New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2982157 = | 46 (0.810) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 7.4% | coding (208/1734 nt) | PP_2607 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2982210 = | 56 (1.030) | coding (155/1734 nt) | PP_2607 | hypothetical protein |
GGCGCAGGGCATAACGCAGTTCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCCGCGGTGGCGGCAGCGGCAAAACCACC > NC_002947/2982010‑2982304 | tctggagcacacacacaacagcttcgacctggttgtgctgggcagcggtgccggtggttttgccgctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttcTg < 3:222355‑M1/2‑1 (MQ=255) tctggagcacacacacaacagcttcgacctggttgtgctgggcagcggtgccggtggttttgccgctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttcTg < 8:168852‑M1/2‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCATAACGCAGTTCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTgg < 8:162777/149‑1 (MQ=255) tggagcacacacacaacagcttcgacctggttgtgctgggcagcggtgccggtggttttgccgctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttcTGgc < 1:62117‑M1/4‑1 (MQ=255) ggCATAACGCAGTTCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCgg < 6:4747/149‑1 (MQ=255) gCATAACGCAGTTCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGc > 1:263397/1‑149 (MQ=255) aGTTCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGc > 4:281207/1‑149 (MQ=255) aGTTCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCACCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGc < 2:106337/149‑1 (MQ=255) gTTCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCt < 4:174704/149‑1 (MQ=255) ttCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCtt < 1:296205/149‑1 (MQ=255) ggTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGt > 5:369174/1‑149 (MQ=255) tgtTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCg > 1:243355/1‑149 (MQ=255) ttCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCAc > 7:189547/1‑136 (MQ=255) ttCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCAc < 8:189547/136‑1 (MQ=255) ttCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGt > 3:111272/1‑149 (MQ=255) ctggttgtgctgggcagcggtgccggtggttttgccgctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttct < 2:133084‑M1/1‑1 (MQ=255) ctggttgtgctgggcagcggtgccggtggttttgccgctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttct > 1:133084‑M1/120‑120 (MQ=255) tCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCg < 5:340428/141‑1 (MQ=255) tCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCg > 6:340428/1‑141 (MQ=255) tCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTa > 1:59984/1‑149 (MQ=255) cagccagcGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTAc < 8:305688/148‑1 (MQ=255) tgctgggcagcggtgccggtggttttgccgctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttcTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAg < 3:63166‑M1/37‑1 (MQ=255) gccagcGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGc < 2:243355/149‑1 (MQ=255) ccagcGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGc > 6:203671/1‑148 (MQ=255) cggtggttttgccgctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttcTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCa > 4:63166‑M1/97‑149 (MQ=255) cATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATc > 2:95539/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGc < 4:111272/149‑1 (MQ=255) gCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGcc > 2:298676/1‑149 (MQ=255) gctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttcTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGaaa > 5:174308‑M1/84‑140 (MQ=255) gctgccgccaccgcggcccgccgtgggctgaaggtgctggtggtggaaaaagccgaacgctttggcggcacctcggcgatttcTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGaaa < 6:174308‑M1/57‑1 (MQ=255) gATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGa < 2:263397/147‑1 (MQ=255) gAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTgc > 1:17416/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTgc > 6:204456/1‑149 (MQ=255) aGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTgcc < 6:369174/148‑1 (MQ=255) tCGCCCAAGGCGGGGGCGTAGCCGTCGCCGATGCCCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCaaa < 7:290340/149‑1 (MQ=255) tCGCCCAAGGCGGGGGCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCaaa < 8:23785/149‑1 (MQ=255) ggggTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCtt < 5:204456/149‑1 (MQ=255) tCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGc > 2:176816/1‑127 (MQ=255) tCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGc < 1:176816/127‑1 (MQ=255) cGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGc < 2:59984/149‑1 (MQ=255) cGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCAcc > 7:168852/1‑149 (MQ=255) aTGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGTCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGACATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTATCCACCACCAGCACCtt > 3:263971/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCa < 1:298676/148‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAg < 1:213325/139‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAg > 2:213325/1‑139 (MQ=255) cTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGcc > 6:321836/1‑149 (MQ=255) ggtGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCCCCCCCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCcg > 6:21279/1‑149 (MQ=255) tGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCcgcg > 4:222355/1‑149 (MQ=255) gcgcATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTccaccacca > 1:20366/1‑122 (MQ=255) gcgcATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTccaccacca < 2:20366/122‑1 (MQ=255) gcATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCCGCGGTg > 4:11362/1‑149 (MQ=255) aTTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCCGCGGTggc > 6:206463/1‑149 (MQ=255) cTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTcca < 7:126298/107‑1 (MQ=255) cTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTcca > 8:126298/1‑107 (MQ=255) ggAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCCGCGGTGGCGGCAGCGGCaa < 2:17416/149‑1 (MQ=255) aaTCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCCGCGGTGGCGGCAGCGGCaaaa < 5:203671/149‑1 (MQ=255) aTCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCCGCGGTGGCGGCAGCGGCAAAac < 1:156219/149‑1 (MQ=255) ttGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCGCACGGCGGGCCGCGGTGGCGGCAGCGGCAAAaccacc > 3:54319/1‑149 (MQ=255) | GGCGCAGGGCATAACGCAGTTCGGTGTTCTGCTCCAGCCAGCGCAGCGCCTGGTGGCCATGCTCGATGAAGGCGTCGCCCAAGGCGGGGTCGTAGCCGTCGCCGATGACCTGCTTGAGGTAGGTGCGCATTGCCTCGGGGGAATCCTTGGCGCCGGCGTCACGGGCTTGGTCGGTGCCGTACAGCCACACCGCGCCGCCAGAAATCGCCGAGGTGCCGCCAAAGCGTTCGGCTTTTTCCACCACCAGCACCTTCAGCCCACGGCGGGCCGCGGTGGCGGCAGCGGCAAAACCACC > NC_002947/2982010‑2982304 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |