New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2719155 | 38 (0.780) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 7.3% | coding (282/585 nt) | nfuA | Fe/S biogenesis protein NfuA |
? | NC_002947 | = 2719178 | 41 (0.890) | coding (305/585 nt) | nfuA | Fe/S biogenesis protein NfuA |
GCCTGACGACACCGCCGTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGCCGTACTGCAGTTCGGTGGT > NC_002947/2719032‑2719323 | gCCTGACGACACCGCCGTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCga < 2:226168‑M2/149‑3 (MQ=255) ccTGACGACACCGCCGTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCgat < 2:55869‑M2/149‑4 (MQ=255) acgacACCGCCGTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCgatgg > 6:19676‑M2/1‑142 (MQ=255) gacACCGCCGTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCaa > 4:93225/1‑149 (MQ=255) acacGGCCGTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCgatggtc > 5:239682‑M2/1‑139 (MQ=255) acacCGCCGTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCgatggtc < 6:239682‑M2/146‑8 (MQ=255) acCGCCGTGGGTATGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATTGTCAACGa < 2:214735/149‑1 (MQ=255) ccgccgTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGaa < 3:178541/149‑1 (MQ=255) gggTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGcc < 1:298958/149‑1 (MQ=255) aaaaGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCTGGGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAACACAGCCCGATc > 1:218307/1‑148 (MQ=255) cTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCaacgaac < 3:93225/149‑1 (MQ=255) cTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCa < 5:174574/147‑1 (MQ=255) cTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAac > 2:115796/1‑149 (MQ=255) cTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAac < 5:104287/149‑1 (MQ=255) cTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGAt > 2:12960/1‑128 (MQ=255) cTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGAt < 1:12960/128‑1 (MQ=255) ttGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAac > 5:265997/1‑143 (MQ=255) ttGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAac < 6:265997/143‑1 (MQ=255) tCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGAcc > 4:129545/1‑149 (MQ=255) cTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCGGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAAcc < 8:95462/149‑1 (MQ=255) aaGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCaacgaa < 7:289588/107‑1 (MQ=255) aaGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCaacgaa > 8:289588/1‑107 (MQ=255) aGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTgg < 7:41309/149‑1 (MQ=255) gcTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATc > 7:186905/1‑130 (MQ=255) gcTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATc < 8:186905/130‑1 (MQ=255) gcTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGgccagc > 7:42040/1‑148 (MQ=255) gcTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGgccagc > 7:59788/1‑148 (MQ=255) ggTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCAt > 2:209687/1‑148 (MQ=255) ggTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCAt < 1:209687/148‑1 (MQ=255) ccACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATgg > 4:278157/1‑139 (MQ=255) ccACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATgg < 3:278157/139‑1 (MQ=255) cACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGTCCGAGATCAACCCCGGCCTg < 1:45886/127‑1 (MQ=255) cACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTg > 2:45886/1‑127 (MQ=255) accgaccgCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAg > 7:76797/1‑149 (MQ=255) cgCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGATCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCtggt < 1:226168/149‑1 (MQ=255) cgCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCtggt < 3:129545/149‑1 (MQ=255) cgCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCtggt < 8:59788/149‑1 (MQ=255) cgCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCtggt > 2:147200/1‑149 (MQ=255) gCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCtggtg < 1:55869/149‑1 (MQ=255) cTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCgatggtcagctggccacccatgcggtcggtggcgtagtcgcccagcgcgtcttccaggaagggtacgctgacggcgtcaaggtaagcagtgaagctttt < 3:208328‑M2/131‑100 (MQ=255) cTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCgatggtcagctggccacccatgcggtcggtggcgtagtcgaccagcgcgtcttccaggaagggtacgctgacggcgtcaaggtaagcagtgaagctttt > 4:208328‑M2/1‑32 (MQ=255) tGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCgatggtcagctggccacccatgcggtcggtggcgtagtcgaccagcgcgtcttccaggaagggtacgctgacggcgtcaaggtaagcagtgaagcttttcagacccacggcggtgtcg < 2:271644‑M2/149‑119 (MQ=255) cATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCACGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCa > 2:302099/1‑149 (MQ=255) aaGGCGCCAAACTCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCtg > 4:73051/1‑123 (MQ=255) aaGGCGCCAAACTCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCtg < 3:73051/123‑1 (MQ=255) aGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGcc > 6:281459/1‑149 (MQ=255) cgcCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGCCGTa < 2:91587/149‑1 (MQ=255) gcCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGCCGTAc > 6:210480/1‑149 (MQ=255) cAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGATCGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGCCGTACTg < 8:42040/149‑1 (MQ=255) cAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGCCGTACTg < 1:147200/149‑1 (MQ=255) aaaCGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGc < 4:200348/112‑1 (MQ=255) aaGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGCCGTACTGCAGTTCgg < 1:115796/149‑1 (MQ=255) tGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGCCGTACTGCAGTTCggtggt < 5:281459/149‑1 (MQ=255) | GCCTGACGACACCGCCGTGGGTCTGAAAAGCTTCACTGCTTACCTTGACGCCGTCAGCGTACCCTTCCT‑GGAAGACGCGCTGGTCGACTACGCCACCGACCGCATGGGTGGCCAGCTGACCATCAAGGCGCCAAACGCCAAGGTGCCGATGGTCAACGAAGACAGCCCGATCAACGAACGTATCAACTACTACCTACAGACCGAGATCAACCCCGGCCTGGCCAGCCATGGCGGCCAGGTGAGCCTGGTGGACGTGGTCGATGACGGCATTGCCGTACTGCAGTTCGGTGGT > NC_002947/2719032‑2719323 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |