| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5978361 | 52 (1.060) | 5 (0.110) | 5/250 | NT | 8.5% | coding (756/993 nt) | PP_5241 | LuxR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 5978393 | 58 (1.240) | coding (724/993 nt) | PP_5241 | LuxR family transcriptional regulator | |||||
TGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGCCGAAACCA > NC_002947/5978216‑5978508 | tgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGc < 6:200732/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTg > 1:146508/1‑147 (MQ=255) tgCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgtg < 7:151028/149‑1 (MQ=255) tgCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgt < 3:13102/148‑1 (MQ=255) cTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCtt > 2:82912/1‑149 (MQ=255) ggTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCg < 1:82912/148‑1 (MQ=255) tcgtcACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCcgggccgtggccgaaggccacaag > 6:106973‑M1/1‑125 (MQ=255) cACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACgg < 3:120865/149‑1 (MQ=255) aCCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCGAAGGCCAcaa < 2:214245/148‑3 (MQ=255) ccTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGcc > 3:6854/1‑149 (MQ=255) ccTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGcc < 8:212595/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGccc > 6:120485/1‑149 (MQ=255) gTGCCGATCTGCCTGGCTATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGggcgc > 4:49327‑M2/1‑143 (MQ=255) tGCCGATCTGCCTGGAGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCcgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcgg < 8:180121‑M1/149‑40 (MQ=255) ccGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCAc > 1:119531/1‑149 (MQ=255) gatGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGTTACTTTTCCTCTACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTg < 8:231812/145‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCcgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgag < 5:106973‑M1/148‑49 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCcgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcagg < 1:295797‑M1/143‑44 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCcgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcag < 6:94433‑M1/142‑43 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACt < 7:253761/142‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACt < 7:229681/142‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACt < 1:196568/142‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTc < 1:33073/145‑1 (MQ=255) cTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCaa > 1:300753/1‑149 (MQ=255) tGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTCAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCaa > 8:40915/1‑148 (MQ=255) gCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc > 7:85053/1‑144 (MQ=255) gCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc < 8:85053/144‑1 (MQ=255) gATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAggg > 8:277053/1‑149 (MQ=255) gATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAggg > 2:180851/1‑149 (MQ=255) aTCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGt > 2:47662/1‑149 (MQ=255) cTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGt > 5:155769/1‑147 (MQ=255) gCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACa > 3:73466/1‑141 (MQ=255) gCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACa < 4:73466/141‑1 (MQ=255) cTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGc < 4:6854/148‑1 (MQ=255) aaGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTc < 3:82087/149‑1 (MQ=255) gccgccTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACa < 6:211473/128‑1 (MQ=255) gccgccTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACa > 5:211473/1‑128 (MQ=255) gccgccTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCAt < 1:47662/149‑1 (MQ=255) cgccTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCAt < 6:24556/147‑1 (MQ=255) cgccTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCAt > 5:24556/1‑147 (MQ=255) ccTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGaa > 1:35334/1‑149 (MQ=255) caccaGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCt > 1:300858/1‑149 (MQ=255) accaGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCtt > 6:208701/1‑149 (MQ=255) ccaGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTg < 2:146508/149‑1 (MQ=255) aGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGt < 5:120485/149‑1 (MQ=255) gaagaCCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGa > 3:130866/1‑148 (MQ=255) ggCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgt < 5:234476/63‑1 (MQ=255) ggCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgt > 6:234476/1‑63 (MQ=255) gcgcTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCAc < 2:119531/147‑1 (MQ=255) gCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCTCCCCGgcg < 4:130866/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGc < 2:300753/149‑1 (MQ=255) gcTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTg > 7:192683/1‑148 (MQ=255) cTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGa < 6:235221/149‑1 (MQ=255) gTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTATGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACgg > 8:169599/1‑149 (MQ=255) tttCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATc > 1:300938/1‑149 (MQ=255) ccTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCgg < 7:169599/148‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttctcgctggtggtaggcggcttgtcgcacaagcagatcgccagg < 5:106973‑M2/148‑101 (MQ=255) tCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGAt > 6:79669/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGt < 6:155769/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGt < 2:300938/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttctcgctggtggtaggcggcttgtcgcacaagcagatcgccagg < 1:295797‑M2/143‑101 (MQ=255) cTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttctcgctggtggtaggcggcttgtcgcacaagcagatcgccagg < 6:94433‑M2/142‑101 (MQ=255) cTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGc < 2:300858/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttctcgctggtggtaggcggcttgtcgcacaagcagatctccaggcagatcggca < 8:180121‑M2/149‑111 (MQ=255) gcgcCcgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttctcgctggtggtaggcggcttgtcgcacaagcagatagccaggcagatcggcac > 4:49327‑M1/1‑5 (MQ=255) gcgcCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGCCGaaa > 6:155778/1‑149 (MQ=255) cgcCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGCCGAAAc < 1:180851/149‑1 (MQ=255) gcCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGCCGAAAc > 5:223181/1‑148 (MQ=255) ccTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGTTCTTCATCGTACGTCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGCCGAAACCa < 7:40915/149‑1 (MQ=255) | TGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGCCGAAACCA > NC_002947/5978216‑5978508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |