New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3693334 | 49 (1.000) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 6.2% | coding (292/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
? | NC_002947 | = 3693379 | 44 (0.940) | coding (247/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
ATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAAC > NC_002947/3693188‑3693482 | aTCCTAGGCAGTAATCAGCTCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCcg < 8:288974/148‑1 (MQ=255) tCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCcgtc < 4:81239/149‑1 (MQ=255) aGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgt > 3:269797/1‑149 (MQ=255) gTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtg < 8:107593/149‑1 (MQ=255) aTCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtggtg > 7:105111/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGtgc > 6:98676/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTg < 1:170228/140‑1 (MQ=255) cAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTg > 2:170228/1‑139 (MQ=255) gcgcgcGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGtgcgct > 4:212049/1‑149 (MQ=255) cgatcgatCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGcgcc < 1:273662/149‑1 (MQ=255) tcgatcTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCa < 8:64118/149‑1 (MQ=255) tcTGCAAGGCACCGGAACACAAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCttggcgatcctggcggaatgcggcgcagcg > 4:97063‑M1/1‑118 (MQ=255) cAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGc < 3:180293/147‑1 (MQ=255) cAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCa < 3:18902/149‑1 (MQ=255) cAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACATCGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCCTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTACGc > 8:101713/1‑147 (MQ=255) aGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAgg < 5:144546/149‑1 (MQ=255) ggCACCGGAACACCTGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGa < 8:247693/149‑1 (MQ=255) gAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGcc > 7:212719/1‑147 (MQ=255) aaCACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAg > 8:220591‑M2/1‑148 (MQ=255) cAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAggcatc > 1:125265‑M2/1‑143 (MQ=255) aGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCg > 4:82528/1‑149 (MQ=255) ccTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCttggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggg < 1:303861‑M1/149‑56 (MQ=255) cTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTAt > 5:127578/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCTTCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCttggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgt < 3:97063‑M1/149‑62 (MQ=255) ccGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCt > 7:129841/1‑148 (MQ=255) cGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCa < 5:98676/149‑1 (MQ=255) gTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCAt < 8:129841/149‑1 (MQ=255) ttGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGtt > 6:301023/1‑89 (MQ=255) ttGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGtt < 5:301023/89‑1 (MQ=255) tGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCa > 4:12944/1‑146 (MQ=255) gaCGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGc < 5:267359/149‑1 (MQ=255) gCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTc < 4:183637/139‑1 (MQ=255) gCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTc > 3:183637/1‑139 (MQ=255) gCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTg < 6:176726/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGc < 8:105111/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGt < 6:127578/148‑1 (MQ=255) gTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGt < 7:49846/148‑1 (MQ=255) tCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGc < 4:269797/149‑1 (MQ=255) gcgcgcTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTca > 5:52541/1‑148 (MQ=255) gcgcTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAg < 8:287234/142‑1 (MQ=255) gcgcTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAg > 7:287234/1‑142 (MQ=255) tgtgATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCgg > 3:22822/1‑149 (MQ=255) tgATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGc < 3:184916/148‑1 (MQ=255) ccGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGcc > 1:26416/1‑148 (MQ=255) gggTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGc < 3:12944/148‑1 (MQ=255) gCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGa < 6:52541/149‑1 (MQ=255) tctG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACg > 1:164397/1‑149 (MQ=255) gccCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCCCCCGTGCCAAGGTCTGCCCGCGACGAAAgtt > 8:277080/1‑147 (MQ=255) cccACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGgtg < 4:22822/149‑1 (MQ=255) cccACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGAATACCCCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATCGCCCTCATAGATCTTGGCCAGTGCCATGTCACAGCCGGCCACCCGAGCAAAGGTCTGACAGCGACGCAAGgtg > 4:275569/1‑149 (MQ=255) ccACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGgtgt > 3:150564/1‑149 (MQ=255) cacaCGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGtt > 2:36015/1‑149 (MQ=255) acacGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgaagcgcgggtccacatcacagcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggca < 3:97063‑M2/149‑89 (MQ=255) acacGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATAGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGttg < 3:82528/149‑1 (MQ=255) acacGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTACGCCAGGATCGCCAACGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCAGCCAGCGACGCAAGGTGttg > 2:301986/1‑149 (MQ=255) cacGCCCCAGATGCCGTCGTTTGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGttgc < 3:275569/149‑1 (MQ=255) cccAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcacagcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggcaccaagg < 1:303861‑M2/149‑95 (MQ=255) gATGCCttggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcacagcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggcaccaaggcctg > 1:125265‑M1/1‑6 (MQ=255) gATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCg < 8:212719/149‑1 (MQ=255) cttggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcacagcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggcaccaaggcctggtgtt > 8:220591‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAAC > NC_002947/3693188‑3693482 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |