| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1101660 | 67 (1.180) | 4 (0.070) | 3/250 | NT | 5.5% | coding (241/486 nt) | mlaD | phospholipid ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 1101724 | 72 (1.320) | coding (305/486 nt) | mlaD | phospholipid ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
TCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTGCCGACCGACTCCACTGCCTCGATCCTGACCGCCGGTTTGCTTGGTGAGAAGTACATCGGCATCAGCGTTGGCGGTGAAGACGAAGTGCTCAAGGATGGTGCAACCATCC > NC_002947/1101513‑1101807 | tCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCg > 2:117453/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGt > 7:311900/1‑149 (MQ=255) gCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACg < 3:214374/149‑1 (MQ=255) gAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTg > 6:124603/1‑148 (MQ=255) cGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCCTGATTCCTACACCGGTCGGGAGACGTTGCAGCTg > 5:359522/1‑148 (MQ=255) cGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGATTAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTg > 2:109116/1‑148 (MQ=255) aCCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGAc > 1:319252/1‑147 (MQ=255) aCCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGAc > 4:241053/1‑147 (MQ=255) cTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAgt > 2:113321/1‑149 (MQ=255) cTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAgt < 4:234804/149‑1 (MQ=255) ataAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAgtcg > 5:167224/1‑149 (MQ=255) taAAGTTTATGCTTAGTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAgtc < 5:140549/147‑1 (MQ=255) aaaGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAgtcggt > 6:129386/1‑149 (MQ=255) aGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCTATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAgtcggtcg < 5:355549/149‑1 (MQ=255) aGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAgtcggtc > 8:41465/1‑148 (MQ=255) tttATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGAt < 2:238806/149‑1 (MQ=255) tGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAAc < 5:124603/148‑1 (MQ=255) cTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTg > 8:143628/1‑149 (MQ=255) 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gTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTGCCGACCGACTCCACTGCCTCg < 7:41465/149‑1 (MQ=255) aCGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTGCCGACCGACTCCACTGCCTCGATCCt > 2:94202/1‑149 (MQ=255) aCGGTCAGAGCTAAAGTCACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGAACGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTAGCAGCTGGACAACTCGGTCGATAACCTGccgac > 2:130737/1‑128 (MQ=255) ggTCAGAGCTAAAGTGACCATCCCCGCTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCCATCTGGACCGTGATTCATACACCGGTCGGGTGACCTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTCCCGACCGACTCCACTGCCTCGATCCtca > 8:69398/1‑147 (MQ=255) agagCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTGCCGACCGACTCCACTGCCTCGATCCTGAccgc > 2:77833/1‑149 (MQ=255) 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aaGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCaggatcgaggcagtggagtcggtcggcaggttatcgaccgacttgtccagctgcaacgtcacccgaccggtgtag < 4:82671‑M1/147‑76 (MQ=255) aaGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCaggatcgaggcagtggagtcggtcggcaggttatcgaccgacttgtccagctgcaacgtcacccgaccggtgtag > 3:82671‑M1/1‑72 (MQ=255) aaGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTGCCGACCGACTCCACTGCCTCGATCCTGACCGCCGGttt < 7:31779/148‑1 (MQ=255) aaGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTGCCGACCGACTCCACTGCCTCGATCCTGACCGCCGGTTTg > 3:29115/1‑149 (MQ=255) aGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGGGTGACGTTGCAGCTGGACAAGTCGGTCGATAACCTGCCGACCGACTCCACTGCCTCGATCCTGACCGCCGGTTTGc < 6:167224/149‑1 (MQ=255) 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NC_002947/1101513‑1101807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |