New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3323930 | 45 (0.920) | 4 (0.090) | 3/250 | NT | 9.0% | coding (1204/1251 nt) | PP_2924 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3323977 | 38 (0.810) | coding (1157/1251 nt) | PP_2924 | hypothetical protein |
CCCGGGCCTGCTCGCGCCAGGTGGCGAACAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCTGCGCAGGCCGATGCCGGGGATACGCGCCA > NC_002947/3323832‑3324115 | cccGGGCCTGCTCGCGCCAGGTGGCGAACAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTcgc < 2:67145‑M2/149‑4 (MQ=255) cacGGGCCTGCTCGAGCCACCTGGCGAACAGGTCGTAGCAGACTAGTGCGATCACCCCCATAAACCCAACTCCACGGGCGCAGGCGGAACACTCAACCGCGCTCGCCGCAAGCCGCAGCCCAGCTCGGCCAGGGCGCGTCGGTAGTCGc > 8:275441/3‑149 (MQ=255) ccTGCTCGCGCCAGGTGGCGAACAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCTATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTaa < 3:225401/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGCGCCAGGTGGCGAACAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTaa < 3:129300/149‑1 (MQ=255) cTCGCGCCAGGTGGCGAACAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGa < 6:266869/148‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTGGCGAACAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGaa < 6:16445/149‑1 (MQ=255) gCGAACAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGcc < 6:100781/149‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑Tg < 7:275441/149‑1 (MQ=255) gtcgtcGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAg > 6:115573/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAg < 2:53508/149‑1 (MQ=255) gtcgCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCAc > 1:100662/1‑149 (MQ=255) gCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCAcgca < 1:200646/149‑1 (MQ=255) aGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCAcgcagc > 1:201812/1‑149 (MQ=255) gAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCAcgcagcgcag > 1:137418/1‑149 (MQ=255) tGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCt < 2:137418/148‑1 (MQ=255) ccccATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGgtc < 3:95090/149‑1 (MQ=255) cccATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCATCACgcagcgcagc < 8:90983/137‑1 (MQ=255) cccATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACgcagcgcagc > 7:90983/1‑137 (MQ=255) ccATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATc < 2:9955/134‑1 (MQ=255) ccATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATc > 1:9955/1‑134 (MQ=255) gCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATgcgc > 1:139258/1‑149 (MQ=255) cACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCTCTGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATgcgc < 1:67145/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTTTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTACAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATATCGGATGCGCGGCTcc < 6:26339/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGTGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGgc > 3:145039/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGgc > 5:182365/1‑149 (MQ=255) agcactcaAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCGGCGCCGCGCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAggg < 6:35808/147‑1 (MQ=255) actcaAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTcgcttgagtgagccgccagcgcccgtgcagatggggttatgggggtgatcgcactcgactgcgacgacctgttcgccacctggcgcgagcagg < 8:53429‑M2/149‑94 (MQ=255) actcaAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTcgcttgagtgagccgccagcgcccgtgcagatggggttatgggggtgatcgcactcgactgcgacgacctgttcgccacctggcgcgagcagg < 3:153388‑M2/149‑94 (MQ=255) ctcaAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAg < 7:238924/110‑1 (MQ=255) ctcaAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAg > 8:238924/1‑110 (MQ=255) tcaAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGAc > 1:29214/1‑148 (MQ=255) aaGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGAcc < 2:201812/147‑1 (MQ=255) aGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTcgcttgagtgagccgccagcgcccgtgcagatggggttatgggggtgatcgcactcgactgcgacgacctgttcgccacctggcgcgagcaggcccgg > 7:53429‑M2/1‑51 (MQ=255) aGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGa < 5:115573/149‑1 (MQ=255) cgcgcTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTcgcttgagtgagccgccagcgcccgtgcagatggggttatgggggtgatcgcactcgactgcgacgacctgttcgccacctggcgcgagcaggcccgggg > 4:153388‑M2/1‑49 (MQ=255) tCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTa > 3:302918/1‑149 (MQ=255) cGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGgtcgtc > 5:58130/1‑104 (MQ=255) cGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGgtcgtc < 6:58130/104‑1 (MQ=255) agcaAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGTGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCt < 4:145039/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCTgcg > 2:108819/1‑147 (MQ=255) gCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCTGCGCAGGc > 1:239125/1‑149 (MQ=255) gcAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCTGCGCAGGCCGATg > 5:12792/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGGCGTGTCGGTAGTCGATTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCTGGGCGACCAGACGCTGTACGCTGCGCAGGCCGATGCCgg < 6:182365/146‑1 (MQ=255) cTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCTGCGCAGGCCGATGCCGGGGATAc > 1:65519/1‑149 (MQ=255) gCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCTGCGCAGGCCGATGCCGGGGATACgcgc < 1:108819/149‑1 (MQ=255) gggTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCTGCGCAGGCCGATGCCGGGGATACGCGCCa < 2:246603/149‑1 (MQ=255) | CCCGGGCCTGCTCGCGCCAGGTGGCGAACAGGTCGTCGCAGTCGAGTGCGATCACCCCCATAACCCCATCTGCACGGGCGCTGGCGGCTCACTCAAGCGCGCTCGCAGCAAGCCGCTGCGCAGCTCGGCCTGGGCGGGTCGGTAGTCGCTTGTAACGATGAACGGCCGTGCCT‑TGTCCAGCACGCAGCGCAGCTGGATCAGGTCGTCATAACGGATGCGCCGCTCCCGGCGCAGGGCGACCAGACGCTGTACGCTGCGCAGGCCGATGCCGGGGATACGCGCCA > NC_002947/3323832‑3324115 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |