New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5645844 = | 47 (0.830) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.3% | coding (1197/2184 nt) | PP_4954 | membrane protein |
? | NC_002947 | 5645891 = | 45 (0.840) | coding (1244/2184 nt) | PP_4954 | membrane protein |
ACTGGACCGCCTGCTCAGTGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCACGCGGCGCAAGCTGGTG > NC_002947/5645697‑5645985 | tcgaacaaggcccaacccactgtcaggccaacggcagtgccgaagattcgctgcaccagcttgcgccgcgtggccccatagttgggctggcagacgaacagcgtggtgaggatgatccagtagccttgggtcgggtgaatcaggtgcac < 8:247000‑M1/1‑1 (MQ=255) gaacaaggcccaacccactgtcaggccaacggcagtgccgaagattcgctgcaccagcttgcgccgcgtggccccatagttgggctggcagacgaacagcgtggtgaggatgatccagtagccttgggtcgggtgaatcaggtgcaCCa < 7:244481‑M1/3‑1 (MQ=255) aaggcccaacccactgtcaggccaacggcagtgccgaagattcgctgcaccagcttgcgccgcgtggccccatagttgggctggcagacgaacagcgtggtgaggatgatccagtagccttgggtcgggtgaatcaggtgcaCCATGc < 4:263675‑M1/6‑1 (MQ=255) cGCCTGCTCAGTGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGcca > 8:339874/1‑147 (MQ=255) ccTGCTCAGTGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTgc > 1:33646/1‑149 (MQ=255) ctctGTGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCTACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCt < 2:33646/149‑1 (MQ=255) cTCAGTGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCt > 2:27641/1‑149 (MQ=255) tCAGTGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTg > 4:33146/1‑149 (MQ=255) aGTGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGc < 3:33146/148‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGc > 3:69418/1‑149 (MQ=255) ccgccAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTg < 1:150383/149‑1 (MQ=255) cgccAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCCCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCCCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGcc > 6:290555/1‑128 (MQ=255) tccAGGAACCCGGTCAGGCGGGGCGCACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTg < 2:175113/147‑1 (MQ=255) cAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGt < 8:37780/149‑1 (MQ=255) ccGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGAt < 6:254017/149‑1 (MQ=255) gccAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCTCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCATCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCgg < 7:228363/147‑1 (MQ=255) ccTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATg > 4:190797/1‑149 (MQ=255) ccG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGgc < 7:187406/127‑1 (MQ=255) ccG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGgc > 8:187406/1‑127 (MQ=255) gCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCa > 5:326337/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCa > 4:53618/1‑149 (MQ=255) aGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCt < 7:211520/149‑1 (MQ=255) agcttgcgccgcgtggccccatagttgggctggcagacgaacagcgtggtgaggatgatccagtagccttgggtcgggtgaatcaggtgcaCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGAtt > 2:130604‑M1/92‑149 (MQ=255) agcagcCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCa > 5:131150/1‑149 (MQ=255) tGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCAccc < 6:329360/145‑1 (MQ=255) tGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCAccc > 5:329360/1‑145 (MQ=255) gACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAgg > 5:206466/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGc > 3:254831/1‑148 (MQ=255) cGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTa < 6:326337/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACt > 6:326413/1‑149 (MQ=255) gctGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTAc < 4:324290/136‑1 (MQ=255) gctGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTAc > 3:324290/1‑136 (MQ=255) ctGAAGGACGTGGGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTcac < 3:53618/149‑1 (MQ=255) tGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGa > 5:225614/1‑138 (MQ=255) tGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGa < 6:225614/138‑1 (MQ=255) aaGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTg < 7:217259/134‑1 (MQ=255) aaGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTg > 8:217259/1‑134 (MQ=255) gaacagcgtggtgaggatgatccagtagccttgggtcgggtgaatcaggtgcac < 4:178521‑M1/1‑1 (MQ=255) gaacagcgtggtgaggatgatccagtagccttgggtcgggtgaatcaggtgcac > 3:178521‑M1/54‑54 (MQ=255) tgtgGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTc < 6:206466/149‑1 (MQ=255) gACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCt > 1:15160/1‑149 (MQ=255) cgcgCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGc < 5:326413/149‑1 (MQ=255) cgcCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCa < 1:27641/149‑1 (MQ=255) gatgatccagtagccttgggtcgggtgaatcaggtgcaCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTa < 8:213205‑M1/39‑1 (MQ=255) gatgatccagtagccttgggtcgggtgaatcaggtgcaCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTa > 7:213205‑M1/39‑77 (MQ=255) gcACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCacc > 1:49511/1‑147 (MQ=255) aCCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACt > 4:173186/1‑148 (MQ=255) cAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATgg < 4:69418/149‑1 (MQ=255) aGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACt < 8:231202/105‑1 (MQ=255) aGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACt > 7:231202/1‑105 (MQ=255) acacCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCAc > 1:105019/1‑149 (MQ=255) acCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCAcgc > 7:257031/1‑149 (MQ=255) aCCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCTTGGTGCTCCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCACgcggcg > 5:292374/1‑149 (MQ=255) ttgttCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCACGCGGCGCAAGCTg < 4:254831/147‑1 (MQ=255) ttgttCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCACGCGGCGCAAGCTGGt < 8:257031/149‑1 (MQ=255) gttCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCTTGGTGCTCCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCACGCGGCGCAAGCTGGTg < 6:292374/148‑1 (MQ=255) ttCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCACGCGGCGCAAGCTGGTg > 3:263675/1‑147 (MQ=255) CCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGa > 3:1482‑M1/1‑56 (MQ=255) CCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGa < 4:1482‑M1/56‑1 (MQ=255) CCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCAcgc > 6:102479‑M1/1‑128 (MQ=255) CCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCAcgc < 5:102479‑M1/128‑1 (MQ=255) | ACTGGACCGCCTGCTCAGTGCCGCCAGCAACCCGGACAGCCTGGCCG‑ACGCCAGCGACAGCAGCCTGCTCGACCGCTCGCCGCGCTCGCTGAAGGACGTGTGGACGCGCCTGCGCACCCAGCTCACACCGACCTCGCTGTTGTTCCGCCATGCCTTGCGCCTGCCGCTGGCGCTGTCGATCGGCTATGGCATGGTGCACCTGATTCACCCGACCCAAGGCTACTGGATCATCCTCACCACGCTGTTCGTCTGCCAGCCCAACTATGGGGCCACGCGGCGCAAGCTGGTG > NC_002947/5645697‑5645985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |