New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2130390 = | 57 (1.010) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.6% | coding (1809/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
? | NC_002947 | 2130432 = | 47 (0.860) | coding (1767/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
GCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGC > NC_002947/2130283‑2130574 | gCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCTCGGCTGGTGCTGTAGCTCA‑‑‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctgg < 1:98605/149‑1 (MQ=255) ttacggcaatgagcgtctgtttggcctgtgcggtacggtaccattgcatttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgaccttcagcacaacgccaacggctacagcCAGC‑GCGCGGGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctgg > 5:344757‑M1/107‑149 (MQ=255) ttCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggc < 8:323665/149‑1 (MQ=255) gTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggctg > 1:342297/1‑147 (MQ=255) gTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggctg > 3:20600/1‑147 (MQ=255) ccAGCACTCAGGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGtt > 8:311099/1‑149 (MQ=255) aGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTgg > 4:326636/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTtgtg < 4:226369/149‑1 (MQ=255) gCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgctgc < 5:314194/147‑1 (MQ=255) gCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgctgc < 6:126766/147‑1 (MQ=255) gCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAg > 7:246901/1‑149 (MQ=255) gCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGGGCTGTAGCTCATCGGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgctg < 1:107220/147‑1 (MQ=255) aGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTc > 1:218859/1‑148 (MQ=255) ggggCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctgg > 6:337885/1‑117 (MQ=255) ggggCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctgg < 5:337885/117‑1 (MQ=255) ggCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑TCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAgg < 4:342178/149‑1 (MQ=255) gCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGAGTGGCACACTTGCTGTAGCAGTTGGAGTTGTTCTGCAGGTCGaatct > 8:146752/1‑146 (MQ=255) ccTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTc > 5:286782/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgct < 2:253748/132‑1 (MQ=255) gATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACCGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGtgct > 1:253748/1‑132 (MQ=255) gCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTgg < 3:265683/149‑1 (MQ=255) tttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgacctgcagcacaacgccaacggctacagcCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggc > 7:90359‑M1/59‑102 (MQ=255) tttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgacctgcagcacaacgccaacggctacagcCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACgctggc < 8:90359‑M1/44‑1 (MQ=255) aCAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGgc > 3:238902/1‑142 (MQ=255) aCAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGgc < 4:238902/142‑1 (MQ=255) cAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGAc < 3:326636/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGAc < 6:286782/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCA‑‑‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGaaa > 6:125578/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCA‑‑‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAAt < 5:125578/148‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAgg < 1:13213/146‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGt < 2:218859/148‑1 (MQ=255) ttCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGc > 1:324163/1‑149 (MQ=255) ttCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGc > 8:201230/1‑149 (MQ=255) gTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGca > 3:145168/1‑146 (MQ=255) gTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCt > 7:257120/1‑147 (MQ=255) tCAGGGCTC‑AGGCTGTTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGGGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGAGCGAATTGCAAGGGTACCGTCACGCTCAg < 4:145168/149‑1 (MQ=255) tCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAg > 2:21635/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGa > 7:340438/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGa < 2:342297/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGAc < 8:246901/149‑1 (MQ=255) gCTGGGGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGa < 4:20600/148‑1 (MQ=255) gTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACAGACGAt > 5:160962/1‑148 (MQ=255) tGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCa < 8:257120/149‑1 (MQ=255) gCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCAt > 4:279967/1‑149 (MQ=255) gTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGc > 4:101379/1‑149 (MQ=255) aGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGcc < 2:184383/148‑1 (MQ=255) gCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCg > 7:307121/1‑148 (MQ=255) gccagcgtgccacgctcagcggcagcgacagcgcgcgcgcgctgGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGaaa < 8:90359‑M2/58‑1 (MQ=255) gccagcgtgccacgctcagcggcagcgacagcgcgcgcgcgctgGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGaaa > 7:90359‑M2/45‑102 (MQ=255) ccagcgtgccacgctcagcggcagcgacagcgcccgcgcgctgGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGAAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAATGGTACCGTACCGCACAGGCCAAACAGACGCTCATTGCCGTaa > 5:344757‑M2/44‑149 (MQ=255) CAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAAc > 4:10573‑M1/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCg > 8:145121/1‑135 (MQ=255) gcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCg < 7:145121/135‑1 (MQ=255) gcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAAcggtcg > 7:145277/1‑144 (MQ=255) gcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAAcggtcg < 8:145277/144‑1 (MQ=255) tGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGATCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGAt > 2:220156/1‑149 (MQ=255) gAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGaa > 6:321559/1‑147 (MQ=255) aGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACa < 3:101379/148‑1 (MQ=255) gCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAgg > 8:244872/1‑149 (MQ=255) cGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGt < 7:244872/149‑1 (MQ=255) gCACTCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTTCCGTGACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTa < 7:311099/149‑1 (MQ=255) gCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGt < 2:324163/148‑1 (MQ=255) gCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCCGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTa < 1:21635/149‑1 (MQ=255) cACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAg < 7:201230/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGc < 8:340438/149‑1 (MQ=255) ctgGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGt < 7:3298‑M2/137‑1 (MQ=255) ctgGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGt > 8:3298‑M2/4‑140 (MQ=255) | GCTTCGGTATAGCCAGCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTC‑AGGCTGGTGCTGTAGCTCAGC‑GCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGC > NC_002947/2130283‑2130574 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |