc > 7:228088/1‑148 (MQ=255) acGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGgc < 4:80377/149‑1 (MQ=255) tGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCAc > 2:98315/1‑149 (MQ=255) cccAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCTGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAg < 8:228088/149‑1 (MQ=255) cccAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCa < 6:94928/143‑1 (MQ=255) cccAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCa > 5:94928/1‑143 (MQ=255) tGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGAtctc < 6:46587/149‑1 (MQ=255) aGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCAcc > 2:63749/1‑149 (MQ=255) ggcaaggatggaatcaccagcaaaccggccagtgaaatGAACAACGCCACGACCCAGGCGAAGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACg > 4:213960‑M1/39‑124 (MQ=255) ggcaaggatggaatcaccagcaaaccggccagtgaaatGAACAACGCCACGACCCAGGCGAAGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACg < 3:213960‑M1/86‑1 (MQ=255) a‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGcctc < 1:63749/149‑1 (MQ=255) cAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGgcg > 3:285592/1‑149 (MQ=255) ttcttcATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGGCGCTTc > 7:30219/1‑149 (MQ=255) atcc‑‑atcGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCtt < 7:83621/74‑1 (MQ=255) atcc‑‑atcGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCtt > 8:83621/1‑74 (MQ=255) atcc‑‑atcGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGGCGCTTCGGCCaa < 6:113347/149‑1 (MQ=255) tcc‑‑atcGCCCGTACTTGGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGGCGCTTCGGCCAAg < 7:134678/149‑1 (MQ=255) tcc‑‑atcGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGGCGCTTCGGCCAAg > 7:217820/1‑149 (MQ=255) gCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGTTTGTATCCTTGCTGTTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGGCGCTTCGGCCAAGGTCAt < 1:98315/148‑1 (MQ=255) cccGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGGCGCTTCGGCCAAGGTCAtgg < 1:88882/149‑1 (MQ=255) | CGAGGGGCTGGAGCCGGGCGATCAGGTGATCGTCGGCAGCCCCGCAGGGTTGGCCCCCGGTATGCCCGTTGCGCCTGCGCAGAAACAAACGGCTGCCGCCCAGTGATGCGAGGGA‑‑A‑‑GTGAGATGTCCAGGTTCTTCATCC‑‑ATCGCCCGAACTTCGCCTGGGTCGTGGCGTTGTTCATTTCACTGGCCGGTTTGCTGGTGATTCCATCCTTGCCCGTGGCCCAGTACCCCAACGTGGCGCCACCGCAGATCTCCATCACCGCCTCCTACCCCGGCGCTTCGGCCAAGGTCATGG > NC_002947/3213965‑3214257 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |