New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 911203 | 42 (0.740) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 6.6% | coding (1711/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
? | NC_002947 | = 911239 | 45 (0.830) | coding (1747/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
TTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCG > NC_002947/911060‑911349 | ttGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAggg < 4:67017/148‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGc > 7:86690/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCca < 4:266058/149‑1 (MQ=255) tGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCca > 7:178482/1‑148 (MQ=255) aGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGc > 1:87776/1‑148 (MQ=255) gtgtgCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGc < 8:287493/130‑1 (MQ=255) gtgtgCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGc > 7:287493/1‑130 (MQ=255) gCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCgggcgacgatggcactgtgggccgtggcgccgccctggg < 7:325017‑M1/149‑40 (MQ=255) gCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCggg < 4:25445‑M2/149‑4 (MQ=255) cAGGTGGAACCCGCGCACCCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGACCATCCGCTGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGGCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTggg < 8:288629/149‑1 (MQ=255) gTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCa > 3:19768/1‑148 (MQ=255) cccGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACcag > 4:113178/1‑148 (MQ=255) cccGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGACACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACcag > 6:82225/1‑148 (MQ=255) gAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGggcg < 5:281588/97‑1 (MQ=255) gAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGggcg > 6:281588/1‑97 (MQ=255) gAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTgg < 8:330029/136‑1 (MQ=255) gAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTgg > 7:330029/1‑136 (MQ=255) aaCCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTc < 2:87776/149‑1 (MQ=255) cTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGgcg > 4:196378/1‑149 (MQ=255) tATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGgcgc > 3:24816/1‑149 (MQ=255) tgtgCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCGGTGGTCGGcgcg < 8:86690/148‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCgg < 3:113178/149‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCgg < 7:102637/149‑1 (MQ=255) gtgCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCgggcgacgatggcactgtgggccgtggcgccgccctgggcgg > 5:134028‑M1/1‑79 (MQ=255) gtgCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCgggcgacgatggcactgtgggccgtggcgccgccctgggcgg < 6:134028‑M1/121‑43 (MQ=255) gatgaCCGAAATCGGTCCATCCAATGTCACCCGCCTGAACCCCAACCGGATTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAATGCAAACAACACCCGGCGGTTGGCAAAAACACCAGTCGACGGCCCgggaccaaac > 8:228436/1‑141 (MQ=255) aCCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATAct > 3:348253/1‑149 (MQ=255) cGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATActgc > 5:57006/1‑149 (MQ=255) tCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCGACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTg < 4:348253/149‑1 (MQ=255) ggTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTg < 8:252201/147‑1 (MQ=255) ggTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTg > 7:252201/1‑147 (MQ=255) ggTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGga < 8:238882/149‑1 (MQ=255) ggTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGga < 3:25445/149‑1 (MQ=255) tCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTgg > 8:52096/1‑149 (MQ=255) cGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGt < 3:196378/148‑1 (MQ=255) aTGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTAGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTAcg < 8:178482/149‑1 (MQ=255) gcccgccTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCgct < 6:57006/149‑1 (MQ=255) cccgccTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCgctg < 4:19768/149‑1 (MQ=255) ggACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTc > 4:288768/1‑148 (MQ=255) aCCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGAt > 6:112040/1‑149 (MQ=255) cccAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATa < 4:236768/111‑1 (MQ=255) cccAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATa > 3:236768/1‑111 (MQ=255) cAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGc > 7:236102/1‑148 (MQ=255) ccGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGc > 3:74456/1‑149 (MQ=255) gCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCgtggtg < 4:74456/148‑1 (MQ=255) cGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCgtggtgtgg > 6:338298/1‑149 (MQ=255) aTTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAg > 5:149918/1‑149 (MQ=255) ccGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCgggcggtgacaatgccggcaacccggttggggtccaggcgggcgacatcggatggaccgacttcggtcatcaccagcac > 5:134028‑M2/1‑42 (MQ=255) ccGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCgggcggtgacaatgccggcaacccggttggggtccaggcgggcgacatcggatggaccgacttcggtcatcaccagcac < 6:134028‑M2/121‑80 (MQ=255) gCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCAcc > 1:304334/1‑149 (MQ=255) cccgggcgacgatggcactgtgggccgtggcgccgccctgggcggtgacaatgccggcaacccggttggggtccaggcgggcgacatcggatggaccgacttcggtcatcaccagcacatagggttgctcgggttcaacctgcgcctgc < 4:25445‑M1/149‑147 (MQ=255) cccAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCgggcggtgacaatgccggcaacccggttggggtccaggcgggcgacatcggatggaccgacttcggtcatcaccagcacatagggttgctcgggttcaacctgcgcctgc < 7:325017‑M2/149‑111 (MQ=255) cccAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCg > 4:314257/1‑149 (MQ=255) | TTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCG > NC_002947/911060‑911349 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |