New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3693334 | 49 (1.000) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 6.2% | coding (292/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
? | NC_002947 | = 3693379 | 44 (0.940) | coding (247/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
AACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAGGTGATCAGCTTGCAGCGCCTGGATCAGT > NC_002947/3693232‑3693524 | aaCACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAg > 8:220591‑M2/1‑148 (MQ=255) cAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAggcatc > 1:125265‑M2/1‑143 (MQ=255) aGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCg > 4:82528/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTAt > 5:127578/1‑149 (MQ=255) ccGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCt > 7:129841/1‑148 (MQ=255) cGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCa < 5:98676/149‑1 (MQ=255) gTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCAt < 8:129841/149‑1 (MQ=255) tGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCa > 4:12944/1‑146 (MQ=255) gaCGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGc < 5:267359/149‑1 (MQ=255) gCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTc < 4:183637/139‑1 (MQ=255) gCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTc > 3:183637/1‑139 (MQ=255) gCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTg < 6:176726/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGc < 8:105111/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGt < 7:49846/148‑1 (MQ=255) gTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGt < 6:127578/148‑1 (MQ=255) tCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGc < 4:269797/149‑1 (MQ=255) gcgcgcTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTca > 5:52541/1‑148 (MQ=255) gcgcTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAg > 7:287234/1‑142 (MQ=255) gcgcTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAg < 8:287234/142‑1 (MQ=255) tgtgATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCgg > 3:22822/1‑149 (MQ=255) tgATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGc < 3:184916/148‑1 (MQ=255) ccGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGcc > 1:26416/1‑148 (MQ=255) gggTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGc < 3:12944/148‑1 (MQ=255) gCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGa < 6:52541/149‑1 (MQ=255) tctGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACg > 1:164397/1‑149 (MQ=255) gccCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCCCCCGTGCCAAGGTCTGCCCGCGACGAAAgtt > 8:277080/1‑147 (MQ=255) cccACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGgtg < 4:22822/149‑1 (MQ=255) cccACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGAATACCCCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATCGCCCTCATAGATCTTGGCCAGTGCCATGTCACAGCCGGCCACCCGAGCAAAGGTCTGACAGCGACGCAAGgtg > 4:275569/1‑149 (MQ=255) ccACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGgtgt > 3:150564/1‑149 (MQ=255) cacaCGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGtt > 2:36015/1‑149 (MQ=255) acacGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgaagcgcgggtccacatcacagcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggca < 3:97063‑M2/149‑89 (MQ=255) acacGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATAGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGttg < 3:82528/149‑1 (MQ=255) acacGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTACGCCAGGATCGCCAACGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCAGCCAGCGACGCAAGGTGttg > 2:301986/1‑149 (MQ=255) cacGCCCCAGATGCCGTCGTTTGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGttgc < 3:275569/149‑1 (MQ=255) cccAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcacagcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggcaccaagg < 1:303861‑M2/149‑95 (MQ=255) gATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCg < 8:212719/149‑1 (MQ=255) tcgtTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACgg < 2:164397/149‑1 (MQ=255) gtTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACgg > 8:115729/1‑147 (MQ=255) ttGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAg > 7:280577/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑Ag > 5:269520/1‑149 (MQ=255) tgcgctgcgcCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAg > 4:56873/1‑149 (MQ=255) tgcgctgcgcCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAg < 4:150564/149‑1 (MQ=255) cgctgcgcCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcacagcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggcaccaaggccttgtgttccggtgccttgcaga > 4:97063‑M2/1‑30 (MQ=255) ctgcgcCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAGGTGa > 4:101741/1‑149 (MQ=255) tgcgcCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAGGTGAt > 3:54945/1‑149 (MQ=255) cgcATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGttgccttg < 6:139509/115‑1 (MQ=255) cgcATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGttgccttg > 5:139509/1‑115 (MQ=255) ttCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAGGTGATCAGCTTGCa < 8:280577/149‑1 (MQ=255) aGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑TCGTCGAGGTGAGCAGCTTGCAGCGCCTg > 4:208392/1‑149 (MQ=255) tCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGCAAGGTCGAGGTGATCAGCTTGCAGCGCCTGGAt < 1:36015/149‑1 (MQ=255) tCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAGGTGATCAGCTTGCAGCGCCTGGATc < 6:269520/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAGGTGATCAGCTTGCAGCGCCTGGATCAGt > 1:187087/1‑149 (MQ=255) | AACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGGCCACCCGTGCCAAGGTCTGCCAGCGACGCAAGGTGTTGCCTTGCCCCGGCAACGGTAGC‑AGGTCGAGGTGATCAGCTTGCAGCGCCTGGATCAGT > NC_002947/3693232‑3693524 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |