New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4785919 | 54 (0.950) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.2% | coding (1395/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | = 4785973 | 40 (0.740) | coding (1341/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
GGGAAGCTCGCGGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTT > NC_002947/4785827‑4786118 | gggAAGCTCGCGGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGgt > 4:130851‑M2/1‑147 (MQ=255) ggAAGCTCGCGGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGgtt > 5:57054‑M2/1‑146 (MQ=255) ggAAGCTCGCGGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGgtt > 6:186144‑M2/1‑146 (MQ=255) tCGCGGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAg > 3:67361/1‑149 (MQ=255) gcgGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAg < 1:62810/147‑1 (MQ=255) gcgGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGt > 5:356969/1‑149 (MQ=255) cgGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTg < 2:32679/149‑1 (MQ=255) ggCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCGCCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGCGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGaa < 5:323678/149‑1 (MQ=255) ggCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGaa < 2:8/149‑1 (MQ=255) ccGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGc < 7:61170/149‑1 (MQ=255) cGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGcc > 6:92762/1‑149 (MQ=255) tGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTg < 4:67361/149‑1 (MQ=255) tgcaaaCCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTg > 3:343568/4‑148 (MQ=255) cAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGa < 5:92762/149‑1 (MQ=255) cAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGa < 3:64356/149‑1 (MQ=255) aaaaCCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGa > 2:258053/1‑148 (MQ=255) aaaaCCGCATCGGCATCACCGACACAGTACAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTCGCATAGGTGAAGTACGCCTGGa > 1:294741/1‑148 (MQ=255) aCCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACTTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATAcc < 1:342653/149‑1 (MQ=255) ccGCATCGGCATCACCGCCACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCCACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGCCGGTGCTGGCCATGAACAGGTCGGTTGCAGAGCTGAACTGCGCCTGGATACCg > 8:238721/1‑149 (MQ=255) gCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCg > 2:36706/1‑144 (MQ=255) gCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCg < 1:36706/144‑1 (MQ=255) aCCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCgg > 3:164186/1‑149 (MQ=255) cGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGt > 1:222210/1‑148 (MQ=255) acacAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGaa < 6:220731/149‑1 (MQ=255) tCCAGCAGCCGGCTTGCAGGGGCCTCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGATGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGaa < 7:238721/149‑1 (MQ=255) cagcagCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGgtt < 4:88704‑M2/97‑4 (MQ=255) cagcagCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGgtt > 3:88704‑M2/1‑94 (MQ=255) agcagcCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGc < 1:101454/149‑1 (MQ=255) gcagcCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGcc < 4:164186/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAAcgc > 5:135977/1‑149 (MQ=255) aGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAAcgcg > 3:153178/1‑149 (MQ=255) gACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGgttgcaggacatggtcgcggcacctgccagccggctgctggactgtgtcggtgatgccgatgcggttttgcacggtgag < 5:243438‑M2/149‑80 (MQ=255) ccATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGcgccg < 6:356969/149‑1 (MQ=255) aTGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGgttgcaggacatggtcgcggcacctgccagccggctgctggactgtgtcggtgatgccgatgcggttttgcacggtgagcccg < 4:92411‑M2/149‑84 (MQ=255) cTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGgttgcaggacatggtcgcggcacctgccagccggctgctggactgtgtcggtgatgccgatgcggttttgcacggtgagcccgcgagc < 7:213288‑M2/149‑89 (MQ=255) cTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTCGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACg < 2:294741/149‑1 (MQ=255) tGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACgg > 8:285249/1‑149 (MQ=255) aacaacGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTa < 7:285249/149‑1 (MQ=255) aacaacGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTa > 3:176580/1‑149 (MQ=255) tgCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGAc < 4:343568/149‑1 (MQ=255) ccGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGcgccg < 4:295336/122‑1 (MQ=255) ccGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGcgccg > 3:295336/1‑122 (MQ=255) tCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCtt > 5:284580/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTgcgc < 6:135977/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCgctgct > 8:309742/1‑149 (MQ=255) gCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTcgcc < 4:176580/149‑1 (MQ=255) cTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGGATTGCGGTGAGcgccgc > 3:68225/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGAc < 6:337914/108‑1 (MQ=255) cAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGAc > 5:337914/1‑108 (MQ=255) aGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCa < 3:70765/147‑1 (MQ=255) aGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCa > 4:70765/1‑147 (MQ=255) gTCGGTTGCATAGGTGTAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTAAACGGGTACTCCTCGCCCTGCAGACCGCTGACGGTCTTGCGATGCTCGCCGCCGGCAGCtt > 6:161095/1‑149 (MQ=255) | GGGAAGCTCGCGGGCTCACCGTGCAAAACCGCATCGGCATCACCGACACAGTCCAGCAGCCGGCTGGCAGGTGCCGCGACCATGTCCTGCAACAACGTGTGCAGGGCCGTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTT > NC_002947/4785827‑4786118 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |