New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5677796 | 46 (0.940) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 7.6% | coding (209/1860 nt) | PP_4983 | amine oxidase |
? | NC_002947 | = 5677835 | 53 (1.130) | coding (170/1860 nt) | PP_4983 | amine oxidase |
GTCGCTGGCGCTGAAGTACTCGCCGTCGATCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCGTCTTGTCTTTTGCCAGC > NC_002947/5677654‑5677942 | gTCGCTGGCGCTGAAGTACTCGCCGTCGATCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGc > 8:171829/1‑147 (MQ=255) tCGCTGGCGCTGAAGTACTCGCCGTCGATCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAg < 1:1541/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGCTGAAGTACTCGCCGTCGATCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGc > 2:141290/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGTCGATCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCa < 2:151771/149‑1 (MQ=255) gATCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCt > 5:245453/1‑149 (MQ=255) tCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTg < 2:237186/149‑1 (MQ=255) tCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTg < 1:141290/149‑1 (MQ=255) cAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCTGGCGACGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACAGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTgg > 7:21177/1‑149 (MQ=255) ggTAACCCGGGGTACGCACGAAGTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGaggccaaggcgggcatgggcgggcgttcgggcctggcc > 7:47273‑M1/1‑111 (MQ=255) gTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGaggccaaggcgggcatgggcgggcgttcgggcctggcca > 4:234717‑M1/1‑110 (MQ=255) aCCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGaggccaaggcgggcatgggcgggcgttcgggcctggccacca < 3:234717‑M1/149‑43 (MQ=255) aCCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTcca > 6:215049‑M2/1‑146 (MQ=255) aCCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTAAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTcca > 2:182003‑M2/1‑146 (MQ=255) ccGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGaggccaaggcgggcatgggcgggcgttcgggcctggccaccagc < 8:47273‑M1/149‑45 (MQ=255) gCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCAcc > 5:124746/1‑149 (MQ=255) gCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTAAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCACCAGCAGGGTccc > 5:41716/1‑146 (MQ=255) cACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGACAGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCt > 4:64496/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGc < 7:171829/149‑1 (MQ=255) gggCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCt < 7:74951/148‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTAGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCttt < 5:25510/149‑1 (MQ=255) gcCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTTAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCTCTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCGATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGtt < 8:21177/149‑1 (MQ=255) cGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTAGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCt > 8:201931/1‑149 (MQ=255) gCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTg < 1:61122/148‑1 (MQ=255) gCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTg > 4:260112/1‑148 (MQ=255) gCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTg > 2:61122/1‑148 (MQ=255) gCAGGGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGc < 8:190789/149‑1 (MQ=255) aGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGATACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGACTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAg > 1:161864/1‑149 (MQ=255) tttCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGccta > 7:269590/1‑146 (MQ=255) tttCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCg > 6:170761/1‑149 (MQ=255) ttCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCg > 1:31925/1‑148 (MQ=255) aaGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGcctacgag > 5:293792/1‑142 (MQ=255) tCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGcc > 4:148500/1‑149 (MQ=255) tACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAg > 5:150137/1‑149 (MQ=255) aCTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGc > 6:76579/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGc < 6:150137/148‑1 (MQ=255) ttgTTGAGCACCGGATGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCACGCCCATGCCCGCCTTTGGCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGGCGTCAGGCCTGCAAGccg > 7:198991/3‑148 (MQ=255) gTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGccccc > 1:241110/1‑149 (MQ=255) gTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGccccc > 6:200072/1‑149 (MQ=255) gTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGccccc > 8:250218/1‑149 (MQ=255) ttGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGcccccc > 4:239331/1‑149 (MQ=255) gCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGcccccccccc > 6:261757/1‑149 (MQ=255) gCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGCCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGcccccccccc < 5:261757/149‑1 (MQ=255) cACCGGCTGTCCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCAATGCCCGCCTTGTACTCCAGCAGGCTCACCTGCCAGCCTTTGATCTGCAGCTCGTAGTCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCa > 2:90395/1‑149 (MQ=255) ggCTGTGCGTTGGCGTTGCCGATGCACTCGCTGGTGGGCATGCCCGAACGCCCGCCCATGGCCGCCTTGGCCACCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCACCTCGTTGGCTGGCGTGAGGGCTGCCAGCCCCCCCCCCACGAc < 6:41716/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAG‑‑CCCCCCCCACGACAATCGCCg < 2:241110/148‑1 (MQ=255) gCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTggg > 7:157270/1‑149 (MQ=255) ttGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCgt < 2:31925/149‑1 (MQ=255) gCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCgtc < 3:148500/148‑1 (MQ=255) gATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCgtcttgt < 5:76579/149‑1 (MQ=255) cACTCGGTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCgtcttgtctt < 3:64496/148‑1 (MQ=255) cTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAgg < 6:200597/100‑1 (MQ=255) cTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAgg > 5:200597/1‑100 (MQ=255) tCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCGTCTTGTCTTTTGc > 8:167873/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTccagcgagtggatcggcaacgccaaggcacagccggtgctcaaccagtacctcgaccgtttcaagcttgaaacactgccggcgcccgagttcgtgcgtaccccgg < 8:47273‑M2/149‑106 (MQ=255) tggtggCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTccagcgagtggatcggcaacgccaaggcacagccggtgctcaaccagtacctcgaccgtttcaagcttgaaacactgccggcgcccgagttcgtgcgtaccccgggt < 3:234717‑M2/149‑108 (MQ=255) tggtggCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCGTCTTGTCTTTTGCcagc > 3:42983/1‑149 (MQ=255) tGGaggccaaggcgggcatgggcgggcgttcgggcctggccaccagcgagtggatcggcaacgccaaggcacagccggtgcttaaccagtacctcgaccgtttcaagcttgaaacactgccggcgcccgagttcgtgcgtaccccgggt > 2:182003‑M1/1‑3 (MQ=255) tGGaggccaaggcgggcatgggcgggcgttcgggcctggccaccagcgagtggatcggcaacgccaaggcacagccggtgctcaaccagtacctcgaccgtttcaagcttgaaacactgccggcgcccgagttcgtgcgtaccccgggt > 6:215049‑M1/1‑3 (MQ=255) gtggCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCGTCTTGTCTTTTGCcagc < 7:250218/147‑1 (MQ=255) | GTCGCTGGCGCTGAAGTACTCGCCGTCGATCAGGTAACCCGGGGTACGCACGAACTCGGGCGCCGGCAGTGTTTCAAGCTTGAAACGGTCGAGGTACTGGTTGAGCACCGGCTGTGCCTTGGCGTTGCCGATCCACTCGCTGGTGGCCAGGCCCGAACGCCCGCCCATGCCCGCCTTGGCCTCCAGCAGGGTCACCTGCCAGCCTTTGTTCTGCAGCTCGTAGGCTGCCGTCAGGCCTGCCAGCCCCCCCCCCACGACAATCGCCGTGGGCGTCTTGTCTTTTGCCAGC > NC_002947/5677654‑5677942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |