New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4281263 = | 35 (0.620) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 7.4% | coding (161/1197 nt) | PP_3751 | cyanate transporter |
? | NC_002947 | 4281337 = | 42 (0.780) | coding (87/1197 nt) | PP_3751 | cyanate transporter |
GCCACCAGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTT > NC_002947/4281116‑4281408 | ctgccaggccagccgagccgggataatggccagttcctgttacaagagaaccgactcacaatgagcgctgtactgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaac > 5:280205‑M1/148‑148 (MQ=255) ccaccaGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGccc < 4:320900/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGccc < 6:73088/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGcc > 2:195584/1‑148 (MQ=255) gccaggccagccgagccgggataatggccagttcctgttacaagagaaccgactcacaatgagcgctgtactgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCa < 1:275112‑M1/4‑1 (MQ=255) gccaggccagccgagccgggataatggccagttcctgttacaagagaaccgactcacaatgagcgctgtactgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCa < 4:308759‑M1/4‑1 (MQ=255) ccaggccagccgagccgggataatggccagttcctgttacaagagaaccgactcacaatgagcgctgtactgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaccc > 8:339060‑M1/145‑147 (MQ=255) ccaGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATg < 7:319443/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAgc > 3:109495/1‑149 (MQ=255) gcgcCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGcc > 2:251846/1‑149 (MQ=255) gcCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGt < 4:285731/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGg‑cc < 5:349742/146‑1 (MQ=255) ccAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGg‑cc > 6:349742/1‑146 (MQ=255) tcttcAGGCGCAACACGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCAAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGATGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGACAGCAAGG‑CCGCctgc > 2:7200/5‑149 (MQ=255) gcgcCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAAc > 8:114846/1‑149 (MQ=255) aggcaggcCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGcc > 5:8069/1‑149 (MQ=255) acaatgagcgctgtactgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGt < 6:14322‑M1/59‑1 (MQ=255) gcCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCCGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCt > 7:85495/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCCCCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTCACCCAGGACGGTGCTGGCGCGCagg > 3:20845/1‑147 (MQ=255) aacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTc > 5:14322‑M1/73‑149 (MQ=255) ccAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCg < 5:79354/149‑1 (MQ=255) acctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCg > 4:55672‑M1/72‑149 (MQ=255) cAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa < 2:80276/149‑1 (MQ=255) cccAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACgg > 8:135176/1‑149 (MQ=255) ccAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACggg < 1:195584/149‑1 (MQ=255) cAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGTATGGGTTCGAGTAACGGGc < 7:114846/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTg < 2:341440/120‑1 (MQ=255) aTGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTg > 1:341440/1‑120 (MQ=255) cgccATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGTCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa < 1:74756/133‑1 (MQ=255) cgccATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa > 2:74756/1‑132 (MQ=255) tGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAg > 5:276378/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCTCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCa < 7:135176/149‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCTAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAg < 4:109495/149‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAg > 5:97552/1‑149 (MQ=255) cGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGtt > 7:315122/1‑149 (MQ=255) cAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACg > 4:276866/1‑149 (MQ=255) cAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACg > 5:344531/1‑149 (MQ=255) aCGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCcagc < 3:276866/149‑1 (MQ=255) cGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCa < 8:292757/122‑1 (MQ=255) cGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCa > 7:292757/1‑122 (MQ=255) cGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCcagca < 1:251846/149‑1 (MQ=255) cAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATc < 6:97552/148‑1 (MQ=255) aCAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCAcc < 1:7200/149‑1 (MQ=255) cAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCa < 6:8069/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCaa > 3:202553/1‑148 (MQ=255) aGGCCCATGCACAGCCCCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGtt < 8:85495/149‑1 (MQ=255) aGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGt > 8:226444/1‑148 (MQ=255) gCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGAt < 4:207632/93‑1 (MQ=255) gCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGAt > 3:207632/1‑93 (MQ=255) | GCCACCAGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTT > NC_002947/4281116‑4281408 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |