New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5539106 | 52 (0.920) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.6% | coding (1880/2355 nt) | PP_4872 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5539144 | 51 (0.940) | coding (1842/2355 nt) | PP_4872 | hypothetical protein |
GTAGCGCAAGAACGCCTTGTGCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTCGAGAACTTCTCGAACATGC > NC_002947/5538997‑5539292 | gTAGCGCAAGAACGCCTTGTGCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCt > 7:191961‑M2/1‑148 (MQ=255) cAAGAACGCCTAGTGCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCt > 8:248860/1‑149 (MQ=255) gAACGCCTTGTGCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGt > 7:259568/1‑149 (MQ=255) cTTGTGCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCt < 7:202288‑M2/134‑2 (MQ=255) cTTGTGCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCt > 8:202288‑M2/1‑133 (MQ=255) tgCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGaa < 4:129384/149‑1 (MQ=255) gCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAg > 6:182406/1‑149 (MQ=255) cAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAg < 3:332977/148‑1 (MQ=255) cAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAg < 2:20105/148‑1 (MQ=255) cTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCa < 7:59010/149‑1 (MQ=255) cTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCa < 8:259568/149‑1 (MQ=255) tcgtcgCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTgg > 4:101587/1‑123 (MQ=255) tcgtcgCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTgg < 3:101587/123‑1 (MQ=255) tcgtcgCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAg > 1:333934/1‑149 (MQ=255) tcCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTtcat > 6:174506/1‑149 (MQ=255) cACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTtcatc < 4:231454/148‑1 (MQ=255) cACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTtcatc > 4:340992/1‑148 (MQ=255) cACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTtca < 4:207606/146‑1 (MQ=255) cACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTtc < 2:120133/145‑1 (MQ=255) aCCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTcatcat > 3:222180/1‑149 (MQ=255) cccTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGt < 4:222180/149‑1 (MQ=255) cTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCt > 7:261858/1‑149 (MQ=255) gCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTtcgt > 3:285156/1‑149 (MQ=255) gTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTTAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCggtg < 3:340992/148‑1 (MQ=255) gTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCggt < 2:333934/147‑1 (MQ=255) gTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGcgcg < 6:101719/92‑1 (MQ=255) gTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGcgcg > 5:101719/1‑92 (MQ=255) gTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTAcc > 4:272670/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCGTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCg > 2:222404/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAgg < 6:317636/116‑1 (MQ=255) tCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCGTCGTCGGTGGTAcag > 8:327768/1‑147 (MQ=255) ccTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCgggg > 4:8747/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGt > 6:326733/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCgg < 8:261858/149‑1 (MQ=255) ggTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAAt > 5:89323/1‑148 (MQ=255) ttCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATg > 7:262234/1‑147 (MQ=255) ccTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACgg < 6:89323/149‑1 (MQ=255) cTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCtgtaccactcaggcaagaacccgctgcgcaaggtgacctacaagagcgaaggggtggagatcgtcaagagcgacgagcaacgccgtctgcacaaggcgt < 1:187001‑M2/149‑100 (MQ=255) tGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCgg > 2:172597/1‑116 (MQ=255) tGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCgg < 1:172597/116‑1 (MQ=255) gTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCa < 5:174506/149‑1 (MQ=255) tGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGACGGGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGAt > 1:57901/1‑147 (MQ=255) ggTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAgg < 4:285156/149‑1 (MQ=255) gTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCtgtaccactcaggcaagaacccgctgcgcaaggtgacctacaagagcgaaggggtggagatcgtcaag > 6:166989‑M2/1‑43 (MQ=255) gTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCtgtaccactcaggcaagaacccgctgcgcaaggtgacctacaagagcgaaggggtggagatcgtcaag < 5:166989‑M2/111‑69 (MQ=255) gTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAgg > 7:109953/1‑148 (MQ=255) tACATGGCAGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAg < 6:293874/146‑1 (MQ=255) tACATGGCAGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCAAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAg > 5:293874/1‑146 (MQ=255) aTGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTg > 6:100470/1‑149 (MQ=255) tggccgtggccgAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGGTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGc > 7:92570/1‑149 (MQ=255) gccgtggccgAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGGCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTc < 7:248860/149‑1 (MQ=255) gtggccgAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGTGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCtt < 3:272670/149‑1 (MQ=255) gtggccgAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCtt < 5:182406/149‑1 (MQ=255) agatctGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGctt < 7:35386/143‑1 (MQ=255) ttGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTc < 5:331195/149‑1 (MQ=255) gCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGctt > 8:35386/1‑141 (MQ=255) gAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTCGAGaa < 5:326733/149‑1 (MQ=255) aC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTCGAGAAc > 5:23433/1‑149 (MQ=255) c‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTCGAGAACt < 5:100470/149‑1 (MQ=255) tAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTCGAGAACTtctc > 2:219891/1‑149 (MQ=255) gAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTCGAGAACTTCTCg < 8:109953/148‑1 (MQ=255) aCGCCTGTACCTGGTCGGCGAGGAAGCCGTTGCCATTCAGCCAAAGGGCCAGGTTCATCATGTCTACGACGGTCGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAATTACCGGATCAGGTACTGATCCTAGACCGCTTCTATCGAGAAATTCTCGaa > 4:306675/1‑148 (MQ=255) cGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTc < 2:222774/133‑1 (MQ=255) cGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTc > 1:222774/1‑133 (MQ=255) cTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTCGAGAACTTCTCGAACATgc > 3:7409/1‑149 (MQ=255) | GTAGCGCAAGAACGCCTTGTGCAGACGGCGTTGCTCGTCGCTCTTGACGATCTCCACCCCTTCGCTCTTGTAGGTCACCTTGCGCAGCGGGTTCTTGCCTGAGTGGTACATGGCCGTGGCCGAGGCCATTGGCGAC‑GGGTAGAACGCCTGTACCTGGTCGGCGCGGAAGCCGTTGCCCTTCAGCCACAGGGCCAGGTTCATCATGTCTTCGTCGGTGGTACCGGGGTGCGCGGCAATGAAGTACGGGATCAGGTACTGCTCCTTGCCCGCTTCTTTCGAGAACTTCTCGAACATGC > NC_002947/5538997‑5539292 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |