New junction evidence | |||||||||||
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cGGCATGTGGACGTTGCTGTTCgccgccggcatggccggtgaacagcaacgtccacatgccgttgtcaccggccagcgggcggatgctgcattcgatacgggtcaccaggccc < 7:238923‑M1/113‑92 (MQ=255) ggCATGTGGACGTTGCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTgaacagcaacgtccacatgccgttgtcaccggccagcgggcggatgctgcattcgatacgggtcaccaggcccaggcactggcgtgtgaggctgaggttgcgcatggccg < 2:4990‑M2/149‑111 (MQ=255) ggCATGTGGACGTTGCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATg < 6:371249/109‑1 (MQ=255) gCATGTGGACGTTGCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGc > 4:74394/1‑148 (MQ=255) gCATGTGGACGTTGCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGc < 3:74394/148‑1 (MQ=255) aTGTGGACGTTGCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGa > 4:160370/1‑149 (MQ=255) gtgGACGTTGCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGAt > 1:173162/1‑148 (MQ=255) gACGTTGCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCACTCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGATGAc < 1:74706/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGATGACCCg > 5:16998/1‑145 (MQ=255) cTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGATTCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACTGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGATGACCCGCAGAt > 8:66651/1‑149 (MQ=255) tGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTgaacagcaacgtccacatgccgttgtcaccggccagcgggcggatgctgcattcgatacgggtcaccaggcccaggcactggcgtgtgaggctgaggttgcgcatggccgcgtcccctccaatgag < 5:159738‑M2/149‑127 (MQ=255) tGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACa < 4:85266/105‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGATGAcc < 2:41001/141‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGATGAcc > 1:41001/1‑141 (MQ=255) ttCaccggccatgccggcggcgaacagcaacgtccacatgccgttgtcaccggccagcgggcggatgctgcattcgatacgggtcaccaggcccaggcactggcgtgtgaggctgaggttgcgcatggccgcgtcccctccaatgagcc > 7:283207‑M1/1‑3 (MQ=255) ttCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGc < 8:151188/85‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGc > 7:151188/1‑85 (MQ=255) ttCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATc > 6:278643/1‑124 (MQ=255) ttCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATc < 5:278643/124‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGATGACCCGCAGATCt < 4:5821/148‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGATGACCCGCAGATCTg > 7:184990/1‑149 (MQ=255) | TGAGGGTTTCGGGCTGAACAAGGCTCATTGGAGGGGACGCGGCCATGCGCAACCTCAGCCTCACACGCCAGTGCCTGGGCCTGGTGACCCGTATCGAATGCAGCATCCGCCCGCTGGCCGGTGACAACGGCATGTGGACGTTGCTGTTCGCCGCCGGCATGGCCGGTGAACAACCCTCCGCGATCAAGGCGCAGGGCCCGTTTCATGGGCCACTGGTGGCCGAATCGGTGCTCAATGCCA‑TCGTCGACAGCCTGACCATGCATGGTTATCAAGTGGCCGATGACCCGCAGATCTG > NC_002947/796416‑796710 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |