New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2656526 = | 34 (0.600) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 9.4% | coding (1086/1341 nt) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
? | NC_002947 | 2656578 = | 25 (0.460) | coding (1034/1341 nt) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
CCGCGCACATCCACATACAGCAGCGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCA > NC_002947/2656434‑2656725 | agtgaaggtaccggaactgttcagcctggagagttaccccaacgtgcaccatctggtcagcagcatcaccggccagctggccagcgacaaggaTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATcc > 4:291403‑M1/94‑148 (MQ=255) acaTACAGCAGCGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAg > 8:114100/1‑149 (MQ=255) aTACAGCAGCGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCt < 6:221544/149‑1 (MQ=255) agcagcGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGcc > 4:92166/1‑149 (MQ=255) gcagcGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCCGGCCAGCTGGCCg < 7:8459/149‑1 (MQ=255) agcGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGc < 5:212303/145‑1 (MQ=255) agcGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGc > 6:212303/1‑145 (MQ=255) gcGAGCCGCAGTATAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTg < 2:242905/149‑1 (MQ=255) gcGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTg < 3:92166/149‑1 (MQ=255) gcGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTACGGGTGCGCCGGTGATCGCCCCGCCAGGGAAGGGGTCGCCGAAAAGTGCCCGCGCATCCTTGGCGCTGGCCAGCTGGCCGGt > 1:108054/1‑149 (MQ=255) cGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGAtgctg > 3:205938/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCa < 7:114100/149‑1 (MQ=255) ggCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGTCCAGATGGTGCACGTTggg < 7:42813/149‑1 (MQ=255) tCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGt > 8:119831/1‑148 (MQ=255) cATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGtt > 3:333281/1‑149 (MQ=255) cATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGtt > 8:178175/1‑149 (MQ=255) cgcgGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCgg > 2:298129/1‑148 (MQ=255) ggATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTAcc > 5:220173/1‑149 (MQ=255) c‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCtt < 4:205938/144‑1 (MQ=255) ggatgcgctggacctgatcggcgacagcttccctggcggctcgatcaccggcgcaTCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACt > 4:291403‑M2/56‑148 (MQ=255) ggTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACt > 8:189288/1‑147 (MQ=255) TGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGc > 7:189288‑M1/1‑149 (MQ=255) gcgctggacctgatcggcgacagcttccctggcggctcgatcaccggcgcaTCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGc > 2:208855‑M2/52‑148 (MQ=255) GCGCCGGTGATGGATCCGCCAGGGAAGCTGTCTCCGATCAGGTACAGCGCATCCTTGTCGGTGGCCAGCTGGCCTGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTTAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGc > 4:360021‑M1/1‑148 (MQ=255) cGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAAtc > 2:91529/1‑149 (MQ=255) ggcgacagcttccctggcggctcgatcaccggcgcaTCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTgc < 1:208855‑M2/112‑1 (MQ=255) ggAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAgg > 4:164568/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGtt < 6:220173/149‑1 (MQ=255) ccGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTg > 4:208858/1‑144 (MQ=255) ccGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTg < 3:208858/144‑1 (MQ=255) cGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCgcagc < 4:333281/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGtt > 7:171350/1‑89 (MQ=255) gTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGtt < 8:171350/89‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGtt < 7:128027/135‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGtt > 8:128027/1‑135 (MQ=255) tCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTcgac > 6:46491/1‑149 (MQ=255) gcgcaTCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGaa > 6:271867‑M2/6‑79 (MQ=255) gcgcaTCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGaa < 5:271867‑M2/74‑1 (MQ=255) caTCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGatcatc < 3:164568‑M2/147‑1 (MQ=255) aTCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGAtcatca < 3:291403‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCGCGCACATCCACATACAGCAGCGAGCCGCAGTACAGCGCGCGGCGCGCGGGCTCCAGTTCGTCGATGATCTGCATGGCGCGGATCTTC‑GGTGCGCCGGTGATCGAGCCGCCAGGGAAGCTGTCGCCGATCAGGTCCAGCGCATCCTTGTCGCTGGCCAGCTGGCCGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCA > NC_002947/2656434‑2656725 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |