New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1904184 = | 53 (0.940) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.4% | coding (439/2553 nt) | nirB | nitrite reductase large subunit |
? | NC_002947 | 1904226 = | 55 (1.010) | coding (481/2553 nt) | nirB | nitrite reductase large subunit |
GTGCTGGCCACCGGCTCCTATCCCTTCGTGCCGCCGATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGGCGCAGATCGAAGCGCTAGGTGTGGGG > NC_002947/1904079‑1904372 | gTGCTGGCCACCGGCTCCTATCCCTTCGTGCCGCCGATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCt < 4:216879/149‑1 (MQ=255) ggCCACCGGCTCCTATCCCTTCGTGCCGCCGATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTg < 3:46605/149‑1 (MQ=255) gCCACCGGCTCCTATCCCTTCGTGCCGCCGTTCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTgg > 1:31416/1‑149 (MQ=255) ccgtccagctgtaccggcatcagccgtggggcgaattccaccacgtgagcttccagccccagcgacttgagggcgttggccgcttccaggccaagcagGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGc > 4:147302‑M1/99‑149 (MQ=255) gctgtaccggcatcacccgtggggcgaattccaccacgtgagcttccacccccagcgacttgagggcgttggccgcttccaggccaagcagGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGAGGTCGGCGGCGGCCt < 1:117352‑M1/44‑1 (MQ=255) cTATCCCTTCGTGCCGCCGATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCgg > 4:13423/1‑149 (MQ=255) tCCCTTCGTGCCGCCGATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGCGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGcc > 7:326987/1‑148 (MQ=255) cTTCGTGCCGCCGATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACg > 7:142149/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCGATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGGGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCt > 5:296254/1‑148 (MQ=255) ccgATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTc > 8:253981/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGCTCCAGCGGCAAAGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGTCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTg > 8:171713/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTgg < 3:13423/148‑1 (MQ=255) aaGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCGGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTgggg > 2:163285/1‑149 (MQ=255) aaGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCaa > 4:76835/1‑139 (MQ=255) aaGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCaa < 3:76835/139‑1 (MQ=255) aaGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTgggg < 6:296254/149‑1 (MQ=255) ggCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGTGCTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGc > 1:3807/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGTATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAg > 5:62825/1‑149 (MQ=255) aGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGc > 1:233754/1‑149 (MQ=255) aGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGc > 2:361165/1‑149 (MQ=255) cccGGCTGGT‑CTACCTCACCCTGGACGACCTCGATGGCTTTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGTGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACgtggt < 2:303672/148‑1 (MQ=255) cccGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACgtggtg < 1:163285/149‑1 (MQ=255) cGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGa < 3:342933/149‑1 (MQ=255) cTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAAtt > 1:135634/1‑149 (MQ=255) ggT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTAGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTct > 8:257838/1‑148 (MQ=255) t‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGc < 5:187676/84‑1 (MQ=255) t‑CTACCGCACCCTCGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGc > 6:187676/1‑84 (MQ=255) tACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACgtggtg < 1:7701/138‑1 (MQ=255) tACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACgtggtg > 2:7701/1‑138 (MQ=255) tACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGccc > 6:180079/1‑148 (MQ=255) cACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGc > 8:211227/1‑149 (MQ=255) cTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGAt < 2:135634/149‑1 (MQ=255) cTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGAt > 4:99525/1‑149 (MQ=255) gacgacCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATg < 2:31416/147‑1 (MQ=255) gacgacCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGcc > 4:216564/1‑149 (MQ=255) cgacCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCgg < 3:99525/149‑1 (MQ=255) acCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTa < 2:233754/149‑1 (MQ=255) aTGGCATTCGTGCTGTCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTg < 7:171713/149‑1 (MQ=255) ggCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTTGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTTGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGc < 3:116948/122‑1 (MQ=255) gCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCTGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGAc < 8:181352/149‑1 (MQ=255) gccaagcaggccgccgccgaccaccacccctcggcgggcaccggctgcggcCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACgg > 4:147302‑M2/52‑149 (MQ=255) aTTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACgg > 7:67721/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGa < 8:99175/148‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAg > 3:288664/1‑149 (MQ=255) tgctgcCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAgg < 8:142149/149‑1 (MQ=255) ctgcCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGc > 7:108540/1‑149 (MQ=255) aggccgccgccgacctccacccctcggcgggcaccggctgcggcCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGGTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGGTGATGCCGGTACAGc < 1:117352‑M2/91‑1 (MQ=255) GCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGaa < 4:265476‑M1/105‑1 (MQ=255) GCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGaa > 3:265476‑M1/1‑105 (MQ=255) CCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGt > 6:62825‑M1/1‑149 (MQ=255) cgccgccgaccaccacccctcggcgggcaccggctgcggcCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTg < 3:147302‑M2/109‑1 (MQ=255) CAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGcc < 8:235947‑M1/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGtt > 6:94801/1‑149 (MQ=255) ccgccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCt > 8:292810/1‑120 (MQ=255) ccgccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCt < 7:292810/120‑1 (MQ=255) ccgccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAgg < 5:180079/149‑1 (MQ=255) cgccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCg < 8:263300/127‑1 (MQ=255) cgccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCg > 7:263300/1‑127 (MQ=255) cgccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGgc < 6:37339/149‑1 (MQ=255) cgccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGgc > 1:52173/1‑149 (MQ=255) gccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGgcg < 2:3807/149‑1 (MQ=255) ccgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGgcgc < 2:52173/149‑1 (MQ=255) cgAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGgcg > 1:299928/1‑147 (MQ=255) aGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGGCGCAGa < 7:211227/149‑1 (MQ=255) tggtggtCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGGCGCAGATCGaa < 8:108540/149‑1 (MQ=255) gtggtCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGGCGCAGATCGAAgc < 4:288664/149‑1 (MQ=255) tggtCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGGCGCAGATCGAAgcg < 7:253981/149‑1 (MQ=255) gcCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCTCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGGCGCAGATCGAAGCGCTAGGTGTgggg < 7:235947‑M2/147‑1 (MQ=255) | GTGCTGGCCACCGGCTCCTATCCCTTCGTGCCGCCGATCGAAGGCTCCAGCGGCAATGCCCGCCTGGT‑CTACCGCACCCTGGACGACCTCGATGGCATTCGTGCTGCCGCAGCCGGTGCCCGCCGAGGGGTGGTGGTCGGCGGCGGCCTGCTTGGCCTGGAAGCGGCCAACGCCCTCAAGTCGCTGGGGCTGGAAGCTCACGTGGTGGAATTCGCCCCACGGCTGATGCCGGTACAGCTGGACGGCGAGGGCGGTGCCGCGTTGAAGGCGCAGATCGAAGCGCTAGGTGTGGGG > NC_002947/1904079‑1904372 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |