New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3658098 = | 52 (0.920) | 8 (0.150) | 7/246 | NT | 14.3% | coding (152/951 nt) | PP_3222 | ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 3658157 = | 47 (0.880) | coding (93/951 nt) | PP_3222 | ABC transporter permease |
GTGCAGGGCCCGCCACAGCAGGTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGAAGCCTTCGGCGGTCCAGTGGAA > NC_002947/3658010‑3658305 | gacgctacctgatcggccgcgtcggccaggccctgctggtgttgtggggggcttataccatcacctacttcatcctctacctgctgcccGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCg > 8:224932‑M1/90‑149 (MQ=255) gacgctacctgatcggccgcgtcggccaggccctgctggtgttgtggggggcttataccatcacctacttcatcctctacctgctgcccGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCg > 2:163868‑M1/90‑149 (MQ=255) acgcgacgtgatcggccgcgtcggccaggccctgctcttgtggtgtggggcttataccatcacctacttcatcctctaccttctgcccGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCgg > 8:154184‑M1/89‑149 (MQ=255) cgctacctgatcggccgcgtcggccaggccctgctggtgttgtggggggcttataccatcacctacttcatcctctacctgctgcccGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCggg > 6:27478‑M1/88‑149 (MQ=255) gaGGGCCCGCCACAGCAGGGCGAAATACTGTTCGATCAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCGTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGgca < 4:286645/148‑1 (MQ=255) gggCCCGCCACAGCAGGTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGgcag > 8:265249/1‑148 (MQ=255) gCCCGCCACAGCAGGTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCggg > 6:239938/1‑143 (MQ=255) gCCCGCCACAGCAGGTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCggg < 5:239938/143‑1 (MQ=255) ccGCCACAGCAGGTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGt > 6:347563/1‑149 (MQ=255) ggccgcgtcggccaggccctgctggtgttgtggggggcttataccatcacctacttcatcctctacctgctgcccGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTaga > 5:17068‑M1/76‑148 (MQ=255) gcagGTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATg < 1:319898/149‑1 (MQ=255) gcagGTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATg < 1:314594/149‑1 (MQ=255) ggTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAg > 5:20793/1‑149 (MQ=255) gTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAg > 7:226676/1‑148 (MQ=255) gAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCTGTTGGCCAGGTCATCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAg > 1:266466/1‑149 (MQ=255) gAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCg < 5:158688/124‑1 (MQ=255) gAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCg > 6:158688/1‑124 (MQ=255) gAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAg < 2:188886/148‑1 (MQ=255) tGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATgg > 1:180731/1‑148 (MQ=255) ttCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGtat < 7:265249/149‑1 (MQ=255) ttCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGta > 3:337817/1‑148 (MQ=255) gAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCTGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATaa < 5:347563/148‑1 (MQ=255) gAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATaa < 2:330843/148‑1 (MQ=255) ccTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCca > 5:145267/1‑149 (MQ=255) cTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCca > 3:214329/1‑148 (MQ=255) gTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCacaaca > 6:149615/1‑149 (MQ=255) aGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACcag < 8:226676/149‑1 (MQ=255) cccATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGt > 1:296092/1‑126 (MQ=255) cccATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGt > 1:291982/1‑126 (MQ=255) cccATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGt < 2:296092/126‑1 (MQ=255) cccATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGt < 2:291982/126‑1 (MQ=255) aTAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCTGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCATGGCAGCAGGTAGACGa > 5:6103/1‑107 (MQ=255) aGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGcc > 8:32949/1‑149 (MQ=255) tctacctgctgcccggcgacaccttggcgatcatgctgagcgcctccggcatggaagccgacggcctgtcgccGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGcc > 5:17068‑M2/74‑148 (MQ=255) tGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGcc > 5:118755/1‑148 (MQ=255) gCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGAt < 4:337817/149‑1 (MQ=255) aGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAg < 6:20793/149‑1 (MQ=255) ccTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAg > 3:122784/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGc < 4:122784/149‑1 (MQ=255) cccggcgacaccttggcgatcatgctgagcgcctccggcatggaagccgacggcctgtcgccGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCg > 6:27478‑M2/63‑149 (MQ=255) ccggcgacaccttggcgatcatgctgagcgcctccggcatggaagccgacggcctgtcgccGGGCAGAAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCACACCACAAGAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCACGTCGCGt > 8:154184‑M2/62‑149 (MQ=255) gggCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGtc > 8:345309/1‑149 (MQ=255) cggcgacaccttggcgatcatgctgagcgcctccggcatggaagccgacggcctgtcgccGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGtc > 2:163868‑M2/61‑149 (MQ=255) cggcgacaccttggcgatcatgctgagcgcctccggcatggaagccgacggcctgtcgccGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGtc > 8:224932‑M2/61‑149 (MQ=255) gacaccttggcgatcatgctgagcgcctccggcatggaagccgacggcctgtcgccGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCAt < 1:163868‑M2/93‑1 (MQ=255) ccttggcgatcatgctgagcgcctccggcatggaagccgacggcctgtcgccGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCAtggct < 6:17068‑M2/97‑1 (MQ=255) ggCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGAc > 1:176777/1‑149 (MQ=255) cTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCt < 5:149615/149‑1 (MQ=255) ttCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTg > 8:223932/1‑149 (MQ=255) cATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGAt > 7:138153/1‑149 (MQ=255) gCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATc > 7:192367/1‑115 (MQ=255) gCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATc < 8:192367/115‑1 (MQ=255) cGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCAc > 2:69114/1‑149 (MQ=255) cgcTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACt < 8:279019/144‑1 (MQ=255) cgcTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACt > 7:279019/1‑144 (MQ=255) tCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAggg > 7:49984/1‑149 (MQ=255) aGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCg < 4:214329/149‑1 (MQ=255) gCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCa > 5:300412/1‑114 (MQ=255) gCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCa < 6:300412/114‑1 (MQ=255) cATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGaa < 4:13745/149‑1 (MQ=255) cATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGAAGTCACTGATCACGGCGaa > 8:111151/1‑149 (MQ=255) tGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGaa < 2:22562/147‑1 (MQ=255) tGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGaa > 1:22562/1‑147 (MQ=255) aaggcgacggcctgtcgccGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGAAGc < 5:27478‑M2/130‑1 (MQ=255) ccAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGACACTGAGCAGGGCGAAGCCTTcgg < 7:223932/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGAAGCCTTcggcg < 8:138153/149‑1 (MQ=255) gtgtCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGAAGCCTTCGGCGGTc < 2:176777/149‑1 (MQ=255) ccGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGAAGCCTTCGGCGGTCCAGTgg < 6:118755‑M2/147‑1 (MQ=255) gggCAGGAGGTTGTGGAGGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCGCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTGTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGAAGCCTTCGGCGGTCCAGTGGaa < 7:111151/149‑1 (MQ=255) | GTGCAGGGCCCGCCACAGCAGGTCGAAATACTGTTCGAACAAGCCTTTGTCCAGCCCATAGTAAGTGCGTGCT‑TTGGCCAGGTCCTCGGGCGACAGGCCGTCGGCTTCCATGCCGGAGGCGCTCAGCATGATCGCCAAGGTGTCGCCGGGCAGCAGGTAGAGGATGAAGTAGGTGATGGTATAAGCCCCCCACAACACCAGCAGGGCCTGGCCGACGCGGCCGATCAGGTAGCGTCTCATGGCTGGCCGACCTGGATGTCACTGAGCAGGGCGAAGCCTTCGGCGGTCCAGTGGAA > NC_002947/3658010‑3658305 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |