New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1562323 = | 59 (1.040) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 6.7% | coding (65/1476 nt) | PP_1372 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1562361 = | 56 (1.040) | coding (103/1476 nt) | PP_1372 | hypothetical protein |
GGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCTGAGC > NC_002947/1562214‑1562502 | ggTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAAc < 5:48770/149‑1 (MQ=255) ggTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAAc < 8:142987/149‑1 (MQ=255) cacccaggccacaaaggtcgcctttgacatccgcggcgaacaccgccacccctgcgtcgctgaacacctccgccaggcgctgcagggtgacggtcttgccagtaccggtTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAAc > 7:167679‑M1/110‑149 (MQ=255) aTCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCgg > 1:54011/1‑149 (MQ=255) gCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGTGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACt < 8:270834/149‑1 (MQ=255) gAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGc < 1:274367/149‑1 (MQ=255) aTTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCa‑a < 4:75602/149‑1 (MQ=255) aTTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCa‑a < 6:197347/149‑1 (MQ=255) ttAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATAGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGc > 7:273752/1‑146 (MQ=255) aGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGAAGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCTGGCGCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGGCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGAcc < 5:86149/149‑1 (MQ=255) cTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGt < 6:311405/149‑1 (MQ=255) tAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAAACGGTACTGGCA‑AGACCGt > 5:118348/1‑148 (MQ=255) aGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCAcc < 4:85162/149‑1 (MQ=255) gCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCAccc < 2:345167/149‑1 (MQ=255) gacatccgcggcgaacaccgccacccctgcgtcgctgaacacctccgccaggcgctgcagggtgacggtcttgccagtaccggtTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAAc > 1:76766‑M1/85‑124 (MQ=255) gacatccgcggcgaacaccgccacccctgcgtcgctgaacacctccgccaggcgctgcagggtgacggtcttgccagtaccggtTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAAc < 2:76766‑M1/40‑1 (MQ=255) gAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTg < 4:177695/147‑1 (MQ=255) gCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAgc < 7:246307/149‑1 (MQ=255) gagGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGcc > 8:277238/1‑149 (MQ=255) gATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTgg > 8:196733/1‑149 (MQ=255) gATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTgg < 1:291815/149‑1 (MQ=255) ttAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCg > 5:266894/1‑149 (MQ=255) ttAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCg < 2:358077/149‑1 (MQ=255) tAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCg > 4:126022/1‑148 (MQ=255) aaGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCACAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGa < 1:21781/149‑1 (MQ=255) aaGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAg < 4:199480/149‑1 (MQ=255) aaGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAg < 3:115430/149‑1 (MQ=255) aaGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAg < 3:147701/149‑1 (MQ=255) gTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTg > 4:347340/1‑136 (MQ=255) gACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAggg < 7:277238/148‑1 (MQ=255) gACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAggg < 3:126022/148‑1 (MQ=255) aTCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAg > 8:94241/1‑142 (MQ=255) aTCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAg < 7:94241/142‑1 (MQ=255) tCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCg > 3:88665/1‑149 (MQ=255) ttGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGgtg < 2:300517/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGtt > 1:330001/1‑149 (MQ=255) gcgGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAgggg < 5:13780/133‑1 (MQ=255) gcgGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAgggg > 6:13780/1‑133 (MQ=255) gCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCG‑AGACCATCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGAt > 5:319966/1‑149 (MQ=255) gCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGAt < 4:88665/149‑1 (MQ=255) cGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTc < 7:196733/149‑1 (MQ=255) ccagccagTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCa < 2:117720/80‑1 (MQ=255) ccagccagTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCa > 1:117720/1‑80 (MQ=255) cagccagTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCAGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGa > 8:30257/1‑149 (MQ=255) agTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGACGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCttt > 7:103075/1‑149 (MQ=255) tCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTtgt < 5:242274/149‑1 (MQ=255) tCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTtgt < 5:237058/149‑1 (MQ=255) gggCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCttt > 1:315414/1‑145 (MQ=255) gggCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCttt < 2:315414/145‑1 (MQ=255) gcaaTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTAGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTtgtg > 7:11056/1‑142 (MQ=255) gcaaTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTAGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTtgtg < 8:11056/142‑1 (MQ=255) gttgcgccagccaccagaccgtggcggttggccaggcgcaACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTc > 1:76766‑M2/41‑124 (MQ=255) gttgcgccagccaccagaccgtggcggttggccaggcgcaACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTc < 2:76766‑M2/84‑1 (MQ=255) gttgcgccagccaccagaccgtggcggttggccaggcgcaACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGtg > 7:167679‑M2/41‑149 (MQ=255) aaTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGtg > 3:82064/1‑149 (MQ=255) cgccagccaccagaccgtggcggttggccaggcgcaACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGtgctg < 8:167679‑M2/112‑1 (MQ=255) CTGGCCAAGCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCgg > 8:273752‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTgc < 5:105845/149‑1 (MQ=255) gCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTg < 2:54011/148‑1 (MQ=255) cAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCCGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTgcgc < 7:30257/149‑1 (MQ=255) aaCCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTgcgc > 7:272232/1‑148 (MQ=255) cGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCT‑AGACCATCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCcaca < 6:319966/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTc < 3:139432/102‑1 (MQ=255) ggTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTc > 4:139432/1‑102 (MQ=255) ggTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGc > 4:239421/1‑147 (MQ=255) gtggCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGt < 6:285246/146‑1 (MQ=255) gtggCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGc > 7:243018/1‑149 (MQ=255) tggcGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCTGAgc > 4:334533/1‑149 (MQ=255) tggcGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCTGAgc > 8:216108/1‑149 (MQ=255) gcgcaACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGt < 6:3405‑M2/134‑1 (MQ=255) gcgcaACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGt > 5:3405‑M2/6‑139 (MQ=255) gcgcaACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCTGAgc < 4:82064‑M2/142‑1 (MQ=255) gcgcaACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCTGAgc < 3:239421‑M2/142‑1 (MQ=255) | GGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCA‑AGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCTGAGC > NC_002947/1562214‑1562502 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |