New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5432710 = | 52 (1.060) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 5.1% | intergenic (+45/+25) | PP_5713/hrpB | hypothetical protein/ATP‑dependent helicase HrpB |
? | NC_002947 | 5432794 = | 62 (1.310) | coding (2470/2529 nt) | hrpB | ATP‑dependent helicase HrpB |
GGGGCAATACGATGAATGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGCTTGACCTGCTGCCGGCCATTGGCGAT > NC_002947/5432651‑5432941 | gcgcacgacctatgccgaggtgaagaaagacctgaaagggcgatatccgaagcactactGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCagtagt > 8:288410‑M1/60‑149 (MQ=255) gcgcacgacctatgccgaggtgaagaaagacctgaaagggcgatatccgaagcactactGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCagt > 1:120118‑M1/60‑146 (MQ=255) gggCAATACGATGAATGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTg < 7:58853/149‑1 (MQ=255) tACGATGAATGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCg > 6:297693/1‑148 (MQ=255) cGATGAATGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCagt > 3:18463/1‑137 (MQ=255) cGATGAATGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCagt < 4:18463/137‑1 (MQ=255) gATGAATGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGata > 3:87583/1‑149 (MQ=255) aTGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGcc < 2:73140/149‑1 (MQ=255) aTGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGcc > 1:43280/1‑149 (MQ=255) aTGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGAAGTGCTTCGGATATCGcc > 5:296180/1‑149 (MQ=255) aCGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCCTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCttt > 1:245374/1‑148 (MQ=255) cGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCa < 6:33120/149‑1 (MQ=255) gACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAg > 6:178962/1‑149 (MQ=255) gACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAg < 4:75038/149‑1 (MQ=255) acacGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAg > 3:10802/1‑141 (MQ=255) acacGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAg < 4:10802/141‑1 (MQ=255) acacGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCAGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGtctttct > 1:196961/1‑149 (MQ=255) cacGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGtctttctt < 2:245374/149‑1 (MQ=255) cacGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGtctttctt < 6:44294/149‑1 (MQ=255) tcgtGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTc > 4:151713/1‑119 (MQ=255) gCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCgg < 5:178962/148‑1 (MQ=255) gATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTg > 6:278362/1‑149 (MQ=255) aTTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTg < 4:87583/148‑1 (MQ=255) ttttttCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTgcg > 1:179855/1‑149 (MQ=255) ttttttCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTgc < 3:188561/148‑1 (MQ=255) actactggccggacgaccctctggtggccgaggctaccgccagggccaagccgagagggagctgatgcacaccaccgagtgcggcaggccAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTgcgc > 8:288410‑M2/91‑149 (MQ=255) actggccggacgaccctctggtggccgaggctaccgccagggccaagccgagagggagctgatgcacaccaccgagtgcggcaggccAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTgcgc > 1:120118‑M2/88‑146 (MQ=255) CTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCCCATCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTg < 7:285747‑M1/149‑1 (MQ=255) tGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGtctttc < 4:227695/115‑1 (MQ=255) tGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTgg > 8:275284/1‑149 (MQ=255) ccGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGc < 2:68757/148‑1 (MQ=255) ccGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGc < 2:179855/148‑1 (MQ=255) cGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCa < 2:43280/149‑1 (MQ=255) cACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAgg > 3:179164/1‑149 (MQ=255) gtggtgTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTgg < 5:297693/149‑1 (MQ=255) gtgtGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGt > 3:52045/1‑148 (MQ=255) gtgCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACt > 2:148325/1‑131 (MQ=255) gtgCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACt < 1:148325/131‑1 (MQ=255) cATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTg < 2:60043/129‑1 (MQ=255) cATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTg > 1:60043/1‑129 (MQ=255) ggctaccgccagggccaagccgagagggagctgatgcacaccaccgagtgcggcaggccAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCa < 7:288410‑M2/90‑1 (MQ=255) cTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTgg > 2:202982/1‑135 (MQ=255) cTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTgg < 1:202982/135‑1 (MQ=255) ccTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGcc > 1:134088/1‑148 (MQ=255) ctctCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGa < 4:179164/149‑1 (MQ=255) tctcGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGAc > 3:138552/1‑149 (MQ=255) tctcGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGAc > 3:175036/1‑149 (MQ=255) tcGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGc < 2:261462/143‑1 (MQ=255) tcGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGc > 1:261462/1‑143 (MQ=255) cGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGAcgcg > 8:110902/1‑149 (MQ=255) ttGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTgg > 8:142294/1‑123 (MQ=255) ttGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTgg < 7:142294/123‑1 (MQ=255) gCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTgg > 8:266065/1‑120 (MQ=255) gCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTgg < 7:266065/120‑1 (MQ=255) cccTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGa > 4:104285/1‑148 (MQ=255) cccTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGa > 8:111913/1‑148 (MQ=255) ccTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGa > 6:155660/1‑136 (MQ=255) ccTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGa < 5:155660/136‑1 (MQ=255) gCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGAcagca < 2:196961/148‑1 (MQ=255) gCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGAcagc < 7:110902/147‑1 (MQ=255) tAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGt < 3:149679/137‑1 (MQ=255) tAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGt > 4:149679/1‑137 (MQ=255) tAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTg > 6:183942/1‑148 (MQ=255) tAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGc < 4:138552/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGc < 2:134088/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGc > 8:105066/1‑149 (MQ=255) tCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGCtt > 3:49981/1‑149 (MQ=255) accaGAGGGTCGTCCGGCCAGTTGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGCtt < 2:306474/143‑1 (MQ=255) accaGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGCtt > 1:306474/1‑143 (MQ=255) caGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGCTTGACctgct > 8:205760/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCTGGTGACAGCAGGTGCAGCTTGACCTGCTGCCGGCCATTgg < 6:296180/149‑1 (MQ=255) ggccAGTAGTGCTGCGGATAGCGCCCTTGCAGGTCTTGCTTCACCTCGGCATAGGTCGGGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGCTTGACCTGCTGCCGGCCATTGGc < 8:285747‑M2/145‑1 (MQ=255) cAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGGCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGCTTGACCTGCTGCCGGCCATTGGCGAt < 4:175036‑M2/148‑1 (MQ=255) | GGGGCAATACGATGAATGGCACGACCACTGACACGTCGTGGCCAGCGCATGATTTTTTCGGCCTGCCGCACTCGGTGGTGTGCATCAGCTCCCTCTCGGCTTGGCCCTGGCGGTAGCCTCGGCCACCAGAGGGTCGTCCGGCCAGTAGTGCTTCGGATATCGCCCTTTCAGGTCTTTCTTCACCTCGGCATAGGTCGTGCGCCAGAAACTGGCCAGGTCCTGGGTCACCTGCACCGGCCGACGCGCCGGTGACAGCAGGTGCAGCTTGACCTGCTGCCGGCCATTGGCGAT > NC_002947/5432651‑5432941 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |