New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3910391 = | 52 (1.060) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.7% | coding (2340/2640 nt) | PP_3450 | TPR repeat‑containing protein |
? | NC_002947 | 3910458 = | 49 (1.050) | coding (2407/2640 nt) | PP_3450 | TPR repeat‑containing protein |
CAATGATTGGCGCATCGATGAGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACAACGCCTACCGCGGCTCGCTGAAAGT > NC_002947/3910316‑3910606 | cAATGATTGGCGCATCGATGAGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAAccc > 8:121020/1‑149 (MQ=255) aaTGATTGGCGCATCGATGAGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCt > 3:79969/1‑149 (MQ=255) aaTGATTGGCGCATCGATGAGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCt > 5:189096/1‑149 (MQ=255) cATCGATGAGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACg < 1:96736/149‑1 (MQ=255) aTGAGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCttt > 2:41935/1‑149 (MQ=255) aGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTc < 7:121020/149‑1 (MQ=255) aGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTc < 7:87721/149‑1 (MQ=255) aGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTc < 5:291178/149‑1 (MQ=255) aGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTc < 4:79969/149‑1 (MQ=255) gacgacTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGa < 6:56540/149‑1 (MQ=255) tGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACTCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCt < 8:256417/136‑1 (MQ=255) tGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTc > 6:214308/1‑123 (MQ=255) tGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTc < 5:214308/123‑1 (MQ=255) tGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCt > 7:256417/1‑136 (MQ=255) gaacgaacGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGt < 3:22071/138‑1 (MQ=255) gaacgaacGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGt > 4:22071/1‑138 (MQ=255) aacgaacgGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTccag > 1:129011/1‑149 (MQ=255) aacgGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTccagccag < 5:174333/149‑1 (MQ=255) aacgGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTccagccag < 1:74267/149‑1 (MQ=255) ctctACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCa < 1:41935/148‑1 (MQ=255) ctctACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAg > 3:84706/1‑149 (MQ=255) cGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACt > 8:57217/1‑149 (MQ=255) gctgcCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGgcg > 6:48954/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTccagccag > 7:256459/1‑115 (MQ=255) ccGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTccagccag < 8:256459/115‑1 (MQ=255) gcCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCgg < 8:241297/149‑1 (MQ=255) gcCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCgg < 7:57217/149‑1 (MQ=255) ccGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCggg < 4:189400/149‑1 (MQ=255) ggcgagctgcccggcagcttccaggcgtggccctgctggtagcgcgacagccaggcatggtcgccgCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGt > 2:155329‑M2/67‑149 (MQ=255) gcgagctgcccggcagcttccaggcgtggccctgctggtagcgcgacagccaggcatggtcgccgCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCggg < 8:48312‑M2/81‑1 (MQ=255) gcgagctgcccggcagcttccaggcgtggccctgctggtagcgcgacagccaggcatggtcgccgCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCggg > 7:48312‑M2/66‑146 (MQ=255) ACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCACCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGc > 6:217457‑M1/1‑149 (MQ=255) ccATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCg > 3:94640/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCgg < 6:225652/137‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCgg > 5:225652/1‑137 (MQ=255) gCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGc < 5:48954/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGc < 4:84706/149‑1 (MQ=255) cTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGc > 7:264828/1‑148 (MQ=255) gcgcTACCAGCAGGGCCACGCTTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAAtgg < 6:310823/148‑1 (MQ=255) tACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGtt > 1:223323/1‑149 (MQ=255) ccACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGAcc > 5:93044/1‑149 (MQ=255) gCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTa < 4:94640/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGc > 1:183006/1‑122 (MQ=255) cTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGc < 2:183006/122‑1 (MQ=255) cTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTcgacg > 6:53289/1‑137 (MQ=255) cTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTcgacg > 6:48582/1‑137 (MQ=255) cTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTcgacg < 5:53289/137‑1 (MQ=255) cTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTcgacg < 5:48582/137‑1 (MQ=255) cTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTAc > 5:306382/1‑148 (MQ=255) cTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACa < 8:264828/149‑1 (MQ=255) tGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACaa > 8:34969/1‑149 (MQ=255) ggAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACAAc > 4:301025/1‑149 (MQ=255) ggCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACAACGCCTACCGCgg < 6:306382/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACAACGCCTACCGCGGCTCGc > 3:141280/1‑149 (MQ=255) ccgCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACAACGCCTACCGCGGCTCGCTGa > 5:268479‑M2/4‑148 (MQ=255) cAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACAACGCCTACCGCGGCTCGCTGAAAgt < 3:301025/149‑1 (MQ=255) | CAATGATTGGCGCATCGATGAGGACGACTGGAACGAACGGTTCCTCTACCTCGATGCTGCCTGGTGGACCCGCGCCGGCGACCATGCCTGGCTGTCGCGCTACCAGCAGGGCCACGCCTGGAAGCTGCCGGGCAGCTCGCCGCAAACCCTCATGCCCTACGGCTTTGTCGAGTTCTCCAGCCAGGACCCCAGCAACGACTGGCGCCAGGACGCCCGCGCCGGGGTTGGCGTGCGCTGGCAATGGTGGTTCGACGACGACCGCTACAACGCCTACCGCGGCTCGCTGAAAGT > NC_002947/3910316‑3910606 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |