New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4805570 = | 33 (0.580) | 4 (0.080) | 3/244 | NT | 10.5% | coding (2322/2832 nt) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 4805636 = | 37 (0.700) | coding (2256/2832 nt) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
AACTGTGGTGGTTGAGCACCTGCGTCTCCAAGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGACAAAGTCGGCCTCGGCCCAGCTCCAGCGGTTGAAGCCGTGCACGCTC > NC_002947/4805422‑4805717 | aaCTGTGGTGGTTGAGCACCTGCGTCTCCAAGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAg > 2:28207/1‑149 (MQ=255) gcgccgattccgtttgcccagctggcgcagaaggcccacgacatggggctggttaccggcgtgagcgtgcacggcttcaaccgctggagctgggccgaggccgactttgtcatcgatggcgtgcgcgagcgcttcccgctcgatGcc > 6:76652‑M1/145‑147 (MQ=255) gcgccgattccgtttgcccagctggcgcagaaggcccacgacatggggctggttaccggcgtgagcgtgcacggcttcaaccgctggagctgggccgaggccgactttgtcatcgatggcgtgcgcgagcgcttcccgctcgatGcc > 6:81854‑M1/145‑147 (MQ=255) ccgattccgtttgcccagctggcgcagaaggcccacgacatggggctggttaccggcgtgagcgtgcacggcttcaaccgctggagctgggctcgaggccgactttgtcatcgatggcgtgcgcgagcgcttcccgctcgatGCCATgg > 1:98778‑M1/143‑149 (MQ=255) gtTGAGCACCTGCGTCTCCAAGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGc < 1:28207/149‑1 (MQ=255) gtTGAGCACCTGCGTCTCCAAGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGc > 3:262942/1‑149 (MQ=255) gTCTCCAAGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTAAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCct > 5:219816/1‑148 (MQ=255) tctcCAAGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCcttc > 2:203246/1‑149 (MQ=255) ccAAGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTg < 2:220792/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGc < 5:60982/149‑1 (MQ=255) gCCTTTGTTGATCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCa > 5:8799/1‑149 (MQ=255) ccTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCAt > 1:126686/1‑118 (MQ=255) ccTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCAt < 2:126686/118‑1 (MQ=255) tgaccttgacctCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCa > 1:25097/1‑149 (MQ=255) tgaccttgacctCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCa > 3:358397/1‑149 (MQ=255) ccttgacctCGACGATGGTCGCCACAGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCg < 6:219816/149‑1 (MQ=255) tgacctCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCAt < 2:7446/105‑1 (MQ=255) tgacctCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCAt > 1:7446/1‑105 (MQ=255) gctggttaccggcgtgagcgtgcacggcttcaaccgctggagctgggccgaggccgactttgtcatcgatggcgtgcgcgagcgcttcccgctcgatGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTAt < 7:157525‑M1/52‑1 (MQ=255) ctCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTg < 7:17381/124‑1 (MQ=255) ctCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTg > 8:17381/1‑124 (MQ=255) ctCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTAtt > 3:311401/1‑149 (MQ=255) tCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCa < 5:300317/130‑1 (MQ=255) tCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCa > 6:300317/1‑130 (MQ=255) tCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATg > 5:323834/1‑149 (MQ=255) agcgtgcacggcttcaaccgctggagctgggccgaggccgactttgtcatcgatggcgtgcgcgagcgcttcccgctcgatGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCa > 8:157525‑M1/82‑148 (MQ=255) ccGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATc > 6:364164/1‑148 (MQ=255) cTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCgg < 4:311401/149‑1 (MQ=255) acggcttcaaccgctggagctgggccgaggccgactttgtcatcgatggcgtgcgcgagcgcttcccgctcgatGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCa < 6:96101‑M1/67‑1 (MQ=255) acggcttcaaccgctggagctgggccgaggccgactttgtcatcgatggcgtgcgcgagcgcttcccgctcgatGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCa > 5:96101‑M1/75‑141 (MQ=255) gtagtcGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCggg > 1:31930/1‑148 (MQ=255) tagtagGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCggg > 4:174789/1‑147 (MQ=255) tagtagGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGaa < 8:220431/149‑1 (MQ=255) tagtagGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGaa < 1:203246/149‑1 (MQ=255) cATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCa > 2:147665/1‑149 (MQ=255) gCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGc > 2:357485/1‑148 (MQ=255) ttCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGAt > 4:340575/1‑149 (MQ=255) aGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGa > 3:122924/1‑148 (MQ=255) gTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGACAAAGtcggcctcgg < 1:357485/149‑1 (MQ=255) gCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGACAAAGtcggcctcggcc > 7:191591/1‑147 (MQ=255) gCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGACAAAGTCGGCCTCGGCCCa < 8:191591/149‑1 (MQ=255) cGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCAc < 4:234625/117‑1 (MQ=255) cGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCAc > 3:234625/1‑117 (MQ=255) tGCGGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCAAATTGGCATTCCCCGCACCATCGCAGTATTTCACCGGCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGACAAAGTCGGCGTCGGCGCAGCTCCAGCg > 8:67190/1‑149 (MQ=255) ggTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGACAAAGTCGGCCTCGGCCCAGCTCCAGCGGTTGAAGCCGTg > 2:30312/1‑148 (MQ=255) GCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGACAAAGTCGGCCTCGGCCCAGCTCCAGCGGTTGAAGCCGTGCACGCTc > 5:364164‑M1/1‑148 (MQ=255) | AACTGTGGTGGTTGAGCACCTGCGTCTCCAAGGTGCCTTTGTTGACCTTGACCTCGACGATGGTCGCCACCGGGCTGTAGTAGGTGACCATGGCATTGTTCAGCTGGGTGTCGGGGTAGGCCGCATTCTGCCGGTCGAGCAGGTGATAGCCATGGCTGCCCATCTGCGCCTTCTTGGCATTCACCGCACCATCGCCGTATTTCACCGCCATGGCATCGAGCGGGAAGCGCTCGCGCACGCCATCGATGACAAAGTCGGCCTCGGCCCAGCTCCAGCGGTTGAAGCCGTGCACGCTC > NC_002947/4805422‑4805717 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |