New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5572514 = | 54 (0.950) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.2% | coding (251/543 nt) | orn | oligoribonuclease |
? | NC_002947 | 5572567 = | 40 (0.750) | coding (198/543 nt) | orn | oligoribonuclease |
AGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCGCTGTCCG > NC_002947/5572421‑5572709 | agGAAACGACGATCCTGGCAGATGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCAc > 4:295777/1‑148 (MQ=255) gAAACGACGATCCTGGCAGATGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCAt > 7:300241/1‑149 (MQ=255) cgacgaTCCTGGCAGATGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGt < 2:263830/149‑1 (MQ=255) gacgaTCCTGGCAGATGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCAcccatggtg > 7:241159/1‑142 (MQ=255) ttggccgaagggccggtgatcgccatccaccacagtgacgaagtgctggcgcgcatggacgagtggaacacccgcacccatggtGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATg < 7:103742‑M1/59‑1 (MQ=255) ttggccgaagggccggtgatcgccatccaccacagtgacgaagtgctggcgcgcatggacgagtggaacacccgcacccatggtGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATg > 8:103742‑M1/85‑143 (MQ=255) gCAGCTGCTGTTGCCGCCGATCGGCGTCTTGCCTTTAGGCAACCACTGCTCGAGGAACGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTc < 6:27377/148‑1 (MQ=255) gCAGATGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCgg < 5:329663/142‑1 (MQ=255) gCAGATGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCgg > 6:329663/1‑142 (MQ=255) gCAGAGGCTGGTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGCTTGGCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGGCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTc < 4:193233/148‑1 (MQ=255) cgctGCTGTTGCCGACGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCACCTGCGCGAGGAAGGCGCTGGGCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCCTGGGTGCGGGTGTTCCAc < 8:303571/146‑1 (MQ=255) aTGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTc < 8:300241/149‑1 (MQ=255) cTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGt < 5:120154/148‑1 (MQ=255) ttGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCa < 2:207906/148‑1 (MQ=255) gCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATgcgcg > 6:170969/1‑149 (MQ=255) cGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAAGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCa > 1:241698/1‑149 (MQ=255) tttAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACtgt > 5:85720/1‑149 (MQ=255) tAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACtgtg < 5:170969/148‑1 (MQ=255) cACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATggt > 8:241986/1‑148 (MQ=255) aCTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATgg > 6:300029/1‑147 (MQ=255) aCTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATgg < 5:300029/147‑1 (MQ=255) aCTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCg < 3:295777/149‑1 (MQ=255) tCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGt > 3:99774/1‑127 (MQ=255) tCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGt < 4:99774/127‑1 (MQ=255) aGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGTCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCgg < 5:289709/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGcc > 3:230059/1‑149 (MQ=255) gTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATTCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCCGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTGCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCaa < 5:62156/149‑1 (MQ=255) tgtgCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAgg > 4:22024/1‑148 (MQ=255) gtgCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTc > 8:946/1‑139 (MQ=255) gtgCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTc < 7:946/139‑1 (MQ=255) tgCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTAt > 7:195043/1‑149 (MQ=255) catggtgcttcggggctgacccagcgcgtacgcgagagcaaggtcagcatggccgaagcACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCaa > 8:103742‑M2/60‑143 (MQ=255) catggtgcttcggggctgacccagcgcgtacgcgagagcaaggtcagcatggccgaagcACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCaa < 7:103742‑M2/84‑1 (MQ=255) ccTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTg < 2:289288/149‑1 (MQ=255) tCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCAAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTAGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCATCGGCCAAGCTATTGAg > 6:161255/1‑149 (MQ=255) cggggctgacccagcgcgtacgcgagagcaaggtcagcatggccgaagcACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTAGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTg > 3:322090‑M2/50‑149 (MQ=255) CGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCt > 4:230059‑M1/1‑148 (MQ=255) CGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCt > 3:22024‑M1/1‑148 (MQ=255) gCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAgg < 2:202933/128‑1 (MQ=255) gCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGa > 2:139893/1‑149 (MQ=255) gCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGCTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAgg > 1:202933/1‑128 (MQ=255) ccTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTgaggt > 7:108477/1‑93 (MQ=255) ccTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTgaggt < 8:108477/93‑1 (MQ=255) tctcGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGAt > 6:322785/1‑91 (MQ=255) tctcGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGAt < 5:322785/91‑1 (MQ=255) tcGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCAt > 4:183019/1‑149 (MQ=255) gTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTc > 1:191045/1‑148 (MQ=255) ggTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTAGATGATGTCGt > 7:298411/1‑149 (MQ=255) tCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCg < 2:241698/149‑1 (MQ=255) tCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCg > 1:231565/1‑149 (MQ=255) cccGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCGCTGTc > 4:147004/1‑149 (MQ=255) cccGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCGCTGTc < 3:147004/149‑1 (MQ=255) ccgaagcACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCGCTGTcc < 7:306057‑M2/142‑1 (MQ=255) ccgaagcACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCGCTGTcc > 7:341535‑M2/8‑149 (MQ=255) ccgaagcACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCGCTGTcc < 8:341535‑M2/142‑1 (MQ=255) gaagcACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCCCTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCGCTGTCCg > 1:298852‑M2/6‑148 (MQ=255) | AGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCTGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTCGGTGACGATGGTGGCCATTTCGATGATGACGTCGCTGTCCG > NC_002947/5572421‑5572709 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |