New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5137095 | 53 (0.940) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.3% | coding (507/894 nt) | PP_4522 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 5137124 | 58 (1.080) | coding (478/894 nt) | PP_4522 | LysR family transcriptional regulator |
TGCTTGAAGCCATGCCGGGCCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTA > NC_002947/5136952‑5137241 | tgCTTGAAGCCATGCCGGGTCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACaa > 8:182015/1‑149 (MQ=255) gCTTGAAGCCATGCCGGGCCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACTGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAAc > 5:321419/1‑149 (MQ=255) aaGCGATGCCGGGCCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCt < 2:180433/148‑1 (MQ=255) aaGCCATGCCGGGCCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCt < 1:224947/148‑1 (MQ=255) aGCCATGCCGGGCCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTgg < 5:225393/149‑1 (MQ=255) ccATGCCGGGCCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTgg > 4:222819/1‑147 (MQ=255) ggCCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGc < 3:104462/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATccg < 1:265207‑M2/149‑4 (MQ=255) ccTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATccgc > 4:130046‑M2/1‑145 (MQ=255) cTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCa > 8:84939/1‑134 (MQ=255) cTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCa < 7:84939/134‑1 (MQ=255) cTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCATGCCGCTCATccgc < 2:289953‑M2/148‑5 (MQ=255) gCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGatgagcggcctgctctaccagccgttgtaccgcgaa < 7:253974‑M1/148‑37 (MQ=255) gCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATccgcgaa > 1:334860‑M2/1‑141 (MQ=255) gCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATccgcg < 1:46334‑M2/146‑6 (MQ=255) tCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCgaaga > 6:273264/1‑148 (MQ=255) tCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGCTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCgaaga > 5:98878/1‑148 (MQ=255) cAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGaaaa > 6:215167/1‑149 (MQ=255) aaTAACCACGGGCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGATTGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAAc < 6:159763/149‑1 (MQ=255) aaTAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAAc < 5:273264/149‑1 (MQ=255) aaTAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAAc < 3:222819/149‑1 (MQ=255) ccACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGcc > 2:39175/1‑149 (MQ=255) cACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGatgagcggcctgctctaccagccgttgtaccgcgaac > 3:76171‑M1/1‑101 (MQ=255) cACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGatgagcggcctgctctaccagccgttgtaccgcgaac < 4:76171‑M1/138‑38 (MQ=255) cACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAAcgc > 5:269277/1‑145 (MQ=255) cACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAAcgc < 6:269277/145‑1 (MQ=255) cACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGcc > 2:284462/1‑148 (MQ=255) cGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGAt < 1:284462/149‑1 (MQ=255) gACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCa < 2:265207/149‑1 (MQ=255) aCCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAg < 1:39175/149‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCAGCTCGGCATACAATCGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACACCCAGTGCTGTTCCCGGTACAACGCCTGGTACAGCAGGCCGCTCATCAGCGAAGAAAACCCTCCGATGGCCAggac > 4:341419/1‑146 (MQ=255) tgctgGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATgg < 2:226770/136‑1 (MQ=255) ctgGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGTCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCgg < 6:98878/148‑1 (MQ=255) gggTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTg > 5:276836/1‑149 (MQ=255) aCTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGcc < 8:320257/129‑1 (MQ=255) aCTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGcc > 7:320257/1‑129 (MQ=255) cTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCacac < 7:182015/149‑1 (MQ=255) cTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCacac > 3:71368/1‑149 (MQ=255) tGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAGTTAAAGCAAGTGATGTTCGCGGAACAACGGATGGTACAGCAGCCCGCACAACCGCCAAGAAAACCCGCCGATGGCAAGGTCCAGGCGGTTGACATCCacac > 1:84236/1‑149 (MQ=255) cTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGAAGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACAcc > 6:256282/1‑147 (MQ=255) gggAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCgg > 8:11153/1‑130 (MQ=255) gggAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGtt > 8:131408/1‑149 (MQ=255) ggAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TTCAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCGGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTg < 7:264221/149‑1 (MQ=255) gccgcTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCg > 5:306803/1‑149 (MQ=255) gccgcTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTAGCAGCTCg > 8:108407/1‑149 (MQ=255) cgcTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCg > 5:320762/1‑147 (MQ=255) aCAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGa > 6:208873/1‑148 (MQ=255) tGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCg < 5:215167/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCGAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGAt < 2:84236/149‑1 (MQ=255) gTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGTACACCGATa < 6:276836/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGa > 7:22608/1‑146 (MQ=255) ctgctgCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATTGATGCAg < 5:256282/149‑1 (MQ=255) ctgcgtcAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTTGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGCGCTGGACACCGATAGATGCAg < 6:321419/143‑1 (MQ=255) tACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCAccgc > 6:132151/1‑149 (MQ=255) cAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCAccgccg < 3:341419/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGa > 8:192836/1‑127 (MQ=255) gCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCggg < 6:306803/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCCCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGa < 7:192836/127‑1 (MQ=255) cAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCTGGTg > 5:52975/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTg < 6:320762/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGGCCAGGCGGTTGGCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTc < 8:71573/149‑1 (MQ=255) tGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTg > 6:119792/1‑149 (MQ=255) gTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATccgcgaacagcactggctgtactgcagcagccgccacccattgtatgccgagcggcgcattcccgagcaggtagtgacccagcagcgcatggtcggccgtg > 3:76171‑M2/1‑37 (MQ=255) gTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATccgcgaacagcactggctgtactgcagcagccgccacccattgtatgccgagcggcgcattcccgagcaggtagtgacccagcagcgcatggtcggccgtg < 4:76171‑M2/138‑102 (MQ=255) ttCGCGGatgagcggcctgctctaccagccgttgtaccgcgaacagcactggctgtactgcagcagccgccacccattgtatgccgagcggcgcattcccgagcaggtagtgacccagcagcgcatggtcggccgtggttattggagc > 1:334860‑M1/1‑7 (MQ=255) ttCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATccgcgaacagcactggctgtactgcagcagccgccacccattgtatgccgagcggcgcattcccgagcaggtagtgacccagcagcgcatggtcggccgtggttattggagc < 7:253974‑M2/148‑113 (MQ=255) cgcgGatgagcggcctgctctaccagccgttgtaccgcgaacagcactggctgtactgcagcagccgccacccattgtatgccgagcggcgcattcccgagcaggtagtgacccagcagcgcatggtcggccgtggttattggagc < 1:46334‑M1/146‑142 (MQ=255) cgcgGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCt < 4:71368/148‑1 (MQ=255) gcgGatgagcggcctgctctaccagccgttgtaccgcgaacagcactggctgtactgcagcagccgccacccattgtatgccgagcggcgcattcccgagcaggtagtgacccagcagcgcatggtcggccgtggttattggagccagg > 4:130046‑M1/1‑4 (MQ=255) gcgGatgagcggcatgctctaccagccgttgtaccgcgaacagcactggctgtactgcagcagccgccacccattgtatgccgagcggcgcattcccgagcaggtagtgacccagcagcgcatggtcggccgtggttattggagccag < 2:289953‑M1/148‑145 (MQ=255) gcgGTACAAGGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGt < 5:338463/149‑1 (MQ=255) cgGatgagcggcctgctctaccagccgttgtaccgcgaacagcactggctgtactgcagcagccgccacccattgtatgccgagcggcgcattcccgagcaggtagtgacccagcagcgcatggtcggccgtggttattggagccaggc < 1:265207‑M1/149‑147 (MQ=255) cgGTTCAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTg > 6:282555/1‑147 (MQ=255) | TGCTTGAAGCCATGCCGGGCCAGTTCGGCCTGGCTCCAATAACCACGGCCGACCATGCGCTGCTGGGTCACTACCTGCTCGGGAATGCGCCGCTCGGCATACAATGGGTGGCGGCTGCTGCAG‑TACAGCCAGTGCTGTTCGCGGTACAACGGCTGGTAGAGCAGGCCGCTCATCCGCGAAGAAAACGCGCCGATGGCCAGGTCCAGGCGGTTGTCCTGCACACCCAGTTGCAGCTCGTAGGGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTA > NC_002947/5136952‑5137241 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |