New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3439660 = | 50 (1.020) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.9% | coding (582/1167 nt) | PP_3059 | tail sheath protein |
? | NC_002947 | 3439697 = | 48 (1.040) | coding (619/1167 nt) | PP_3059 | tail sheath protein |
CGCGCTGGCCGGCAAGTTGCGCGCCGTGGCCATCATCGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCGGCACCACCCGTTCGGTCGAGTTCCTGGACGGCGA > NC_002947/3439513‑3439806 | tattggcgttattgagcaggttggcccggcaggtgtcgtcgccgtccaggaactcgaccgaacgggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggcct > 3:242612‑M1/149‑149 (MQ=255) tattggcgttattgagcaggttggcccggcaggtgtcgtcgccgtccaggaactcgaccgaacgggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggcct > 7:267283‑M1/149‑149 (MQ=255) attggcgttattgagcaggttggcccggcaggtgtcgtcgccgtccaggaactcgaccgaacgggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggcct > 8:21270‑M1/148‑148 (MQ=255) gttattgagcaggttggcccggcaggtgtcgtcgccgtccaggaactcgaccgaacgggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggccTGCCAcc < 6:182480‑M1/7‑1 (MQ=255) gttattgagcaggttggcccggcaggtgtcgtcgccgtccaggaactcgaccgaacgggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggccTGCCAcc < 6:32161‑M1/7‑1 (MQ=255) cGGCAAGTTGCGCGCCGTGGCCATCATCGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCg < 8:238533/149‑1 (MQ=255) cAAGTTGCGCGCCGTGGCCATCATCGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGCCGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGAt > 4:4747/1‑148 (MQ=255) gTTGCGCGCCGTGGCCATCATCGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCAACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGc > 2:130751/1‑149 (MQ=255) gcgcCGTGGCCATCATCGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGc > 8:240867/1‑149 (MQ=255) ggCCATCATCGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCt > 8:239786/1‑149 (MQ=255) ccATCATGGACGGCCCCGGTACCACCTAGGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAATCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACGCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTgg < 7:58772/149‑1 (MQ=255) catcatCGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTTCAGCAGTGGGCCACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCATCCGGGCTCGGCCTggg > 4:189196/1‑149 (MQ=255) atcGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCAGGGTga > 4:243257/1‑147 (MQ=255) tcGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGc < 3:38036/148‑1 (MQ=255) cgccgtccaggaactcgaccgaacgggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggccTGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAg > 7:216339‑M1/110‑147 (MQ=255) cccGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGc > 7:177431/1‑131 (MQ=255) cccGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGc < 8:177431/131‑1 (MQ=255) ccGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGtt > 4:30774/1‑148 (MQ=255) ccGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGtt < 3:30774/148‑1 (MQ=255) gTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGCTCAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGc > 1:188825/1‑149 (MQ=255) ctccGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGa < 8:41449/147‑1 (MQ=255) caccGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCg > 3:42554/1‑115 (MQ=255) caccGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCg < 4:42554/115‑1 (MQ=255) caccGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGa > 5:241659/1‑149 (MQ=255) accGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCAACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGAc < 1:130751/149‑1 (MQ=255) tcgaccgaacgggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggccTGCCAcc < 8:113761‑M1/7‑1 (MQ=255) tcgaccgaacgggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggccTGCCAcc > 7:113761‑M1/96‑102 (MQ=255) ggCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCg < 6:241659/149‑1 (MQ=255) gCCTCGACGACCTACTC‑CAAAAACTTCTGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGTTGTGCAGCAGTGGGACACCAGCGCCAATGCCACCGTCGATGAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCg < 2:50063/148‑1 (MQ=255) gggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggccTGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCt < 1:281543‑M1/50‑1 (MQ=255) gggtggtgccggtgatgccgacgaactccttgttggaaggcgaggcccagaaaccgtattcggtgtcagtccaggcaaacaggccTGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCt > 2:281543‑M1/86‑135 (MQ=255) cgcgACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAAt < 3:4747/149‑1 (MQ=255) cTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCt > 1:249013/1‑149 (MQ=255) tACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTgg > 3:298496/1‑126 (MQ=255) tACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTgg < 4:298496/126‑1 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGTGAGTGCAGCAGTGCGACACCAACTCCAATGCCACCGTCGATAAGAAGTTCTCGGCCTGGGTGGCAGGCATGTATGCCAGGACTGACACCGAATACGGTATCTGTGCCTc > 5:203028/1‑149 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCg > 5:166176/1‑87 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCg < 6:166176/87‑1 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGtt > 1:186140/1‑113 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGtt < 2:186140/113‑1 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTga > 4:98506/1‑115 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACGGAATACGGTTTCTGGGCCTc > 8:246716/1‑149 (MQ=255) aaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGTCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCg < 7:240867/149‑1 (MQ=255) aaaaCTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCCATCAGCAGGGCTCGGCATAGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCg > 1:98535/1‑149 (MQ=255) ttCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTc > 6:71323/1‑149 (MQ=255) cGGCTCCAAACGCCTGTACATGTTCGACCGTTGTGTGCAGGAGTGGTACACCACCGCCAATGCCACAGTCTATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTTGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGAGACCTAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTca < 6:203028/148‑2 (MQ=255) cTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCcaac > 8:218191/1‑148 (MQ=255) cTCCAAACGCCTGTACATGATCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCcaac > 1:206775/1‑148 (MQ=255) aaCGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGACAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAg < 3:243257/149‑1 (MQ=255) cGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGAGACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGtt > 5:262793/1‑149 (MQ=255) cATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGc < 7:239786/148‑1 (MQ=255) gTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCAc > 5:87242/1‑149 (MQ=255) gTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCAc > 5:32161/1‑149 (MQ=255) gACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCgg > 2:79369/1‑149 (MQ=255) ccGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACgg < 1:123924/101‑1 (MQ=255) ccGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACgg > 2:123924/1‑101 (MQ=255) gcagcaGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCGGCACCACCCGtt > 4:202141/1‑149 (MQ=255) agTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCGGCACCACCCGTTCGGTc < 2:206775/149‑1 (MQ=255) gACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCGGCACCACCCGTTCGGTCGAGtt > 5:182480/1‑149 (MQ=255) caccGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCGGCACCACCCGTTCGGTCGAGTTCCTg > 1:42429/1‑148 (MQ=255) aaTGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCGGCACCACCCGTTCGGTCGAGTTCCTGGACGGcga < 2:188825/149‑1 (MQ=255) aaTGCCACCGGCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCGGCACCACCCGTTCGGTCGAGTTCCTGGACGGcga < 2:249013/149‑1 (MQ=255) | CGCGCTGGCCGGCAAGTTGCGCGCCGTGGCCATCATCGACGGCCCCGGTACCACCGATGAGGCCGCGACGACCTACGC‑CAAAAACTTCGGCTCCAAACGCCTGTACATGGTCGACCCGGGTGTGCAGCAGTGGGACACCACCGCCAATGCCACCGTCGATCAGCCGGGCTCGGCCTGGGTGGCAGGCCTGTTTGCCTGGACTGACACCGAATACGGTTTCTGGGCCTCGCCTTCCAACAAGGAGTTCGTCGGCATCACCGGCACCACCCGTTCGGTCGAGTTCCTGGACGGCGA > NC_002947/3439513‑3439806 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |