New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4806164 | 36 (0.740) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 8.6% | coding (1728/2832 nt) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4806232 | 50 (1.050) | coding (1660/2832 nt) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
TGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCTTGTCGAGGATCTC > NC_002947/4806088‑4806379 | tGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggc > 6:100520‑M2/1‑145 (MQ=255) aCTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGgcgc > 7:141823/1‑149 (MQ=255) cAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCg > 6:114810/1‑149 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAAcc > 6:138841/1‑149 (MQ=255) cACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTg > 7:264764/1‑149 (MQ=255) cTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTAc > 3:110395/1‑149 (MQ=255) cGGCCGAGGAAATCGCTGCCCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTACCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTg < 3:174305/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTgg < 8:11200/149‑1 (MQ=255) gCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGc < 7:189136/149‑1 (MQ=255) gAGGAAATCGCTGACAACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCCGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATCGCGCAGGATCATGCGCCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCAACGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTgg > 4:188702/1‑145 (MQ=255) aGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGAt > 5:108980/1‑149 (MQ=255) cctctatgCTGACCACCTAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGAt < 1:103686/141‑1 (MQ=255) gAAATCGCTGACCAGCCAAGCCTGGGAGGTGGAGATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGATGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATg < 6:106201/148‑1 (MQ=255) gAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATgg > 3:153220/1‑149 (MQ=255) caccaAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGc > 7:49245/1‑149 (MQ=255) caccaAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGc > 1:97537/1‑149 (MQ=255) caccaAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGc < 4:110395/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGTAACCTGTACCGAATTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCa < 8:49245/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCa < 8:141823/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGCAGCCGCCGCCGTAc > 3:135984/1‑147 (MQ=255) cTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGt > 1:129614/1‑149 (MQ=255) gTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggt > 6:124827‑M2/1‑80 (MQ=255) gTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggt < 5:124827‑M2/143‑64 (MQ=255) gTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGATCCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCgg < 5:138841/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggtgaagactgc > 8:16790‑M2/1‑72 (MQ=255) gCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATcggcatgtccacctcccaggctttggtggtcagcgatttcctcggccgttcggccgacgaggtgaagactgc < 7:16790‑M2/144‑73 (MQ=255) gCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATAGGCGCTGAACTAGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACAAGTGGTCCGGGTCCTTgg > 4:229888/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCg > 7:82214/1‑149 (MQ=255) cccAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCAt > 3:105997/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCt < 5:114810/149‑1 (MQ=255) gTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGAc > 8:21431/1‑107 (MQ=255) gTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGAc < 7:21431/107‑1 (MQ=255) atatGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCGTTCTGGCATATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCgtgt < 8:264764/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGt > 8:235233/1‑134 (MQ=255) ggCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGt < 7:235233/134‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTGATGGGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCa < 5:65538/128‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCa > 6:65538/1‑128 (MQ=255) cAGTCTGATGCGGACATCTTCTCTGAACTCGACACTGTACATAGTATACTCGTAACCTGTACGGAATTACTTATGTCAGATGGCTAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTGCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTTAGTTTATCGCTGt < 4:135984/149‑1 (MQ=255) aTGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTc > 1:241938/1‑101 (MQ=255) aTGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTc < 2:241938/101‑1 (MQ=255) aTGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTgcgc < 2:25905/147‑1 (MQ=255) aTGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGcca < 8:82214/149‑1 (MQ=255) aTGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGcca < 2:97537/149‑1 (MQ=255) gCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGccac > 2:177104/1‑148 (MQ=255) gCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGccac > 3:122771/1‑148 (MQ=255) gCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGccac < 4:153220/148‑1 (MQ=255) ggCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGccacca > 8:266161/1‑148 (MQ=255) cGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTg > 8:100087/1‑148 (MQ=255) ggggcTGAACTCGTCACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACGTGTACCGAAGTCCTTCTGGCATATGGCGATGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGAGTGTATCGCGGTTGCGCCACGACTCGTGca < 3:188702/146‑1 (MQ=255) gcTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAg < 3:7127/149‑1 (MQ=255) aaCTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCg < 7:100087/147‑1 (MQ=255) cTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCt > 5:282704/1‑149 (MQ=255) gACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCTTg > 2:308118/1‑148 (MQ=255) gACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCTTGt < 2:129614/149‑1 (MQ=255) gACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCTTGt < 1:308118/149‑1 (MQ=255) tGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCTTGTCGAg > 5:303497/1‑148 (MQ=255) gCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGTTCCTTGGCGTCCAGCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCTTGTCGAGGa < 3:229888/148‑1 (MQ=255) aTCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCTTGTCGAGGAtctc < 1:177104/149‑1 (MQ=255) | TGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTGGCAGATGGCGAAGCCGACGCCGTACCAGTGGTCCGGGTCCTTGGCGTCCATCTGTTGCTTGCGTGTATCGCGGTTGCGCCACCACTCGTGCACAGCGGCCTTGTCGAGGATCTC > NC_002947/4806088‑4806379 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |