New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3656110 = | 37 (0.760) | 4 (0.090) | 4/246 | NT | 10.2% | coding (283/1620 nt) | PP_3220 | ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 3656175 = | 36 (0.780) | coding (218/1620 nt) | PP_3220 | ABC transporter ATP‑binding protein |
AGGCCGACCTGGTCCAGCAGCGCCAGCACCTTGGCCTCTTGGCCTGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGGCCAGGGTCGATTTGCCCGAGC > NC_002947/3655965‑3656256 | ccctgcgccagctgtcgttcagcctggtccagggcgagaccctggcggtggtgggcgagtcaggctcgggcaaatcgaccctggccaacgccctgcttggtctgttgccgggcaatgcacgcatcgaccaaggccagttatgggtCGAt < 5:188095‑M1/4‑1 (MQ=255) ccctgcgccagctgtcgttcagcctggtccagggcgagaccctggcggtggtgggcgagtcaggctcgggcaaatcgaccctggccaacgccctgcttggtctgttgccgggcaatgcacgcatcgaccaaggccagttatgggtCGAt > 4:82149‑M1/146‑149 (MQ=255) ggCCGACCTGGTCCAGCAGCGCCAGCACCTTGGCCTCTTGGCCTGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATg < 6:129023/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGCAGCGCCAGCACCTTGGCCTCTTGGCCTGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCcg > 5:242075/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCAGCGCCAGCACCTTGGCCTCTTGGCCTGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCcgc > 8:219666/1‑149 (MQ=255) gcagcGCCAGCACCTTGGCCTCTTGGCCTGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTCGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAAc < 4:296127/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCACCTTGGCCTCTTGGCCTGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAActggc < 2:143019/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCTCTTGGCCTGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAActggcgcctggcg < 4:11440/149‑1 (MQ=255) ggcctcttggcctGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGtt > 8:67842/1‑149 (MQ=255) gcgagaccctggcggtggtgggcgagtcaggctcgggcaaatcgaccctggccaacgccctgcttggtctgttgccgggcaatgcacgcatcgaccaaggccagttatgggtCGATg > 8:81729‑M1/113‑117 (MQ=255) gcgagaccctggcggtggtgggcgagtcaggctcgggcaaatcgaccctggccaacgccctgcttggtctgttgccgggcaatgcacgcatcgaccaaggccagttatgggtCGATg < 7:81729‑M1/5‑1 (MQ=255) ctcttggcctGGATAGCGTCGTCCAAGCGCAAGCTGCAGAGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATACTTTGGGTTGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTATTTAGGCACAAGGACGATGGTGCTCCCGC‑‑GCAAATGGCGCCTGGAGCGTTCGc > 8:174960/1‑149 (MQ=255) cctggcggtggtgggcgagtcaggctcgggcaaatcgaccctggccaacgccctgcttggtctgttgccgggcaatgcacgcatcgaccaaggccagttatgggtCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCt < 8:282024‑M1/44‑1 (MQ=255) gcctGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCtt > 1:20332/1‑149 (MQ=255) ctGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTgc > 7:281245/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATc > 3:236928/1‑148 (MQ=255) tcgtcCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGa > 1:109857/1‑149 (MQ=255) gtcCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGaca < 6:242075/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTGGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACAGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGa < 2:17810/149‑1 (MQ=255) gctcgggcaaatcgaccctggccaacgccctgcttggtctgttgccgggcaatgcacgcatcgaccaaggccagttatgggtCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGAc > 7:282024‑M1/83‑149 (MQ=255) tcgggcaaatcgaccctggccaacgccctgcttggtctgttgccgggcaatgcacgcatcgaccaaggccagttatgggtCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGAcc < 2:180879‑M1/68‑1 (MQ=255) gggcaaatcgaccctggccaacgccctgcttggtctgttgccgggcaatgcacgcatcgaccaaggccagttatgggtCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGAccc > 1:180879‑M1/79‑147 (MQ=255) gCTGCAGCGCCTCGGCGATATGCTGGCCGATCCGTTGGGGGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGAGGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCAt < 8:143132/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCAt > 8:108240/1‑148 (MQ=255) cGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGt > 8:241520/1‑73 (MQ=255) cGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGt < 7:241520/73‑1 (MQ=255) ggCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTCGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGt < 8:281245/149‑1 (MQ=255) tttGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATg < 3:272641/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGc < 7:67842/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGt < 2:20332/148‑1 (MQ=255) tGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGcc < 2:94279/56‑1 (MQ=255) gCCGATCCGTTCGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTAGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGTTCGATGCGTGCa < 6:229098/148‑1 (MQ=255) cGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTg < 7:108240/149‑1 (MQ=255) cGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGccaaa > 3:207782/1‑146 (MQ=255) gTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGCGGGCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCg > 1:242537/1‑149 (MQ=255) gggtgggGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCaa < 7:219666/148‑1 (MQ=255) ggtgggGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCaa > 2:74405/1‑147 (MQ=255) gggTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCAACAGAcc < 1:74405/149‑1 (MQ=255) gAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCAACAGACCAAg > 4:242376/1‑147 (MQ=255) gCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGt > 4:24071/1‑113 (MQ=255) gCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGt < 3:24071/113‑1 (MQ=255) ggTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGGCCAgg > 6:188095/1‑149 (MQ=255) ggTCTTGCGGCACCAGGCCGAGGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGGGCATTGCCCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGGCCAgg < 4:236928/149‑1 (MQ=255) gTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGGCCAggg > 5:104659/1‑149 (MQ=255) cGGGACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCATCTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGGCCAGGGTCGAt < 2:242537/148‑1 (MQ=255) ggCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCTCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGGCCAGGGTCGAttt < 2:109857/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGGCCAGGGTCGATTTGcc > 6:231244/1‑149 (MQ=255) gCCGATGGTGCGACCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCTTGCATTGCCCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGTCCAGGTTCGATTTGCCCGAGc < 7:174960/149‑1 (MQ=255) | AGGCCGACCTGGTCCAGCAGCGCCAGCACCTTGGCCTCTTGGCCTGGATAGCGTCGTCCACGCGCCAGCTGCAGCGCCTCGGCGATTTGCTGGCCGATCCGTTGGGTGGGGTTGAGGCTGACCATTGGGTCTTGCGGCACCAGGCCGATGGTGCGCCCGC‑‑GCAACTGGCGCCTGGCGCGTTCGCTGGCTTGCGCCATATCGACACCATCGACCCATAACTGGCCTTGGTCGATGCGTGCATTGCCCGGCAACAGACCAAGCAGGGCGTTGGCCAGGGTCGATTTGCCCGAGC > NC_002947/3655965‑3656256 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |