New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5667231 | 42 (0.860) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.9% | intergenic (+9/+62) | nhaP/PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
? | NC_002947 | = 5667272 | 56 (1.200) | intergenic (+50/+21) | nhaP/PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
GCACTTGCACTGTCGCTACCGCTGGGCGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCC > NC_002947/5667085‑5667377 | gCACTTGCACTGTCGCTACCGCTGGGCGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑TGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCgggg < 3:42264/149‑1 (MQ=255) aCTTGCACTGTCGCTACCGCTGGGCGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACAACGAGGTGTTGTCGTCGATTATGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCCGGGcc > 2:242651/1‑149 (MQ=255) gCTACCGCTGGGCGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGccc < 5:12489/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTcgc > 6:297720/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGt < 1:206686/149‑1 (MQ=255) gggatgtaCGGGACCTTCTTCTTTCGATGACCTACATCGTGGTGTTGGCGTCGATTCTTGGGCAGGGGGTGACCCTTTGGCGGGTGGTGAAGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGt < 1:242651/142‑1 (MQ=255) ggAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGcctcttcgcgggttcacccgcgaatgggccg > 1:184270‑M1/1‑118 (MQ=255) gAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAAccc > 3:42906/1‑149 (MQ=255) gAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAAccc > 4:141641/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCTGTCGATCTCCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAagag < 2:168944/149‑1 (MQ=255) tCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg > 3:185171/1‑149 (MQ=255) tCGATCACCTACATCGTGGTGTGGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGcctcttcgcgggttcacccgcgaatgggccgcaaagcggccccggcattc < 8:223068‑M1/149‑51 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGcctcttcgcgggttcacccgcgaatgggccgcaaagcggccccggcattct < 2:184270‑M1/148‑52 (MQ=255) gATCACATACATCGTGGTGTTGTCGTCTATTCAGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCTGCGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACACGCTAAGAGGACCGCACAgg > 5:248813/1‑148 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAAc > 5:110936/1‑146 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCa < 6:110936/148‑1 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAg > 5:312190/1‑149 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAg > 7:135718/1‑149 (MQ=255) aTCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTc > 5:115605/1‑149 (MQ=255) aTCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTc < 2:252332/149‑1 (MQ=255) gtgtTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTc < 4:42906/148‑1 (MQ=255) ttgtCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACt < 5:297720/149‑1 (MQ=255) ttgtCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCCATTTGCGGCCCATACGCGGGTGAACCCGCGAAAAGGCCGGAACAGCCAACAAGGGACTTTTCGaat > 6:183209/1‑147 (MQ=255) gtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCg > 8:284239/1‑148 (MQ=255) gtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCg > 4:55138/1‑148 (MQ=255) gtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCg > 8:220255/1‑148 (MQ=255) gATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATc > 8:261944/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCgg > 1:136413/1‑149 (MQ=255) gCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACg > 4:139736/1‑148 (MQ=255) ttGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACt < 2:136413/149‑1 (MQ=255) gggCGGGTGGTG‑CGCAAGGGCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACtt < 3:208281/148‑1 (MQ=255) ggggtg‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGGCGTGCTAATGCCCGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCg < 5:183209/147‑1 (MQ=39) cgcAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTgcgc > 7:84473/1‑149 (MQ=255) aGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCCGCACGTACTTGAGCTCGGTGCGCCCAt > 6:280238/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATgg < 5:55118/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATgg > 6:55118/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATggg > 7:277725/1‑149 (MQ=255) ctgccAGCCTTGAGAATGGCGGGGCCGCTTTGTGGCCCATTCGCGTGTGTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCGCATGGGCt < 6:248813/144‑1 (MQ=255) cgcCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGc < 6:115605/149‑1 (MQ=255) cgcCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGc < 3:139736/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTa > 2:260602/1‑119 (MQ=255) ccAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTa < 1:260602/119‑1 (MQ=255) aGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTTGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCa < 6:312190/149‑1 (MQ=255) cTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGc > 5:107773/1‑149 (MQ=255) cTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGc < 8:163844/149‑1 (MQ=255) agaATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGccggcattctcaaggctgggcgctgaccttgcgcaccacccgcccaatgctcaacccctgcaccagaatcgacgacaacaccacgatgtaggtgatc < 2:184270‑M2/148‑98 (MQ=255) gaATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGccggcattctcaaggctgggcgctgaccttgcgcaccacccgcccaatgctcaacccctgcaccagaatcgacgaccacaccacgatgtaggtgatcga < 8:223068‑M2/149‑100 (MQ=255) aaTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCt > 6:158086/1‑149 (MQ=255) gcgaatgggCCGCAAAGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACCCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTc > 1:284504/7‑149 (MQ=255) tGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCg > 5:146714/1‑149 (MQ=255) aatgggCCGCAAAGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCCAGCCATCCTCGcc > 1:221493/4‑149 (MQ=255) cGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGccc < 4:185171/149‑1 (MQ=255) | GCACTTGCACTGTCGCTACCGCTGGGCGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTG‑CGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCC > NC_002947/5667085‑5667377 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |