| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2316582 | 77 (1.360) | 5 (0.090) | 4/246 | NT | 6.1% | coding (386/1548 nt) | PP_2038 | long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
| ? | NC_002947 | = 2316620 | 82 (1.530) | coding (424/1548 nt) | PP_2038 | long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CCGGTCAATGCGCGCCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTGGTGTGCTCAAGGCTGCGATGCTCAGCGTG > NC_002947/2316434‑2316730 | ggTCAATGCGCGCCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGt < 3:296045/148‑1 (MQ=255) ggTCAATGCGCGCCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGt > 4:296045/1‑148 (MQ=255) gTCAATGCGCGCCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGt > 3:263841/1‑147 (MQ=255) tCAATGCGCGCCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAg < 7:152262/149‑1 (MQ=255) aaTGCGCGCCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGc < 5:321805/148‑1 (MQ=255) cgcgcCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCgggg < 8:274256/148‑1 (MQ=255) gcCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGt < 4:64097/149‑1 (MQ=255) tGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGa > 6:233382/1‑148 (MQ=255) ggATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGGGGGGCGGTGCCATCAGCt > 2:307719/1‑149 (MQ=255) aaGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGcc > 3:158920/1‑149 (MQ=255) aGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTg < 7:287892/134‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCg > 7:103657/1‑148 (MQ=255) aatCAGGTGCACAACGACGCCTGCAGAGTCGCGCTGATCGCCGATCCGCAACTATCCCCGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGAGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGAGGCGGAGACATCACCTATGACGCAct > 2:94741/3‑149 (MQ=255) cAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGtgagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgc < 5:126880‑M1/148‑36 (MQ=255) ggTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTgg > 2:183776/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTgg < 8:16548/149‑1 (MQ=255) gTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGCTGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGc < 4:4679‑M2/149‑2 (MQ=255) gCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGcc < 5:119981‑M2/148‑3 (MQ=255) 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cgCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTa < 1:183776/149‑1 (MQ=255) gCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacga < 1:53006‑M1/149‑52 (MQ=255) cTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTagc > 5:184837/1‑148 (MQ=255) cTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTagc > 1:183215/1‑148 (MQ=255) cAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTagccagc > 4:346094/1‑149 (MQ=255) cAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTagcca < 1:49913/147‑1 (MQ=255) gtgtCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAgccagcca < 3:346094/149‑1 (MQ=255) tgtCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGcccaagg > 2:314451‑M2/1‑128 (MQ=255) tgtCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGcccaagg < 1:314451‑M2/135‑8 (MQ=255) tCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAAt > 2:298826/1‑148 (MQ=255) 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aTCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGc < 5:233382/147‑1 (MQ=255) aTCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCg < 2:256775/148‑1 (MQ=255) aTCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGa > 5:246962/1‑149 (MQ=255) tCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGAc < 2:183215/149‑1 (MQ=255) cGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaagg > 7:188015‑M1/1‑78 (MQ=255) cGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaagg < 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aCCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTg > 6:195368/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTg > 6:223466/1‑149 (MQ=255) ccTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTgg < 3:40397/149‑1 (MQ=255) ccTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTg < 6:184837/148‑1 (MQ=255) tGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGAcctgc < 2:209337/101‑1 (MQ=255) gTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTGGTGTGc < 5:199228/149‑1 (MQ=255) aTCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTGGTGTGCTCAAGGCTg < 6:179771/148‑1 (MQ=255) tCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGcccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcgatcagcgcgacactgcaggc < 1:53006‑M2/149‑99 (MQ=255) tCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTGGTGTGCTCAAGGCTGc < 7:115345/148‑1 (MQ=255) tCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTGGTGTGCTCAAGGCTGc > 8:115345/1‑148 (MQ=255) ccTTGGGccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcgatcagcgcgacactgcaggcgtcgtt < 6:199228‑M1/149‑143 (MQ=255) ccTTGGGccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcgatcagcgcgaca > 2:314451‑M1/1‑7 (MQ=255) ccTTGGGccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcgatcagcgcgaca < 1:314451‑M1/135‑129 (MQ=255) ccTTGGGccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgc > 7:277613‑M1/1‑7 (MQ=255) ccTTGGGccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgc < 8:277613‑M1/114‑108 (MQ=255) ccTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGcccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcg > 7:188015‑M2/1‑45 (MQ=255) ccTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGcccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcg < 8:188015‑M2/123‑79 (MQ=255) ccTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGcccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctactgcctgcgggccagaaacgcctgggcgagttgcgcatcggcgatcagcgcgacactgcaggcgtcgtt < 6:124751‑M2/149‑105 (MQ=255) ttGGGccagcagtgcggcataggtgaagtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaaccgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcgagccgcccgacactccacgcgtccttga > 4:311677‑M1/1‑5 (MQ=255) gggccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcgatcagcgcgacactgcaggcgtcgttgag < 2:124525‑M1/148‑146 (MQ=255) gggTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCTGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTGGTGTGCTCAAGGCTGCGATGCTCAGc < 6:49924/148‑1 (MQ=255) ggccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcatcggcgatcagcgcgacactgcaggcgtcgttgagc < 5:119981‑M1/148‑147 (MQ=255) gccagcagtgcggcataggtgatgtcaccgccccgctcacccaaggtcacgatcaagcgtaacgcaggtacctcctgcctgcgggccagcaacgcctgggcgagttgcgcagcggcgatcagcgcgacactgcaggcgtcgttgagcac < 4:4679‑M1/149‑149 (MQ=255) gTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTGGTGTGCTCAAGGCTGCGATGCTCAGCGTg < 5:223466/149‑1 (MQ=255) | CCGGTCAATGCGCGCCTGGCACCGGATGAAGTGATTCAGGTGCTCAACGACGCCTGCAGTGTCGCGCTGATCGCCGATGCGCAACTCGCCCAGGCGTTGCTGGCCCGCAGGC‑AGGAGGTACCTGCGTTACGCTTGATCGTGACCTTGGGTGAGCGGGGCGGTGACATCACCTATGCCGCACTGCTGGCCCAAGGCAGTAGCCAGCCAATCAGCTGCGACCTGCCTGACGACGCCCTCGCCGTTTTGCATTACACCTCTGGCAGCTCTGGTGTGCTCAAGGCTGCGATGCTCAGCGTG > NC_002947/2316434‑2316730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |