New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 939586 | 43 (0.880) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.5% | coding (6036/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 939632 | 45 (0.970) | coding (5990/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
GCGTGGCGACCGAGCCGGGTTGCGAGACATTGCCGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTGCTGGCGGT > NC_002947/939486‑939777 | gcgtggcgACCGAGCCGGGTTGCGAGACATTGCCGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGc > 2:62093‑M2/1‑147 (MQ=255) gACCGAGCCGGGTTGCGAGACATTGCCGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATcgc < 5:309038/149‑1 (MQ=255) aCCGAGCCGGGTTGCCAGACATTGCCGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATcgcg < 1:118856/149‑1 (MQ=255) gggTTGCGAGACATTGCCGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGaa > 6:141861/1‑149 (MQ=255) gCGAGACATTGCCGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCt < 5:141861/148‑1 (MQ=255) gagaCATTGCCGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTgg > 7:53340/1‑148 (MQ=255) ccGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGCGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCtt > 5:157666/1‑148 (MQ=255) ccGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGCGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTc < 6:157666/149‑1 (MQ=255) gtaGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCt < 3:201755/132‑1 (MQ=255) gtaGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCt > 4:201755/3‑134 (MQ=255) ggTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTg > 2:50772/1‑121 (MQ=255) tCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTc < 5:11552/143‑1 (MQ=255) tCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTc > 6:11552/1‑143 (MQ=255) cACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAgctggc > 1:43748/1‑149 (MQ=255) ggTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCcggcgg < 6:91723/149‑1 (MQ=255) ggTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGGGCCTGCGCCAGCGCCCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCcggcgg > 1:254043/1‑149 (MQ=255) tGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGtt > 7:273119/1‑148 (MQ=255) ccATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGtt < 6:309772/146‑1 (MQ=255) ccATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGtt > 5:309772/1‑146 (MQ=255) ccATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGa > 6:54711/1‑148 (MQ=255) gggTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCgg < 2:43748/149‑1 (MQ=255) ggTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCggg < 8:53340/149‑1 (MQ=255) gTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGt < 8:40333/140‑1 (MQ=255) gTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGt > 7:40333/1‑140 (MQ=255) gTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCgggg > 1:57380/1‑149 (MQ=255) ttCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGc > 6:258901/1‑149 (MQ=255) ttCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGc < 5:18935/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCtt > 2:66030/1‑149 (MQ=255) ggTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCggg > 7:189984/1‑142 (MQ=255) ggTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCggg < 8:189984/142‑1 (MQ=255) tGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCAGCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGt > 5:300722/1‑149 (MQ=255) gATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGcgccatcaccttgaacccggccatcaccgatggcagtaccctgcaagtgaccctgaccgacgctgccggcaatgtctcgcaacccggctcggtcgc < 5:207067‑M2/149‑97 (MQ=255) aTGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGTCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTgg > 6:258706/1‑149 (MQ=255) ggCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGcgccatcaccttgaacccggccatcaccgatggcagtaccctgcaagtgaccctgaccgacgctgccggcaatgtctc > 6:173419‑M2/1‑50 (MQ=255) ggCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGcgccatcaccttgaacccggccatcaccgatggcagtaccctgcaagtgaccctgaccgacgctgccggcaatgtctc < 5:173419‑M2/128‑79 (MQ=255) caccttcgCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCgtg < 8:23853/142‑1 (MQ=255) aaGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCgtggt < 5:54711/149‑1 (MQ=255) cATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTcgccg > 4:177012/1‑149 (MQ=255) cATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTcgccg > 3:225200/1‑149 (MQ=255) aTCCGGGTTGACCGAGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTcgccgc > 7:123263/1‑149 (MQ=255) ggTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCg < 1:66030/149‑1 (MQ=255) ggTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCg < 4:77361/149‑1 (MQ=255) gACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGt > 4:281851/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGTCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTTCCGTCGGGGTTGATCACCAGGTTGTTCGGGGCTTCCGGTGGCTTGGTGTCGCCGCCGTCGATTTcc < 2:254043/149‑1 (MQ=255) gtgGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACAGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCgg > 5:160676/1‑148 (MQ=255) tgGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCgg < 3:177012/147‑1 (MQ=255) gCAACTACGGTGCCTGTGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAg > 3:95641/1‑149 (MQ=255) gCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTaa < 5:258901/148‑1 (MQ=255) cAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAgg < 6:51403/149‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGAGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTGCTgg > 1:181800/1‑149 (MQ=255) gTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTGCTGGc > 2:70953/1‑149 (MQ=255) aagtGCGCGATGGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGGTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTGCTGGCgg > 5:67421/4‑149 (MQ=255) ccTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTGCTGGCGGt > 3:208632/1‑149 (MQ=255) | GCGTGGCGACCGAGCCGGGTTGCGAGACATTGCCGGCAGCGTCGGTCAGGGTCACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTGCCATCCGGGTTGACCGTGCCTGTGGCAACTACGGTGCCTGCGCCATCGCGCACTTGAACGCTGGTACCGGCTTCACCGCGACCGGTCAGCTGGCTGCCGGCGGGGTTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCCGGTGGCGTGGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTGCTGGCGGT > NC_002947/939486‑939777 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |