New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1747697 | 64 (1.130) | 5 (0.090) | 5/248 | NT | 8.3% | intergenic (‑189/+342) | PP_5473/PP_5474 | LuxR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1747758 | 50 (0.930) | intergenic (‑250/+281) | PP_5473/PP_5474 | LuxR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
CGAAGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGA > NC_002947/1747550‑1747845 | cGATGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGGTTATTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCATTTCGCGAGGCGCCTGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTTGGCTGCAtt < 4:255460/149‑1 (MQ=25) cGAAGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCATCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCAATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATc > 6:332583‑M1/1‑148 (MQ=255) gAAGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTg < 6:278565/149‑1 (MQ=255) ttcttGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGt < 6:354437/149‑1 (MQ=255) ttcttGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGt > 4:285624/1‑149 (MQ=255) cttGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAATGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGTCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTTCATTGGTCg < 6:40810/146‑1 (MQ=255) cttGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCGCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCGCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGt < 2:89893/147‑1 (MQ=255) gCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGa < 6:58269/146‑1 (MQ=255) gATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGAcgctc > 4:29085/1‑149 (MQ=255) tttGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGcc > 3:186238/1‑149 (MQ=255) tttGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGcc > 4:306158/1‑149 (MQ=255) tttGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGcc > 2:128138/1‑149 (MQ=255) ttGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCg > 2:295437/1‑149 (MQ=255) gtggtAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGt < 1:128138/147‑1 (MQ=255) ggtAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATcggtcgtgacgttcgccctccccttg > 2:231170‑M1/1‑123 (MQ=255) gtAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCTAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTAc > 4:337102/1‑148 (MQ=255) aGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCTAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGTCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTcc < 3:337102/149‑1 (MQ=255) aGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTc < 8:7497/148‑1 (MQ=255) tCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCg < 3:306158/149‑1 (MQ=255) tCGAGCAACCTCGAGAAAGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGAc > 7:26626/1‑149 (MQ=255) gAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCg > 2:4938/1‑118 (MQ=255) gAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCg < 1:4938/118‑1 (MQ=255) aGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATcggtcgtgacgttcgccctccccttggtccgggagg > 3:168985‑M1/1‑111 (MQ=255) aGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCaa < 6:318990/149‑1 (MQ=255) gCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAg < 7:56051/149‑1 (MQ=255) aCCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGa < 2:282631/141‑1 (MQ=255) aCCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGa > 1:282631/1‑141 (MQ=255) gagaAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCACGGGGAGGGc < 3:74422/149‑1 (MQ=255) agaAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCg < 8:45739/149‑1 (MQ=255) gaAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCTTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGTGGAGGGCg > 8:156099/1‑148 (MQ=255) aGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAAc < 4:186238/149‑1 (MQ=255) aTTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGa < 3:160414/137‑1 (MQ=255) aTTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGa > 4:160414/1‑137 (MQ=255) aTTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCa > 3:337440/1‑149 (MQ=255) ttGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCCTGCGCCGATAGGGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATcggtcgtgacgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcac < 5:332583‑M1/149‑57 (MQ=255) gCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGa > 8:48810/1‑149 (MQ=255) gCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAA‑GGGAGGGCGAACGTCACGAc > 2:173838/1‑149 (MQ=255) cAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGa < 3:29085/148‑1 (MQ=255) aaTTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGAcc > 7:158195/1‑149 (MQ=255) ttCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATcggtcgtgacgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaa < 1:231170‑M1/149‑63 (MQ=255) gcgAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATcggtcgtgacgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaatgc < 4:168985‑M1/149‑66 (MQ=255) gcgAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGatg < 5:301180‑M2/148‑4 (MQ=255) gcCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGt < 8:189370/149‑1 (MQ=255) ggCCTCGGCCGAGGTGGCGTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTaa < 1:142469/149‑1 (MQ=255) gCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAg < 8:158195/149‑1 (MQ=255) gCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAg < 1:295437/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGTGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGatg > 3:32943‑M2/1‑130 (MQ=255) tCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATTGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGtt > 1:30163/1‑149 (MQ=255) tCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGatg < 4:32943‑M2/133‑4 (MQ=255) ggCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTg < 4:335792/148‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTg > 3:335792/1‑148 (MQ=255) ggCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAA‑GGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTga < 1:173838/148‑1 (MQ=255) ccGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTAc > 2:313053/1‑91 (MQ=255) ccGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTAc < 1:313053/91‑1 (MQ=255) ccGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatg < 8:26626/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatgg < 6:301180/149‑1 (MQ=255) ggCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatgg > 6:240762/1‑149 (MQ=255) aTCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGTATGGGTCt > 4:125672/1‑148 (MQ=255) cgaTGCGCGTATAGTGATCGTGTCCTTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCAGTGGTCGTTACGCTCGCTGCAGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGGGAACGTCACGACCGATTCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTa < 7:156099/146‑1 (MQ=255) cATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGATGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATg < 7:48810/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATgg < 7:142649/149‑1 (MQ=255) gtgtCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACggg > 1:362169/1‑149 (MQ=255) cATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGc < 3:285624/149‑1 (MQ=255) cATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGAAGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGc < 2:288100/149‑1 (MQ=255) aTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGt > 6:266602/1‑119 (MQ=255) aTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGt < 5:266602/119‑1 (MQ=255) aTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCa > 6:231333/1‑149 (MQ=255) ttttGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCAcc > 7:129757/1‑149 (MQ=255) gATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCtt > 7:202534/1‑147 (MQ=255) ggggtgGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg < 6:275972/141‑1 (MQ=255) ggCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATgg < 5:240762/148‑1 (MQ=255) ggCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATgg < 4:337440/148‑1 (MQ=255) gCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACGGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgt < 5:231333/149‑1 (MQ=255) cTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATggg > 1:993/1‑107 (MQ=255) cTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATggg < 2:993/107‑1 (MQ=255) gCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGatgcagcccacaccgagatcaaaaatggacacgatcactatcggcgcatggataggccacctcggccgaggcctggcgcctcgc < 4:168985‑M2/149‑85 (MQ=255) cATcggtcgtgacgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaatgcagcccacaccgagatcaaaaatggacacgatcactatcggcgcatggataggccacctcggccgaggcctggcgcctcgc < 5:301180‑M1/148‑146 (MQ=255) cATcggtcgtgacgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaatgcagcccacaccgagatcaaaaatggacacgatcactatcggcgcatggataggccacctcggccga < 4:32943‑M1/133‑131 (MQ=255) cATcggtcgtgacgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaatgcagcccacaccgagatcaaaaatggacacgatcactatcggcgcatggataggccaccacggccga > 3:32943‑M1/1‑3 (MQ=255) ttGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGatgcagcccacaccgagatcaaaaatggacacgatcactatcggcgcatggataggccacctcggccgaggcctggcgcctcgcgaa < 1:231170‑M2/149‑88 (MQ=255) | CGAAGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGA > NC_002947/1747550‑1747845 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |