New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4806164 | 36 (0.740) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 8.6% | coding (1728/2832 nt) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4806232 | 50 (1.050) | coding (1660/2832 nt) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
CGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCG > NC_002947/4806019‑4806311 | cgTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTg > 5:84610/1‑149 (MQ=255) tCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGcc > 8:189136/1‑149 (MQ=255) cTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCa < 6:84610/149‑1 (MQ=255) cGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCgg > 8:141250/1‑149 (MQ=255) gctggctgATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTg > 7:70949/1‑149 (MQ=255) gctgATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCTTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCg < 5:22706/148‑1 (MQ=255) tgATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGata > 4:62893/1‑149 (MQ=255) gATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACATCCTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCCGTGCCCACCTCGGTGACGatat > 5:76420/1‑149 (MQ=255) cGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGGGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAgg < 1:187353/148‑1 (MQ=255) gTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGa > 4:163467/1‑149 (MQ=255) aaTTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCgg < 7:70817/112‑1 (MQ=255) aaTTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCt < 4:287364/149‑1 (MQ=255) aaTTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCACAGCTCgg > 8:70817/1‑112 (MQ=255) aTTGCAGCTCTGGCCATTCGTTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCTAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGTAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCTGCCATCGGCGCt < 6:76420/148‑1 (MQ=255) ctctGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGa < 3:163467/149‑1 (MQ=255) gCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGaca < 7:141250/146‑1 (MQ=255) ccATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTgg > 7:11200/1‑149 (MQ=255) tGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggc > 6:100520‑M2/1‑145 (MQ=255) aCTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGgcgc > 7:141823/1‑149 (MQ=255) gCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGatggccagtgtcgagttcagcgccgatggccgcatcagcctgcgccatatcggcaccgagctgggcaccggc < 7:16790‑M1/144‑73 (MQ=255) gCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGatggccagtgtcgagttcagcgccgatggccgcatcagcctgcgccatatcggcaccgagctgggcaccggc > 8:16790‑M1/1‑72 (MQ=255) cAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCg > 6:114810/1‑149 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAAcc > 6:138841/1‑149 (MQ=255) cACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTg > 7:264764/1‑149 (MQ=255) aCCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGatggccagtgtcgagttcagcgccgatggccgcatcagcctgcgccatatcggcaccgagctgggcaccggcatgtccac < 5:124827‑M1/143‑81 (MQ=255) aCCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGatggccagtgtcgagttcagcgccgatggccgcatcagcctgcgccatatcggcaccgagctgggcaccggcatgtccac > 6:124827‑M1/1‑63 (MQ=255) cTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTAc > 3:110395/1‑149 (MQ=255) cGGCCGAGGAAATCGCTGCCCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTACCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTg < 3:174305/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTgg < 8:11200/149‑1 (MQ=255) gCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGc < 7:189136/149‑1 (MQ=255) gAGGAAATCGCTGACAACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCCGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATCGCGCAGGATCATGCGCCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCAACGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTgg > 4:188702/1‑145 (MQ=255) aGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGAt > 5:108980/1‑149 (MQ=255) cctctatgCTGACCACCTAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGAt < 1:103686/141‑1 (MQ=255) gAAATCGCTGACCAGCCAAGCCTGGGAGGTGGAGATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGATGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATg < 6:106201/148‑1 (MQ=255) gAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATgg > 3:153220/1‑149 (MQ=255) caccaAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGc > 1:97537/1‑149 (MQ=255) caccaAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGc < 4:110395/149‑1 (MQ=255) caccaAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGc > 7:49245/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGTAACCTGTACCGAATTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCa < 8:49245/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCa < 8:141823/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGCAGCCGCCGCCGTAc > 3:135984/1‑147 (MQ=255) cTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGt > 1:129614/1‑149 (MQ=255) gTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggt < 5:124827‑M2/143‑64 (MQ=255) gTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggt > 6:124827‑M2/1‑80 (MQ=255) gTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGATCCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCgg < 5:138841/149‑1 (MQ=255) gCCGatggccagtgtcgagttcagcgccgatggccgcatcagcctgcgccatatcggcaccgagctgggcaccggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggtgaagactgcagtca > 6:100520‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggtgaagactgc < 7:16790‑M2/144‑73 (MQ=255) gCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggtgaagactgc > 8:16790‑M2/1‑72 (MQ=255) gCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATAGGCGCTGAACTAGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACAAGTGGTCCGGGTCCTTgg > 4:229888/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCg > 7:82214/1‑149 (MQ=255) | CGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCG > NC_002947/4806019‑4806311 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |