| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3487111 | 50 (0.880) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.9% | coding (900/1344 nt) | PP_3093 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 3487143 | 48 (0.900) | coding (868/1344 nt) | PP_3093 | hypothetical protein | |||||
AGAAGTCGGCTTCGGCCAGGCGCGGGTCGTGCAGTTGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCG > NC_002947/3486966‑3487259 | aGAAGTCGGCTTCGGCCAGGCGCGGGTCGTGCAGTTGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGAcgcg > 1:219064/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCCAGGCGCGGGTCGTGCAGTTGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCg > 6:142801/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGGCGCGGGTCGTGGAGTTGGCCTTGCGAGTGGGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCgtg < 1:44443/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGGGTCGTGCAGTTGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGTCCGGGTCGtggtgg < 1:180758/149‑1 (MQ=255) gcgGGTCGTGCAGTTTGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGATGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCCGGTCGTGGTGGTCGTAc > 2:270969/1‑149 (MQ=255) gTCGTGCAGTTGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCgg > 7:10696/1‑149 (MQ=255) tGCAGTTGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGAt < 5:245939/149‑1 (MQ=255) gCAGTTGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATg < 8:215095‑M2/149‑2 (MQ=255) ctgttGGCCTTGCCAGGGCGATGGGTTGGGCTGGGGCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCTACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATgt > 5:262309‑M2/3‑147 (MQ=255) aGTTGGCCTTGCCAGTGCGATTGCTTGGGCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGGCGAGCTTGACCATCGACGAGGCCGGGTCGTGGTGGTCGGACTCGGGGATg < 6:10183‑M2/147‑2 (MQ=255) ttGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATgtcgc < 8:231861‑M2/149‑6 (MQ=255) ttGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATgtcgc < 4:224902‑M2/149‑6 (MQ=255) gCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATgtcgctg > 3:224902‑M2/1‑141 (MQ=255) gCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATgtcgct < 4:197839‑M2/147‑7 (MQ=255) cTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACatccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtcgctggta > 4:261487‑M1/1‑107 (MQ=255) cTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGc < 3:197839/149‑1 (MQ=255) ttGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCggg < 2:276932/135‑1 (MQ=255) ttGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGAGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCggg > 1:276932/1‑135 (MQ=255) gCCATTGCGTTGGCTTGTTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCt < 8:127608/147‑1 (MQ=255) ccAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCAGTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTgg < 7:6070/148‑1 (MQ=255) gtttGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATTCACTGGTTGTGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGt < 8:119706/146‑1 (MQ=255) gCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGTATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGt < 7:231861/148‑1 (MQ=255) gTCTGGGTCAGGTTGTTGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGt > 6:320264/1‑149 (MQ=255) ggTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTcag > 8:218144/1‑147 (MQ=255) gTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCggg < 3:38278/110‑1 (MQ=255) gTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCggg > 4:38278/1‑110 (MQ=255) tCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACatccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtcgctg < 4:193713‑M1/119‑40 (MQ=255) tCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACatccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtcgctg > 3:193713‑M1/1‑80 (MQ=255) tCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAgg < 6:28804/149‑1 (MQ=255) aGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGa > 2:124108/1‑118 (MQ=255) gTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCTTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAgg < 8:74070/130‑1 (MQ=255) gTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCTTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAgg > 7:74070/1‑130 (MQ=255) gTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGgccgc > 6:341731/1‑149 (MQ=255) gatgaCAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGccgccg < 5:341731/148‑1 (MQ=255) gaCAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTcagca > 5:126310/1‑137 (MQ=255) gaCAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGc > 3:71847/1‑147 (MQ=255) gaCAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCCTCGACCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAAGCCGCCGGc > 1:304180/1‑147 (MQ=255) aCAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCaa < 4:326505/148‑1 (MQ=255) gTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAgg < 5:142801/148‑1 (MQ=255) gTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAgg > 7:204010/1‑148 (MQ=255) ggCACGAGGTTGTCGAGCATCACCCGGATCTTTTGGTCGAGCTTGACCTGAGACGCGGCCGGGTGGTGGTGGTCGTACTGGGGGATGTCGCTTAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAg < 1:270969/149‑1 (MQ=255) gacgTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTa > 5:262668/1‑147 (MQ=255) gTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGgc > 6:178861/1‑149 (MQ=255) tCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGctc > 5:164289/1‑149 (MQ=255) gAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCgtgg > 5:355741/1‑55 (MQ=255) gAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCgtgg < 6:355741/55‑1 (MQ=255) cATCACCGGTCTCATTTCGTCTAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGGGGTGGTCGGACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGTTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGt < 5:10183/149‑1 (MQ=255) cATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGt < 2:219064/149‑1 (MQ=255) cATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCggg < 5:178861/148‑1 (MQ=255) tttCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTgg < 8:237511/133‑1 (MQ=255) tttCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTgg > 7:237511/1‑133 (MQ=255) tttCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTgg < 8:204010/149‑1 (MQ=255) tttCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTgg > 1:101328/1‑149 (MQ=255) tttCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTgg < 7:218144/149‑1 (MQ=255) ttacgtcgAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCACGCGCGGGTgg > 6:56451/4‑149 (MQ=255) cgtcgAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGc < 8:10696/148‑1 (MQ=255) cgtcgAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGc < 7:215095/148‑1 (MQ=255) tacCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATgtcgctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctgacccagaccaagccatcgcactggcaag > 4:261487‑M2/2‑42 (MQ=255) aCCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAg < 6:262668/148‑1 (MQ=255) cAGCGACatccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtcgctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctgacccagaccaagccatcgcactggcaaggc > 3:224902‑M1/1‑7 (MQ=255) cAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATgtcgctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctga < 4:193713‑M2/119‑81 (MQ=255) cAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATgtcgctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctga > 3:193713‑M2/1‑39 (MQ=255) cAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCa < 6:109709/137‑1 (MQ=255) cAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCa > 5:109709/1‑137 (MQ=255) cAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGATGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCa < 2:258042/137‑1 (MQ=255) aGCGACatccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtcgctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctgacccagaccaagccatcgcactggcaaggc < 4:197839‑M1/147‑142 (MQ=255) gCGACatccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtcgctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctgacccagaccaagccatcgcactggcaaggccaa < 8:231861‑M1/149‑145 (MQ=255) gCGACatccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtcgctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctgacccagaccaagccatcgcactggcaaggccaa < 4:224902‑M1/149‑145 (MQ=255) cGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCt > 3:243176/1‑149 (MQ=255) aCatccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtagctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctgccccagcccaacccatcgccctggcaaggccaacag > 5:262309‑M1/1‑2 (MQ=255) catccccgagtccgaccaccacgacccggcctcgtcgatggtcaagctcgccgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctgacccagcccaagcaatcgcactggcaaggccaact < 6:10183‑M1/147‑147 (MQ=255) catccccgagtacgaccaccacgacccggccgcgtcgctggtcaagctcgacgaaatgatccgggtgatgctcgacaacgtcgtgcccaaccagtgcattgtcatcaacctgacccagaccaagccatcgcactggcaaggccaactgc < 8:215095‑M1/149‑149 (MQ=255) | AGAAGTCGGCTTCGGCCAGGCGCGGGTCGTGCAGTTGGCCTTGCCAGTGCGATGGCTTGGTCTGGGTCAGGTTGATGACAATGCACTGGTTGGGCACGACGTTGTCGAGCATCACCCGGATCATTTCGTCGAGCTTGACCAGCGACGCGGCCGGGTCGTGGTGGTCGTACTCGGGGATGTCGCTGAGCTGGGTGTCCAGGGTGAAGGTCAGCAGGCCGCCGGCAAGGTCGGCCAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCG > NC_002947/3486966‑3487259 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |