New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 116151 | 51 (1.040) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.9% | coding (454/894 nt) | PP_0110 | CyoE‑like protoheme IX farnesyltransferase |
? | NC_002947 | = 116188 | 47 (1.010) | coding (491/894 nt) | PP_0110 | CyoE‑like protoheme IX farnesyltransferase |
GCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCACGGCGAGCG > NC_002947/116043‑116332 | gCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcgg < 3:96104‑M2/149‑4 (MQ=255) gCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcgg > 8:45535‑M2/1‑146 (MQ=255) ccTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggc < 3:171731‑M2/148‑5 (MQ=255) ccTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcg < 6:104053‑M2/146‑3 (MQ=255) ccTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcg > 5:104053‑M2/1‑144 (MQ=255) cTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggcca > 8:175825‑M2/1‑143 (MQ=255) aCCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCCAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGt < 6:72044/149‑1 (MQ=255) cGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGt > 2:165439/1‑147 (MQ=255) gCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAgcgc < 5:138631/147‑1 (MQ=255) cTCATTACTGGGTTATGCGGTGCTGTACACCGGCTTTCTGAAGCGCGGCACTCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCGGTTGCTCGGCTGGGTGGCGTTAAGCGGCCATGTCAGCTCCGAACCCTtgctgc < 5:16976/149‑1 (MQ=255) cTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAAccc < 8:265424/142‑1 (MQ=255) cTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAAccc > 7:265424/1‑142 (MQ=255) cTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTtgctgc > 3:127116/1‑149 (MQ=255) aTTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTtg < 6:17123/142‑1 (MQ=255) aTTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTtg > 5:17123/1‑142 (MQ=255) aTTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCtt < 7:52217/148‑1 (MQ=255) cTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTgtgt < 1:165439/148‑1 (MQ=255) cTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTgtgt < 3:148930/148‑1 (MQ=255) ggTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGa < 5:216056/148‑1 (MQ=255) ggTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGa < 4:96104/148‑1 (MQ=255) cGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCAACAGTACCTAGTCATCTGTCGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTc < 6:301738/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCg > 1:42545/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCg > 1:117198/1‑149 (MQ=255) tctACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTg > 5:274727/1‑148 (MQ=255) gCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCt < 5:7114/138‑1 (MQ=255) gCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCt > 6:7114/1‑138 (MQ=255) gCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCccgccg < 4:127116/149‑1 (MQ=255) ctcAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCAttt > 8:83837/1‑149 (MQ=255) tcAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTc > 4:211364/1‑149 (MQ=255) ccacgccacAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTg < 2:42545/149‑1 (MQ=255) cacgccacAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTgg < 2:117198/149‑1 (MQ=255) cacgccacAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTgg > 2:34113/1‑149 (MQ=255) acaGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATcc < 2:297078/149‑1 (MQ=255) acaGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATc > 2:174077/1‑148 (MQ=255) aGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCAc > 3:109529/1‑149 (MQ=255) gAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCAcc < 6:274727/149‑1 (MQ=255) tCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTc > 5:202378/1‑104 (MQ=255) tCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTc < 6:202378/104‑1 (MQ=255) gTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAagga < 3:132418/149‑1 (MQ=255) tCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAaggag < 7:83837/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCTGGCCGTTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATa > 6:256417/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATa < 3:211364/149‑1 (MQ=255) gcgtggccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGc < 2:93879/145‑1 (MQ=255) gcctggccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGc < 2:66204/148‑1 (MQ=255) cctggccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggt < 8:263369‑M2/148‑104 (MQ=255) ctggccGGTGCCGCTCTGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggt < 4:221859‑M2/147‑104 (MQ=255) ctggccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGcc > 8:79657/1‑147 (MQ=255) gccGGTGCCGCTCTGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggtgag > 3:221859‑M2/1‑41 (MQ=255) gccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGc > 2:233031/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGa > 7:258078/1‑149 (MQ=255) gTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGc < 1:233031/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGc < 7:79657/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGc > 2:43717/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCTTGGTGGCTGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCg < 5:165890/148‑1 (MQ=255) tCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGt > 8:82584/1‑148 (MQ=255) tCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGt > 5:147620/1‑148 (MQ=255) cGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGa < 8:258078/149‑1 (MQ=255) ggggggCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCAATTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCAc < 4:171731/149‑1 (MQ=255) ggcagcggccaggcctccgctgacgaagttcagtggcgtggcgagcttgagaaagccggtttagagcaccgcataaccgagtaatcaggcgagggtcagccaggcggtgagggcgttggtgaacaccagcagcaggaccatgcccagca > 5:301738‑M2/4‑5 (MQ=255) | GCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCACGGCGAGCG > NC_002947/116043‑116332 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |