New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5467023 | 61 (1.250) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.0% | coding (823/1002 nt) | rlpA | RlpA‑like lipoprotein |
? | NC_002947 | = 5467053 | 55 (1.180) | coding (793/1002 nt) | rlpA | RlpA‑like lipoprotein |
TGGATCTCGCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTATTGCCTGGGTCT > NC_002947/5466908‑5467199 | tGGATCTCGCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgc < 7:172390‑M2/149‑4 (MQ=255) gATCTCGCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgc > 7:118860‑M2/1‑144 (MQ=255) gATCTCGCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgc > 6:160592‑M2/1‑144 (MQ=255) ctcGCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTa > 7:238463/1‑149 (MQ=255) cGCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACTATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTAcc > 4:249118/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgcc > 7:161918‑M2/1‑138 (MQ=255) gCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCt > 6:243491/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCt < 1:15585/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGc < 8:238463/149‑1 (MQ=255) tGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgc < 5:281653‑M2/135‑6 (MQ=255) tGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgc > 6:281653‑M2/1‑130 (MQ=255) ccGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGaaa < 5:134670/147‑1 (MQ=255) ccGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACt < 7:275756/149‑1 (MQ=255) cGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGCGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTg > 5:264392/1‑149 (MQ=255) gATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgc < 3:210321‑M2/131‑6 (MQ=255) gATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgc > 4:210321‑M2/1‑126 (MQ=255) gATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGc < 5:243491/149‑1 (MQ=255) gCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCg > 7:35400/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTa > 3:121826/1‑149 (MQ=255) gcACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTAccgccg < 6:255788/149‑1 (MQ=255) gcgGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGtt > 2:283517/1‑138 (MQ=255) gcgGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGtt < 1:283517/138‑1 (MQ=255) tGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCAc < 8:254412/146‑1 (MQ=255) tGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCAc > 7:254412/1‑146 (MQ=255) gCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACgttg > 4:263267/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACgttg < 1:304136/149‑1 (MQ=255) gCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACgttg > 8:181616/1‑149 (MQ=255) aGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACgttgtt < 3:263267/149‑1 (MQ=255) ggTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGc < 3:63289/149‑1 (MQ=255) tCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCa < 8:214704/149‑1 (MQ=255) ctgGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACTATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCac < 3:249118/146‑1 (MQ=255) ctgGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCaccta > 7:169530/1‑149 (MQ=255) ctgGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCacc < 7:278459/147‑1 (MQ=255) tgGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCacctac > 7:60519/1‑149 (MQ=255) gTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCacctac < 2:104536/147‑1 (MQ=255) gTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCacctac < 8:172390/147‑1 (MQ=255) tACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTg > 7:109772/1‑148 (MQ=255) aCGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCa > 5:131620/1‑149 (MQ=255) gCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACg < 6:264392/149‑1 (MQ=255) gCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACg > 7:113342/1‑149 (MQ=255) gCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACg < 8:63419/149‑1 (MQ=255) gCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACg < 4:275800/149‑1 (MQ=255) aCGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACggg > 1:10107/1‑149 (MQ=255) gATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGTAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCCCGTTGTTGCCACCTACCTGCCCGGGTa > 8:132216/1‑149 (MQ=255) gCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACgg < 8:60519/149‑1 (MQ=255) tgaACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCt < 8:218955/149‑1 (MQ=255) acacGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCg > 7:229175/1‑149 (MQ=255) gTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGttgttg < 2:94866/110‑1 (MQ=255) gTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGttgttg > 1:94866/1‑110 (MQ=255) aTTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCtgtg > 5:84258/1‑149 (MQ=255) aTTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGACACTGCGTGCTGCtgtg < 8:169530/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCgggg > 5:237570/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCgggg > 2:268776/1‑149 (MQ=255) cTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCa < 8:113342/149‑1 (MQ=255) tGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGc > 1:155388/1‑124 (MQ=255) tGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGc < 2:155388/124‑1 (MQ=255) tGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCggg < 4:186977/143‑1 (MQ=255) tGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCggg > 3:186977/1‑143 (MQ=255) tGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCAc > 8:211643/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGc < 8:229175/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgccaagctcagcaccatggtcaatgcacccgtgttcatcagctcgatcgtgcgtaaccagcagaccctgcaccgcgtgcgcctggggccgatcggcagccagggcg > 3:58852‑M2/1‑39 (MQ=255) cTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgccaagctcagcaccatggtcaatgcacccgtgttcatcagctcgatcgtgcgtaaccagcagaccctgcaccgcgtgcgcctggggccgatcggcagccagggcg < 4:58852‑M2/148‑110 (MQ=255) ggCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAAcgcgccaagctcagcaccatggtcaatgcacccgtgttcatcagctcgatcgtgcgtaaccagcagaccctgcaccgcgtgcgcctggggccgatcggcagccagggcgaga < 7:274289‑M2/148‑113 (MQ=255) gcaACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGACACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTTCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGAcccgcccg < 5:261278/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTg < 6:84258/148‑1 (MQ=255) aGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCg < 8:35400/149‑1 (MQ=255) aGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCg < 2:10107/149‑1 (MQ=255) cGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTAtt < 1:268776/148‑1 (MQ=255) ggCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTATTGCCTgg < 4:121826/148‑1 (MQ=255) ggCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTATTGCCTgg < 7:181616/148‑1 (MQ=255) gCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCg < 6:199934/136‑1 (MQ=255) gCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCg > 5:199934/1‑136 (MQ=255) cGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTATTGCCTGGGTc > 1:33993/1‑149 (MQ=255) cGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTATTGCCTGGGTc > 7:244403/1‑149 (MQ=255) gAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTATTGCCTGGGTCt > 4:249299/1‑149 (MQ=255) aaCGCGGCTTCCTGCAAGATACTGGAACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCAGCTACCTGCACGGGTTGCAGGTGCGCTGCTTGCTGCTGTGGTGGCGGGTTCCAGTTCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTATTGCCTgg < 8:23315/144‑1 (MQ=255) aaCGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCACGGTACTGGCCGGTATTGCCTgg > 7:23315/1‑144 (MQ=255) | TGGATCTCGCCCTGGCTGCCGATCGGCCCCAGGCGCACGCGGTGCAGGGTCTGCTGGTTACGCACGATCGAGCTGATGAACACGGGTGCATTGACCATGGTGCTGAGCTTGGCGCGCAGCAACTCGGCAGCGTCCGGGTTGGCGAACGCGCCTACCTGCAAGAAACTGCCACCGTTACCGCCGGGCACGTTGTTGCCACCTACCTGCACGGGTACCACGGGCGCTGCGTGCTGCTGTGGTGGCGGGGTCCACTGCTCGACCCGCCCGGTACTGGCCGGTATTGCCTGGGTCT > NC_002947/5466908‑5467199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |