New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5783118 = | 51 (1.040) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 5.5% | coding (1593/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
? | NC_002947 | 5783188 = | 54 (1.150) | coding (1663/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
GCTGGCCGATGGCCTGAGCCAGCGCCCGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCC > NC_002947/5782971‑5783262 | gCTGGCCGATGGCCTGAGCCAGCGCCCGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATgg > 1:9260/1‑148 (MQ=255) ccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggtgcgaggatacggtaggcggtgtagaacaccagccaggcctgggccagctgccagagtgcggcgcccaggttggcgttttgcccgcgagcatcgatctgcaaggcatagctGca < 4:300083‑M1/3‑1 (MQ=255) gCCTGAGCCAGCGCCCGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAg < 8:1044/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCCAGCGCCCGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAgg < 8:131335/149‑1 (MQ=255) tGAGCCAGCGCCCGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGc > 7:185449/1‑148 (MQ=255) aGCCAGCGCCCGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAAt > 2:112466/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCCCGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATc < 2:67603/149‑1 (MQ=255) aGCGCCCGATGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGTGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGACACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCt > 8:43476/1‑148 (MQ=255) ccGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCaa < 4:144563/149‑1 (MQ=255) cGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGAGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCaa > 1:11957/1‑148 (MQ=255) gttgttgttCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATcc < 2:86001/140‑1 (MQ=255) gttgttgttCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATcc > 1:86001/1‑140 (MQ=255) ccGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGa < 1:298162/148‑1 (MQ=255) gatgctgTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCCACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCGAATGGCACACGCGCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGAttc > 5:239805/3‑147 (MQ=255) tgctgTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCg > 5:195657/1‑149 (MQ=255) ctgTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCg < 5:240110/147‑1 (MQ=255) ggTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGcc > 5:48520/1‑149 (MQ=255) tGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCtt > 1:258697/1‑149 (MQ=255) tCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTgg < 4:234836/129‑1 (MQ=255) tCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTgg > 3:234836/1‑129 (MQ=255) gcgcTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGgc > 6:152683/1‑149 (MQ=255) acaccagccaggcctgggccagctgccagagtgcggcgcccaggttggcgttttgcccgcgagcatcgatctgcaaggcatagctGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGgcg < 1:38430‑M1/64‑1 (MQ=255) ttGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑Ctgt < 2:11957/148‑1 (MQ=255) gtgGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCa > 2:67283/1‑149 (MQ=255) ggcggcGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGc > 1:73627/1‑149 (MQ=255) caggcctgggccagctgccagagtgcggcgcccaggttggcgttttgcccgcgagcatcgatctgcaaggcatagctGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAg > 2:38430‑M1/78‑149 (MQ=255) gcctgggccagctgccagagtgcggcgcccaggttggcgttttgcccgcgagcatcgatctgcaaggcatagctGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTa > 1:153622‑M1/75‑149 (MQ=255) gcAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATCTGGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑GTGTGCAGCTATga > 1:219123/1‑148 (MQ=255) gcAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTAt < 2:219123/146‑1 (MQ=255) gcAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGcc > 2:91411/1‑149 (MQ=255) ccTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTg > 3:220659/1‑145 (MQ=255) cTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCa < 3:202794/146‑1 (MQ=255) cTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCa > 4:202794/1‑146 (MQ=255) ccAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGAt < 2:9260/148‑1 (MQ=255) aaCGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTAt > 2:60196/1‑79 (MQ=255) aaCGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTAt < 1:60196/79‑1 (MQ=255) ggTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTcgc < 2:214047/149‑1 (MQ=255) gTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTCGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGc > 1:97752/1‑149 (MQ=255) gCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGcc < 3:170020/118‑1 (MQ=255) gCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGcc > 4:170020/1‑118 (MQ=255) cACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCGCCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCa < 1:67283/149‑1 (MQ=255) aCCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAAc < 6:195657/149‑1 (MQ=255) aCCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAAc < 1:200028/149‑1 (MQ=255) cAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCt > 3:237186/1‑149 (MQ=255) ggATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTgg > 2:169961/1‑149 (MQ=255) gATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTggg > 4:278477/1‑149 (MQ=255) gATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTgg < 4:231175/148‑1 (MQ=255) gATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTgg > 3:231175/1‑148 (MQ=255) atC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGgcgc > 3:266428/1‑149 (MQ=255) ttCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTcgcg > 3:191299/1‑118 (MQ=255) ttCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTcgcg < 4:191299/118‑1 (MQ=255) ccgccgTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTgg > 2:232574/1‑148 (MQ=255) ccgccgTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGAAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTgg > 3:163865/1‑148 (MQ=255) cgccgTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTAGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGc < 8:185449/148‑1 (MQ=255) ccAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAgg > 3:301328/1‑149 (MQ=255) ccAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAgg > 8:60190/1‑149 (MQ=255) cAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGc < 2:73627/149‑1 (MQ=255) aaTGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGcc < 4:237186/149‑1 (MQ=255) aaTGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGcc > 7:17631/1‑149 (MQ=255) | GCTGGCCGATGGCCTGAGCCAGCGCCCGTTGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGGTGATCGGCGCGCTTTTGTGGCGGCGCAAATACCTTTACCAACGGTTGGGCAAGGTGCACCAGGATATC‑GGCCACTTCCGCCGTGACAGCCAATGGCACACGCCCCAGGCAATCCTTATCAACATTCTGCTGGCGATGCCGGTCAGCCTTGGCCTGGCG‑CTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCC > NC_002947/5782971‑5783262 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |