| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5140943 | 55 (0.970) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 6.4% | coding (619/894 nt) | PP_4525 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 5140970 | 63 (1.150) | coding (592/894 nt) | PP_4525 | LysR family transcriptional regulator | |||||
ACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCT > NC_002947/5140827‑5141117 | aCGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGacgc > 2:334889‑M2/1‑144 (MQ=255) gcaggcTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTAc < 8:314227/149‑1 (MQ=255) gcTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGagc < 5:39322/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGagcagc > 2:56849/1‑149 (MQ=255) gAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGac > 4:284506‑M2/1‑126 (MQ=255) gAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGac < 3:284506‑M2/128‑3 (MQ=255) gAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCt > 6:276061/1‑149 (MQ=255) cATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGc < 5:47981/149‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCg > 1:203730/1‑148 (MQ=255) aCTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAg > 3:339616/1‑149 (MQ=255) aCTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAg > 3:180672/1‑149 (MQ=255) gCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGaa < 5:30841/149‑1 (MQ=255) gCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCtt < 2:203730/149‑1 (MQ=255) ccACACCCGCACCCGCGATCGCACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGt > 1:302749/1‑114 (MQ=255) ccACACCCGCACCCGCGATCGCACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGt < 2:302749/114‑1 (MQ=255) ccACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGt < 6:25019/136‑1 (MQ=255) ccACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGt > 5:25019/1‑136 (MQ=255) ccgcacccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGCCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGc > 7:21931/1‑148 (MQ=255) cgcaccctcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGGGAACACCGCCTTGCCCGCCa < 5:122050/149‑1 (MQ=255) acccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGt > 8:334378/1‑149 (MQ=255) gATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTg < 8:197890/148‑1 (MQ=255) gATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTg > 7:197890/1‑148 (MQ=255) aTCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGc < 1:56849/149‑1 (MQ=255) acacaGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGt > 5:249473/1‑149 (MQ=255) cacaGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGt > 2:48629/1‑148 (MQ=255) cacaGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGt > 2:261591/1‑148 (MQ=255) acaGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGt > 6:272331/1‑147 (MQ=255) ggCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTa < 5:276061/149‑1 (MQ=255) cATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTAccgccg < 6:249473/149‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCggg < 5:272331/149‑1 (MQ=255) gTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCgg > 6:36574/1‑149 (MQ=255) aCGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTTAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGc < 4:131808/124‑1 (MQ=255) aCGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTgg < 8:195851/123‑1 (MQ=255) aCGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTgg > 7:195851/1‑123 (MQ=255) aCGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGc > 3:131808/1‑124 (MQ=255) tctcCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGAt > 6:108113/1‑148 (MQ=255) ctcCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGAt > 1:288205/1‑147 (MQ=255) tcCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGa < 3:26400/118‑1 (MQ=255) tcCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGa > 4:26400/1‑118 (MQ=255) ccATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGAtg > 3:353447/1‑145 (MQ=255) ccATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAg > 1:229443/1‑148 (MQ=255) ccATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAg > 5:96290/1‑148 (MQ=255) cATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCa < 4:180672/146‑1 (MQ=255) aTCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTAc < 6:96290/149‑1 (MQ=255) aTCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTAc > 4:108179/1‑149 (MQ=255) aTCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTAc < 2:229443/149‑1 (MQ=255) aTCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTAc < 8:21931/149‑1 (MQ=255) aCCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCa < 2:288205/148‑1 (MQ=255) aCCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAg < 5:108113/149‑1 (MQ=255) cccGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGt > 7:256914/1‑149 (MQ=255) ccGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGt > 6:166819/1‑122 (MQ=255) cGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTg < 3:108179/149‑1 (MQ=255) cATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGacgccaatggggcgggtgatggagatcgagtcgtaccagagcatgctggcctgtgtgatcgcgggtgcgggtgtggcgatgatggcccagtcgatgctcgacagcctgc < 4:192995‑M2/145‑110 (MQ=255) cATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGacgccaatggggcgggtgatggagatcgagtcgtaccagagcatgctggcctgtgtgatcgcgggtgcgggtgtggcgatgatggcccagtcgatgctcgacagcctgc > 3:192995‑M2/1‑36 (MQ=255) aTTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGacgccaatggggcgggtgatggagatcgagtcgtaccagagcatgctggcctgtgtgatcgcgggtgcgggtgtggcgatgatggcccagtcgatgctcgacagcctgcctggg < 4:289338‑M2/149‑115 (MQ=255) aTTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATc < 8:256914/149‑1 (MQ=255) ggcatgggcatACCAGGCC‑‑CATacgccaatggggcgggtgatggagatcgagtcgtaccagagcatgctggcctgtgtgatcgcgggtgcgggtgtggcgatgatggcccagtcgatgctcgacagcctgcctgggcgtgatcgggt < 4:179017‑M2/147‑126 (MQ=255) gcatgggcatACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCAc > 1:138261/1‑149 (MQ=255) gggcatACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCa > 6:65585/1‑149 (MQ=255) gcatACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCt > 8:307585/1‑76 (MQ=255) gcatACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCt < 7:307585/76‑1 (MQ=255) gcatACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATc < 4:339616/149‑1 (MQ=255) gcatACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATc > 4:18952/1‑149 (MQ=255) atACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTCGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATc > 3:233694/1‑147 (MQ=255) cAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGccc > 6:72869/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGccc > 7:167620/1‑149 (MQ=255) aGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCg > 1:131391/1‑149 (MQ=255) ccTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCg > 2:132982/1‑122 (MQ=255) ccTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCg < 1:132982/122‑1 (MQ=255) cTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCaa < 8:167620/149‑1 (MQ=255) cAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTGATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAgg < 1:48629/148‑1 (MQ=255) aGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCt < 4:233694/149‑1 (MQ=255) | ACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGGTGATCAGTACCAGTTGCTCATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCT > NC_002947/5140827‑5141117 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |