| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2130390 = | 57 (1.010) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.6% | coding (1809/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
| ? | NC_002947 | 2130432 = | 47 (0.860) | coding (1767/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD | |||||
CACCACTGGCATTCAATGACAGGCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAAC > NC_002947/2130245‑2130538 | caccacTGGCATTCAATGACAGGCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAgc < 7:82448/149‑1 (MQ=255)caccacTGGCATTCAATGACAGGCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAgc > 4:145413/1‑149 (MQ=255) tGGCATTCAATGACAGGCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTCGTCGTCCCGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGATCCgc‑gccggc > 8:122614/1‑145 (MQ=255) acctgttcgcctcacaatcgttgaccgaccgttacggcaatgatcgtcagtttggcctgagcgtgacggtacccttgcatttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgacctgcagcacaacgccaacggctacagccag < 7:3298‑M1/3‑1 (MQ=255) acctgttcgcctcacaatcgttgaccgaccgttacggcaatgatcgtcagtttggcctgagcgtgacggtacccttgcatttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgacctgcagcacaacgccaacggctacagccag > 8:3298‑M1/138‑140 (MQ=255) aaTGCCAGGGTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGAGGGCCGAGCGACAGTGGCGCTGTCTGGCGGGCGGGTTCGGCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTc < 7:122614/149‑1 (MQ=255) aaTGACAGGCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTc < 7:177597/149‑1 (MQ=255) tGACAGGCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGc > 6:314194/1‑149 (MQ=255) tGACAGGCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTCGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGc > 3:10573/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCGGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCg > 7:323665/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAgc < 5:19448/127‑1 (MQ=255) gCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAgc > 6:19448/1‑127 (MQ=255) tGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCt > 2:13213/1‑148 (MQ=255) tAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGt > 2:107220/1‑149 (MQ=255) ttGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGc > 2:178644/1‑149 (MQ=255) ttGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGc < 3:145413/149‑1 (MQ=255) gTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCAc > 4:265683/1‑149 (MQ=255) tCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACg > 3:342178/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgct > 1:184383/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCTCGGCTGGTGCTGTAGCTCA‑‑‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctgg < 1:98605/149‑1 (MQ=255) ttacggcaatgagcgtctgtttggcctgtgcggtacggtaccattgcatttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgaccttcagcacaacgccaacggctacagcCAGC‑GCGCGGGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctgg > 5:344757‑M1/107‑149 (MQ=255) ttCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggc < 8:323665/149‑1 (MQ=255) gTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggctg > 3:20600/1‑147 (MQ=255) gTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggctg > 1:342297/1‑147 (MQ=255) ccAGCACTCAGGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGtt > 8:311099/1‑149 (MQ=255) aGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTgg > 4:326636/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTtgtg < 4:226369/149‑1 (MQ=255) gCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgctgc < 5:314194/147‑1 (MQ=255) gCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgctgc < 6:126766/147‑1 (MQ=255) gCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAg > 7:246901/1‑149 (MQ=255) gCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGGGCTGTAGCTCATCGGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgctg < 1:107220/147‑1 (MQ=255) aGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTc > 1:218859/1‑148 (MQ=255) ggggCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctgg < 5:337885/117‑1 (MQ=255) ggggCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctgg > 6:337885/1‑117 (MQ=255) ggCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑TCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAgg < 4:342178/149‑1 (MQ=255) gCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGAGTGGCACACTTGCTGTAGCAGTTGGAGTTGTTCTGCAGGTCGaatct > 8:146752/1‑146 (MQ=255) ccTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTg > 3:359232/1‑104 (MQ=255) ccTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTg < 4:359232/104‑1 (MQ=255) ccTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTc > 5:286782/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgct < 2:253748/132‑1 (MQ=255) gATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACCGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgct > 1:253748/1‑132 (MQ=255) gCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTgg < 3:265683/149‑1 (MQ=255) tttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgacctgcagcacaacgccaacggctacagcCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggc > 7:90359‑M1/59‑102 (MQ=255) tttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgacctgcagcacaacgccaacggctacagcCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggc < 8:90359‑M1/44‑1 (MQ=255) aCAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGgc > 3:238902/1‑142 (MQ=255) aCAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGgc < 4:238902/142‑1 (MQ=255) cAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGAc < 6:286782/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGAc < 3:326636/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCA‑‑‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGaaa > 6:125578/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCA‑‑‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAAt < 5:125578/148‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAgg < 1:13213/146‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGt < 2:218859/148‑1 (MQ=255) ttCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGc > 1:324163/1‑149 (MQ=255) ttCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGc > 8:201230/1‑149 (MQ=255) gTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGca > 3:145168/1‑146 (MQ=255) gTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCt > 7:257120/1‑147 (MQ=255) tCAGGGCTC‑AGGCTGTTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGGGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGAGCGAATTGCAAGGGTACCGTCACGCTCAg < 4:145168/149‑1 (MQ=255) tCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAg > 2:21635/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGa > 7:340438/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGa < 2:342297/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGAc < 8:246901/149‑1 (MQ=255) gCTGGGGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGa < 4:20600/148‑1 (MQ=255) gTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACAGACGAt > 5:160962/1‑148 (MQ=255) tGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCa < 8:257120/149‑1 (MQ=255) gCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCAt > 4:279967/1‑149 (MQ=255) gTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGc > 4:101379/1‑149 (MQ=255) aGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGcc < 2:184383/148‑1 (MQ=255) gCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCg > 7:307121/1‑148 (MQ=255) CAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAAc > 4:10573‑M1/1‑149 (MQ=255) | CACCACTGGCATTCAATGACAGGCTGCGGTAGTTGTCGGCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAAC > NC_002947/2130245‑2130538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |