New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 170079 | 56 (1.140) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 7.2% | coding (481/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
? | NC_002947 | = 170103 | 51 (1.120) | coding (505/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
GGTAAACCCGCAGCTCATCTATTGCTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAG > NC_002947/169958‑170240 | ggTAAACCCGCAGCTCATCTATTGCTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGggc < 7:249954‑M2/149‑4 (MQ=255) tAAACCCGCAGCTCATCTATTGCTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGggccg < 5:197403‑M2/149‑6 (MQ=255) aTCTATTGCTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGgtgt > 4:188314/1‑149 (MQ=255) tATTGCTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCTGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCATGACCGGCCGACAGAAGGGTGAAGAATGCGCAGGGCAGGTCAAGGCGGGTGTGgc > 6:154627/1‑149 (MQ=255) aTTGCTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCGTGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGTGTGGGCTGCTGAGCCTGAACGGCCTTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCACGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGgcg > 1:293443/1‑149 (MQ=255) ttGCTCCATTACGGTCTTCGGTCTGACCGGGCCCTATGCGAAGCGGGCTGGCTATGACTTCTTGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTTATGAGCCTGTCCGGGCGTCCGGAGGGGGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGtgtg < 7:167705/145‑1 (MQ=255) ttGCTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGgcgc > 4:191417/1‑149 (MQ=255) cTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTa > 5:21036/1‑149 (MQ=255) aCCGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGata < 5:43136/148‑1 (MQ=255) cGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTc < 2:229150/149‑1 (MQ=255) gTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGAGCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCggg > 1:219062/1‑149 (MQ=255) tCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGt > 4:100163/1‑149 (MQ=255) tCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGt > 3:190771/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCGTGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCGGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGtt < 8:272974/149‑1 (MQ=255) ggCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTcc > 2:82100/1‑149 (MQ=255) gCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCcg < 4:190771/149‑1 (MQ=255) ccAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGcc < 7:75276/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCAt > 2:179334/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGat > 2:189514/1‑112 (MQ=255) gCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGcc > 7:116407/1‑149 (MQ=255) ttCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCG‑CATGCTGGCTGCCCTCGCCCAt > 7:225005/1‑149 (MQ=255) tCATGATCCAGGGGTCGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGCTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGcc > 7:255395/1‑146 (MQ=255) cATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATc > 2:2112/1‑149 (MQ=255) aTGATCCAGGTGTTGGTGTGGCTTATGAGCCTGACCTGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCTCAGGGCCGGTCAAGGGGTGTGTGGCGCTTACCTATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGTTCGCAATGCTGGCTGCCCTCGACCATCg < 2:293443/149‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGGCCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCg > 1:68059/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGa < 8:249954/149‑1 (MQ=255) aTCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGa > 7:64246/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGAGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGa > 7:201552/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGAt < 1:82100/149‑1 (MQ=255) ggTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACa < 3:208261/149‑1 (MQ=255) gTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGGCCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAg < 2:68059/149‑1 (MQ=255) gTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAg > 8:274906/1‑149 (MQ=255) gTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAg < 1:2112/149‑1 (MQ=255) tggggtgggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGCTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAgg < 6:21036/147‑1 (MQ=255) gttggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGTTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGTGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGTCTTGTATTCCTCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGAt < 1:64300/134‑1 (MQ=255) gtgggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTc > 2:239190/1‑149 (MQ=255) gtgggCTGATGAGCCTGACAGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTATGAAAGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCATCGCGCATCGGGAt > 2:64300/1‑137 (MQ=255) ggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGTAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCcgcg < 2:187908/101‑1 (MQ=255) ggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGGAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCcgcg > 1:187908/1‑101 (MQ=255) ggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCgg < 1:239190/148‑1 (MQ=255) ggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCgg < 8:116407/148‑1 (MQ=255) tgatgaGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAg > 3:34146/1‑149 (MQ=255) aGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATg < 7:274906/148‑1 (MQ=255) ccTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGTGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTc > 3:242604/1‑148 (MQ=255) cTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGggccggtcaggctcatcagcccacccaacccctggatcatgaagtcatagccagcgcgcttggcatagggcccggtctgaccgaagccggtaatggagcaata < 7:277397‑M2/137‑104 (MQ=255) cTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGggccggtcaggctcatcagcccacccaacccctggatcatgaagtcatagccagcgcgcttggcatagggcccggtctgaccgaagccggtaatggagcaata > 8:277397‑M2/1‑34 (MQ=255) tGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGggccggtcaggctcatcagcccacccaacccctggatcatgaagtcatagccagcgcgcttggcatagggcccggtctgaccgaagccggtaatggagcaatagatgagctgcggg < 3:11645‑M2/149‑117 (MQ=255) gACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGggccggtcaggctcatcagcccacccaacaccgggatcatgaagtcatagccagcgcgcttggcatagggcccggtctgaccgaagcaggtaattgaggaattgatgagctgcgggt < 6:275214‑M2/149‑118 (MQ=255) aCCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTGGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACAt > 5:264268/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACAt > 3:179902/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCG‑CATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACAt < 8:225005/148‑1 (MQ=255) cGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATgg > 5:266803/1‑149 (MQ=255) tCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGc < 3:100163/149‑1 (MQ=255) gAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGa > 2:296570/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGa < 3:191417/149‑1 (MQ=255) gaagaaGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAtgtg > 6:40693/1‑147 (MQ=255) aagaagGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAg > 1:289860/1‑149 (MQ=255) gcAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGc < 3:199960/77‑1 (MQ=255) gcAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGc > 4:199960/1‑77 (MQ=255) | GGTAAACCCGCAGCTCATCTATTGCTCCATTACCGGCTTCGGTCAGACCGGGCCCTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAG > NC_002947/169958‑170240 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |