New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4281263 = | 35 (0.620) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 7.4% | coding (161/1197 nt) | PP_3751 | cyanate transporter |
? | NC_002947 | 4281337 = | 42 (0.780) | coding (87/1197 nt) | PP_3751 | cyanate transporter |
GCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATCCCGGCTCGGCTGGCCTGGCAG > NC_002947/4281191‑4281483 | aacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTc > 5:14322‑M1/73‑149 (MQ=255) ccAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCg < 5:79354/149‑1 (MQ=255) acctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCg > 4:55672‑M1/72‑149 (MQ=255) cAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa < 2:80276/149‑1 (MQ=255) cccAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACgg > 8:135176/1‑149 (MQ=255) ccAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACggg < 1:195584/149‑1 (MQ=255) cAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGTATGGGTTCGAGTAACGGGc < 7:114846/149‑1 (MQ=255) cgccATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGTCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa < 1:74756/133‑1 (MQ=255) cgccATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa > 2:74756/1‑132 (MQ=255) tGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAg > 5:276378/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCTCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCa < 7:135176/149‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCTAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAg < 4:109495/149‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAg > 5:97552/1‑149 (MQ=255) cGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGtt > 7:315122/1‑149 (MQ=255) cAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACg > 5:344531/1‑149 (MQ=255) cAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACg > 4:276866/1‑149 (MQ=255) aCGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCcagc < 3:276866/149‑1 (MQ=255) cGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCa > 7:292757/1‑122 (MQ=255) cGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCa < 8:292757/122‑1 (MQ=255) cGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCcagca < 1:251846/149‑1 (MQ=255) cAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATc < 6:97552/148‑1 (MQ=255) aCAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCAcc < 1:7200/149‑1 (MQ=255) cAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCa < 6:8069/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCaa > 3:202553/1‑148 (MQ=255) cgaacccatgcgcgccagcaccggcctgggttaccagcaggcggccttgctgacggcgctaccggtgctgtgcatgggTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGt > 4:55672‑M2/79‑149 (MQ=255) aGGCCCATGCACAGCCCCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGtt < 8:85495/149‑1 (MQ=255) aGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGt > 8:226444/1‑148 (MQ=255) gaacccatgcgcgccagcaccggcctgggttaccagcaggcggccttgctgacggcgctaccggtgctgtgcatgggTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGtt > 5:14322‑M2/78‑149 (MQ=255) gCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGAt < 4:207632/93‑1 (MQ=255) gCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGAt > 3:207632/1‑93 (MQ=255) caGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAgcgc < 7:226444/149‑1 (MQ=255) cACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCa < 4:202553/149‑1 (MQ=255) aCCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCAt < 8:315122/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTa > 4:249735/1‑136 (MQ=255) ggTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTa < 3:249735/136‑1 (MQ=255) accggcctgggttaccagcaggcggccttgctgacggcgctaccggtgctgtgcatgggTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATtgt < 6:14322‑M2/90‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCgg < 6:276378/149‑1 (MQ=255) aaGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTtctc > 8:44731/1‑146 (MQ=255) aaGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTtctc < 7:44731/146‑1 (MQ=255) aGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCcagca > 4:154369/1‑96 (MQ=255) aGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCcagca < 3:154369/96‑1 (MQ=255) cgccTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTaa > 2:229842/1‑147 (MQ=255) ctgctgGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCTCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAgg > 1:97215/1‑148 (MQ=255) tgGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTg > 3:308759/1‑149 (MQ=255) ggTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTgg > 6:311030/1‑149 (MQ=255) aCCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCAt > 2:275112/1‑149 (MQ=255) cccAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAgcg < 4:306168/108‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAgcg > 3:306168/1‑108 (MQ=255) ccAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTa > 2:262463/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATccc > 6:301385/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATCCcggctcgg < 5:301385/149‑1 (MQ=255) cgcgcATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACT‑GCCATTATCCCGGCTCGGctggc < 2:161798/149‑1 (MQ=255) gcgcATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCTCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATCCCGGCTCGGctggc < 2:97215/149‑1 (MQ=255) tgggTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATCCCGGCTCGGctggcctggc < 4:308759‑M2/145‑1 (MQ=255) tgggTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATCCCGGCTCGGctggcctggc < 1:275112‑M2/145‑1 (MQ=255) gggTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATCCCGGCTCGGctggcctgg > 8:339060‑M2/4‑147 (MQ=255) gTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATCCCGGCTCGGCTGGCCTGGCAg > 5:280205‑M2/2‑148 (MQ=255) | GCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCACAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGG‑CCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGTTCAGTACAGCGCTCATTGTGAGTCGGTTCTCTTGTAACAGGAACTGGCCATTATCCCGGCTCGGCTGGCCTGGCAG > NC_002947/4281191‑4281483 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |