New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 11719 | 54 (0.950) | 5 (0.090) | 3/246 | NT | 9.2% | coding (617/1104 nt) | dnaN | DNA polymerase III subunit beta |
? | NC_002947 | = 11774 | 48 (0.900) | coding (672/1104 nt) | dnaN | DNA polymerase III subunit beta |
GCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCC > NC_002947/11629‑11910 | gCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgc > 2:106993‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgcTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgcca > 7:153304‑M2/1‑141 (MQ=255) tttGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCactact > 8:342058/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCactact < 1:275368/147‑1 (MQ=255) tCGATGAGGGGGCCGAACGAGCAGGTGGTTGGTCACCAGGTCATGGTGCCGCGTAATGGTATCCTGGAGTTGGCGCGGCTGCTGACCGATCCTGATGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCTCATGCGCGCCACTACTGGTGa < 2:272142/149‑1 (MQ=255) tCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGt > 7:140207/1‑147 (MQ=255) gATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAg < 8:241333/148‑1 (MQ=255) gCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGTCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGc > 8:181476/1‑149 (MQ=255) aggaggATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCtg > 6:48565/1‑149 (MQ=255) gaggaTCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCtgg > 1:51132/1‑148 (MQ=255) gaggaTCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCtgg < 2:51132/148‑1 (MQ=255) tCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACg > 5:351194/1‑149 (MQ=255) gACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACgg < 6:71853/148‑1 (MQ=255) acacCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGc > 6:158056/1‑148 (MQ=255) cacCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAg > 7:299987/1‑117 (MQ=255) cacCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAg < 8:299987/117‑1 (MQ=255) cAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAAtt > 1:78051/1‑149 (MQ=255) aGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTc < 2:78051/149‑1 (MQ=255) tCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCg > 3:116957/1‑149 (MQ=255) tCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCg < 4:116957/149‑1 (MQ=255) aTCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGa > 2:355046/1‑149 (MQ=255) tGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTAc < 7:342058/149‑1 (MQ=255) ccGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGa < 1:325289/143‑1 (MQ=255) ccGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGATGGGCAAACATCAAAACAGCGCCACAAAAGGTTAGTACACCATTACCTCAAAGCTGGTGGACGACAAAAACACGGAcaaata > 2:325289/1‑144 (MQ=255) tAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAgcgc > 3:43095/1‑148 (MQ=255) tAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGcgcg < 7:251485/149‑1 (MQ=255) aaGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTa > 2:357315/1‑149 (MQ=255) aGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGt > 1:79709/1‑148 (MQ=255) aGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTAc < 2:79709/149‑1 (MQ=255) tATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAgacg > 4:20097/1‑109 (MQ=255) tGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagca < 8:96670‑M2/148‑81 (MQ=255) gAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCaaa < 1:357315/147‑1 (MQ=255) gTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcctcgagcaaagct < 6:294651‑M2/149‑86 (MQ=255) gTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcg < 8:308646‑M2/149‑86 (MQ=255) ggCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGGAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGt < 2:205626/148‑1 (MQ=255) ggCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGt < 6:351194/148‑1 (MQ=255) ggCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGt < 7:181476/148‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGAc > 1:147265/1‑148 (MQ=255) gcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGAc > 8:29532/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGc < 5:158056/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGc < 7:29532/149‑1 (MQ=255) gACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCGTCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGgtcg > 7:75324/1‑149 (MQ=255) aCCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGc > 7:174213/1‑124 (MQ=255) aCCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGc < 8:174213/124‑1 (MQ=255) aCCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGgtcgt > 2:11424/1‑149 (MQ=255) cGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGtcgtcg < 5:48565/149‑1 (MQ=255) gATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGa > 6:197848/1‑134 (MQ=255) gATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGa < 5:197848/134‑1 (MQ=255) aTCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGga < 8:140207/149‑1 (MQ=255) aaGGTCT‑GGTCAGCATCGTGCTTGGCCAGCGGCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGAcc < 8:75324/147‑1 (MQ=255) ggTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcgccaggcggtgaccgtcggtggatacagc > 7:308646‑M2/1‑36 (MQ=255) ggTAT‑GGGCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtggcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcgccaggcggtgaccgtcggtggatacagc > 5:294651‑M2/1‑36 (MQ=255) gTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGgcgc < 4:43095/148‑1 (MQ=255) ctCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCt < 6:131593/148‑1 (MQ=255) aGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCg > 4:264182/1‑149 (MQ=255) tGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGcc > 5:338689/1‑149 (MQ=255) ccAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGcc > 4:349647/1‑149 (MQ=255) | GCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAT‑GGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCC > NC_002947/11629‑11910 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |