| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5221665 = | 62 (1.270) | 4 (0.090) | 4/248 | NT | 7.1% | coding (791/888 nt) | PP_4601 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 5221749 = | 46 (0.990) | coding (875/888 nt) | PP_4601 | LysR family transcriptional regulator | |||||
CCAATGCGGTGCTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGCCGGTCAGCTGC > NC_002947/5221518‑5221810 | ccAATGCGGTGCTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCca > 2:113736/1‑148 (MQ=255) aaTGCGGTGCTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAg < 7:63215/149‑1 (MQ=255) tggcatGCTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGcc < 1:64753/144‑1 (MQ=255) ggTGCTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCgg < 1:113736/149‑1 (MQ=255) ggTGCTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCgg < 5:299809/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCcac < 4:106034/142‑1 (MQ=255) ggTGCTCGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCcac > 3:106034/1‑142 (MQ=255) ggTACTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCgg > 3:273291/1‑149 (MQ=255) ggTACTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCgg > 3:268817/1‑149 (MQ=255) ttGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCggg > 2:257146/1‑149 (MQ=255) gagCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCcaca > 7:185039/1‑134 (MQ=255) gagCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCcaca < 8:185039/134‑1 (MQ=255) gACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGACCGGgctgtggat < 3:161874/149‑6 (MQ=255) cTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCtgctgctgc > 5:230013/1‑149 (MQ=255) tCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCGGTGAAGGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGctgctgctg > 1:98749/1‑149 (MQ=255) gAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGcgcc > 8:203721/1‑149 (MQ=255) cAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGc > 8:283591/1‑147 (MQ=255) aGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑Ag > 2:16768/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCcg < 3:174428/147‑1 (MQ=255) tCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCcgc‑g > 4:258202/1‑148 (MQ=255) aGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCg > 6:69476/1‑149 (MQ=255) aTCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCA‑At > 6:77809/1‑149 (MQ=255) tCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGATGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑Att < 7:203721/149‑1 (MQ=255) acacCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGcc > 3:177110/1‑149 (MQ=255) acacCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGcc > 8:85441/1‑149 (MQ=255) acacCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCC‑ATTccc > 2:257139/1‑149 (MQ=255) ctacaccgaccacagcgccttcagccgccagttcaagcagctgaccggctttacgccgcgccagtaccgccaggctaccgccgatcagctggcctgaaACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTg < 7:277324‑M1/51‑1 (MQ=255) cacCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCg < 7:85441/149‑1 (MQ=255) tacaccgaccacagcgccttcagccgccagttcaagcagctgaccggctttacgccgcgccagtaccgccaggctaccgccgatcagctggcctgaaACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGc < 2:69439‑M1/52‑1 (MQ=255) acCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGcc > 4:198707/1‑147 (MQ=255) acCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGa < 7:283591/149‑1 (MQ=255) atatGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCA‑ATCGCCGAGcgcgg < 5:77809/149‑5 (MQ=255) tgctgcGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGa > 4:176619/1‑140 (MQ=255) tgctgcGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGa < 3:176619/140‑1 (MQ=255) ctgcGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCttt < 6:230013/148‑1 (MQ=255) ctgcGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCttt < 3:258202/148‑1 (MQ=255) tgcGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGc > 6:68003/1‑149 (MQ=255) tgcGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCGCGGGG‑CTTGCCGCGCCATGCTTTGc > 3:1620/1‑149 (MQ=255) cgcgATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGcc < 5:69476/148‑1 (MQ=255) cgATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAg < 4:272177/149‑1 (MQ=255) gATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCC‑ATTGCCGAGCCAAGCGTTGCCGAgg > 7:274573/1‑149 (MQ=255) aTGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGcgcg > 4:189815/1‑149 (MQ=255) gCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCggg > 8:122326/1‑149 (MQ=255) gcACTCGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGTTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCgggg < 2:258428/148‑1 (MQ=255) ccACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCgggg > 2:51651/1‑149 (MQ=255) cACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCggggg < 1:51651/149‑1 (MQ=255) aaCTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCggggg < 4:8116/148‑1 (MQ=255) gcagctgaccggctttacgccgcgccagtaccgccaggctaccgccgatcagctggcctgaaACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTc > 8:277324‑M1/63‑149 (MQ=255) gCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGCTCATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGc > 1:75692/1‑149 (MQ=255) gCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGcc < 6:117624/149‑1 (MQ=255) agctgaccggctttacgccgcgccagtaccgccaggctaccgccgatcagctggcctgaaACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAg > 1:69439‑M1/61‑149 (MQ=255) cTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAgg > 6:142761/1‑145 (MQ=255) cTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAgg < 5:142761/145‑1 (MQ=255) tGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGCGGCGGGGGG‑ATTGCCGACCAAAGATTTGCGGGGGCCCGGGGGGGGTTTAAGGcccg > 2:148820/1‑147 (MQ=255) ggAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTAGGCG‑AATGCCGAGCAATGCATTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGGCAGCt > 6:93837/1‑149 (MQ=255) gAAGAGCTCAGCGAGGACCTGCG‑‑CATCGTTCCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGGG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGc < 8:274573/147‑1 (MQ=255) aGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGAt < 1:16768/149‑1 (MQ=255) aCCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCAAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTgg < 3:273137/149‑1 (MQ=255) cg‑‑cATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTa < 7:122326/149‑1 (MQ=255) cATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACt < 3:198707/149‑1 (MQ=255) aTCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTg < 1:148820/149‑1 (MQ=255) tACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGgcgc > 8:178474/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCgcggc < 5:68003/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCgcggc < 4:273291/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCgcggc < 4:268817/149‑1 (MQ=255) ggCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTa > 6:286755/1‑148 (MQ=255) aGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGc > 3:127359/1‑149 (MQ=255) aGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGc > 3:73175/1‑149 (MQ=255) cgc‑cATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGCCGGTCa < 4:177110/149‑1 (MQ=255) cgc‑cATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCACGGCGAATTGCC‑AGCAAAGCTTTTGCGACGCGCGGGGGCTGTTTAAAGCCAGCTGATAGGCGGTAGCCAGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGCCGCTc > 4:159437/1‑148 (MQ=255) gc‑cATCCACACCCCGGGGGGGGGGGTGCTGCGGCGCCGCGTTTCCCCGC‑CCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGCCGGt < 1:257146/149‑1 (MQ=255) c‑cATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGGGTTACCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGCCGGTCAgc > 1:250312/1‑149 (MQ=255) tCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGCCGGTCAgctgc > 7:284084/1‑149 (MQ=255) | CCAATGCGGTGCTTGAGAGCGACTCGAGCTTCCAGCTTATCCAGGCCATCAACACCGGCATATGCTGCGCGATCATGCCACTGGACTGCGGCCTGGAAGACCTCAGCGAGCACCTGCG‑‑CATCGTACCGGTGGCAGACGCCGC‑CATCCACAGCCCGGTCGGGCTGCTGCTGCGCCGCAGCG‑‑‑AGCCGC‑GCTCGGCG‑ATTGCCGAGCAATGCTTTGCCGAGGCGCGGGGGCTGTTTCAGGCCAGCTGATCGGCGGTAGCCTGGCGGTACTGGCGCGGCGTAAAGCCGGTCAGCTGC > NC_002947/5221518‑5221810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |