| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1689328 = | 56 (1.140) | 4 (0.090) | 4/248 | NT | 6.9% | coding (209/1032 nt) | ydcT | polyamine ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1689368 = | 55 (1.190) | coding (169/1032 nt) | ydcT | polyamine ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
ACGCCTTTTACCTTCAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAGGTGCGGGAAACCTGG > NC_002947/1689220‑1689513 | accaggtcagcatcgacatcatcgatggcgagttcttttccatgctcggcccttccggctcgggcaagaccacctgcctgcgcctgatcgcaggcttcgagcaaccctCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGa > 4:176338‑M1/109‑149 (MQ=255) ccaggtcagcatcgacatcatcgatggcgagttcttttccatgctcggcccttccggctcgggcaagaccacctgcctgcgcctgatcgcaggcttcgagcaaccctCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAg > 5:146489‑M1/108‑149 (MQ=255) caggtcagcatcgacatcatcgatggcgagttcttttccatgctcggcccttccggctcgggcaagaccacctgcctgcgcctgatcgcaggcttcgagcaaccctCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAgg > 1:224474‑M1/107‑149 (MQ=255) ttACCTTCAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTg < 2:148870/148‑1 (MQ=255) ccTTCAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTc > 4:194871/1‑148 (MQ=255) cTTCAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCg > 5:44770/1‑148 (MQ=255) cAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGaa < 1:292316/147‑1 (MQ=255) cAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGaa < 5:209467/147‑1 (MQ=255) cAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAg < 2:263730/148‑1 (MQ=255) cAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAg < 2:171398/148‑1 (MQ=255) gCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTg < 7:31260/149‑1 (MQ=255) aTAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGa > 5:190326/1‑149 (MQ=255) aGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGaa < 8:142022/139‑1 (MQ=255) aGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGaa > 7:142022/1‑139 (MQ=255) tcCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCgcagg > 8:290304/1‑147 (MQ=255) gCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGaa < 1:204422/124‑1 (MQ=255) gCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGaa > 2:204422/1‑124 (MQ=255) aCGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAggtgg > 3:40175/1‑148 (MQ=255) tgtgCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGccc > 3:58477/1‑149 (MQ=255) cGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGc > 8:126288/1‑149 (MQ=255) gggAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGcaggcagg > 7:6125/1‑133 (MQ=255) gggAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGcaggcagg < 8:6125/133‑1 (MQ=255) gAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCg > 8:187138/1‑148 (MQ=255) aGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAgg < 8:275392/149‑1 (MQ=255) gcgcATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCTGCAGGCCAGCGGCATCGACCACTTCGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGACTGCGATCAGGCGCAGGAAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAggg > 3:214858/1‑149 (MQ=255) gcgcATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGtt > 4:152612/1‑96 (MQ=255) gcgcATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGtt < 3:152612/96‑1 (MQ=255) gcgcATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCg < 2:118816/143‑1 (MQ=255) gcgcATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCg > 1:118816/1‑143 (MQ=255) aGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAg > 4:269329/1‑148 (MQ=255) aGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAg > 8:67286/1‑148 (MQ=255) tCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCAt > 7:241202/1‑149 (MQ=255) cTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATg > 3:177311/1‑148 (MQ=255) tGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGaa < 8:128307/92‑1 (MQ=255) tGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGaa > 7:128307/1‑92 (MQ=255) gAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGaa > 1:153861/1‑148 (MQ=255) aaCACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGaa > 7:251991/1‑147 (MQ=255) acacAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGCTCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGaaaa < 1:234385/148‑1 (MQ=255) acacAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGaa > 2:234385/1‑146 (MQ=255) cacaGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAg > 4:105234/1‑148 (MQ=255) caGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAAc < 4:40175/149‑1 (MQ=255) aGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACt > 3:146873/1‑149 (MQ=255) aCGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATc > 2:186637/1‑149 (MQ=255) gTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCgat > 1:224198/1‑145 (MQ=255) gTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCgat < 2:224198/145‑1 (MQ=255) ggcggcAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCt > 1:168047/1‑149 (MQ=255) cggcAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGa < 7:67286/149‑1 (MQ=255) cctccagcggttcgatccgcatccaaggggtcgaggccgctggAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTg > 1:224474‑M2/44‑149 (MQ=255) ggCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTgg < 2:220858/149‑1 (MQ=255) ctccagcggttcgatccgcatccaaggggtcgaggccgctggAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTgg > 5:146489‑M2/43‑149 (MQ=255) tccagcggttcgatccgcatccaaggggtcgaggccgctggAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGt > 4:176338‑M2/42‑149 (MQ=255) ccTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGGCTTGCCCGCGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGcc < 7:290304/149‑1 (MQ=255) tCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGaaaa < 5:124320/104‑1 (MQ=255) tCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGaaaa > 6:124320/1‑104 (MQ=255) gatccgcatccaaggggtcgaggccgctggAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCtt < 2:224474‑M2/118‑1 (MQ=255) ccccTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGAcc < 8:241202/149‑1 (MQ=255) cTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGa > 6:241298/1‑126 (MQ=255) ggATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGc < 1:186637/147‑1 (MQ=255) aTGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGaa < 7:126288/149‑1 (MQ=255) aTGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGaa < 5:250194/149‑1 (MQ=255) gCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAg < 4:177311/148‑1 (MQ=255) cGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAgg < 8:251991/148‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGaa < 1:40611/139‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGaa > 2:40611/1‑139 (MQ=255) aaCCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAGGTGCGGGaa < 2:153861/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTTGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAGGTGCGGGaaa < 4:58477/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAGGTGCGGGaaa < 7:187138/149‑1 (MQ=255) gctggAGGGCTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGAGGGCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGATCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCTATTCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCTCCGAAGGTGCGGGAAACCt < 4:214858‑M2/144‑1 (MQ=255) tggAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCGGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAGGTGCGGGAAACCTgg > 4:284974‑M2/4‑149 (MQ=255) tggAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAGGTGCGGGAAACCTgg < 4:146873‑M2/146‑1 (MQ=255) | ACGCCTTTTACCTTCAGGCCATAGGCGATGTTCTCCAGCACGTTCATGTGCGGGAACAGCGCATAGTCCTGGAACACAGTGTTGACGTCACGTTGGTAGGGCGGCAGGCCAGCGGCCTCGACCCCTTGGATGCGGATCGAACCGCTGGAGGGTTGCTCGAAGCCTGCGATCAGGCGCAGGCAGGTGGTCTTGCCCGAGCCGGAAGGGCCGAGCATGGAAAAGAACTCGCCATCGATGATGTCGATGCTGACCTGGTCGACGGCCTTGACCTCGCCGAAGGTGCGGGAAACCTGG > NC_002947/1689220‑1689513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |